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基因克隆載體ppt課件(2)-資料下載頁

2025-05-04 22:05本頁面
  

【正文】 改造的猴腎病毒 SV40 痘苗病毒 皰疹病毒 昆蟲桿狀病毒 應(yīng)用動(dòng)物病毒弱毒或無毒株 : (四)考斯質(zhì)粒與噬菌粒 ?DNA和 M13DNA載體的最大裝載量分別為 25kb和 , 但很多情況下 , 往往需要克隆更大的外源 DNA片段 。 考斯質(zhì)粒和噬菌粒的構(gòu)建就是為了進(jìn)一步提高噬菌體 DNA的裝載量。 構(gòu)建考斯質(zhì)粒和噬菌粒載體的思路 。 在包裝上限固定的條件下 , 大幅度縮短噬菌體 DNA的長度 , 就能同步增加載體的裝載能力 。 將 噬菌體 DNA包裝有關(guān)序列 與 質(zhì)粒 組裝在一起 , 既能縮短載體長度 、 提高裝載量 , 又能保證重組 DNA在體外仍被包裝成有感染性的顆粒 。 由于考斯質(zhì)粒和噬菌粒 不攜帶包裝蛋白基因 , 因此重組 DNA分子在細(xì)胞內(nèi)不能形成噬菌體顆粒 。 考斯質(zhì)粒( Cosmid) cos pHC79 kb Tetr 包裝相關(guān)序列 ori Ampr Pst I BamH I Sal I 1978年, & 發(fā)明構(gòu)建 考斯質(zhì)粒: 是一類人工構(gòu)建的含有 ?DNA的 cos序列 、 包裝相關(guān)序列 + pBR322質(zhì)粒的復(fù)制子 、克隆位點(diǎn) 、 標(biāo)記基因的特殊類型載體; kb的 ?DNA片段 +pBR322片段; kb, 裝載范圍為 3145 kb。 cos site carrying plasmid; 考斯質(zhì)粒載體的特點(diǎn): 能像 ?DNA那樣進(jìn)行體外包裝,并高效轉(zhuǎn)染 ; 裝載量大( 45 kb) ; 能像質(zhì)粒那樣在 ; 制備與質(zhì)粒相同, 重組操作簡便,篩選容易 ; 與 ?DNA不同:不能體內(nèi)包裝,不裂解 。 Cosmid克隆的過程 用 CIP去除線性載體的 5’P, 可防止載體自連 。 ? 噬菌粒( phagemid) 是一類人工構(gòu)建的含 單鏈?zhǔn)删w 包裝序列 、 復(fù)制子和 質(zhì)粒 復(fù)制子 、 克隆位點(diǎn) 、標(biāo)記基因的特殊類型載體 。 噬菌粒的特點(diǎn): 能像 M13DNA那樣體外包裝,并高效轉(zhuǎn)染 ; 裝載量比 M13mp系列大得多 ( 10 kb) ; 能像質(zhì)粒那樣在 ; 重組操作簡便,篩選容易。 通過克隆雙鏈 DNA,能獲得同等長度的單一單鏈DNA; 重要的噬菌粒載體 pUC118/119 = pUC18/19的 ori、 Ampr、 lacZ’、 MCS + M13IG、 ori 3200 bp MCS lacZ’ lacI ori Ampr M13IG pUC118/119 pUC118/119: 1)雙鏈質(zhì)粒復(fù)制模式 在宿主細(xì)胞沒有感染上 M13輔助噬菌體時(shí) , 受 pUC本身的復(fù)制起點(diǎn)控制 , 每個(gè)細(xì)胞能達(dá) 500個(gè)拷貝 。 500 個(gè)拷貝 2)單鏈?zhǔn)删w滾環(huán)復(fù)制模式 當(dāng)宿主細(xì)胞被 M13輔助噬菌體感染后 ,受 M13的復(fù)制起點(diǎn)控制 , 按單鏈?zhǔn)删w滾環(huán)復(fù)制模式復(fù)制 。 表示 M13輔助噬菌體 DNA 輔助噬菌體: 自身 ori突變 、 復(fù)制效率低 , 但感染宿主細(xì)胞后 , 能表達(dá)出外殼蛋白和復(fù)制蛋白 , 幫助噬菌粒載體復(fù)制 , 如 M13K07。 表示 M13輔助噬菌體 DNA 3)噬菌粒載體的包裝 高效復(fù)制的噬菌粒單鏈 DNA被包裝成噬菌體顆粒,被擠出宿主細(xì)胞外。 表示 M13輔助噬菌體 DNA 人工染色體載體 人類 、 動(dòng)物 、 植物的全基因組序列分析需克隆數(shù)百甚至上千 kb DNA片段 , 此時(shí)考斯質(zhì)粒和噬菌粒載體的裝載量遠(yuǎn)不能滿足需要 。 細(xì)菌人工染色體 酵母人工染色體 將 細(xì)菌 接合因子或 酵母 染色體的復(fù)制區(qū) 、分配區(qū) 、 穩(wěn)定區(qū)與 質(zhì)粒 組裝在一起 , 即構(gòu)成 人工染色體載體 (artificial chromosome)。 當(dāng)大片段外源 DNA克隆在人工染色體載體上 , 便形成重組人工染色體 , 它能像天然染色體那樣 , 在受體細(xì)胞中穩(wěn)定復(fù)制并遺傳 。 細(xì)菌人工染色體 ( bacterial artificial chromosome, BAC) 1992年 , F質(zhì)粒的基礎(chǔ)上構(gòu)建的 , 裝載量 50300kb; BAC在 單一拷貝 。 裝載量大,為 300 kb; BAC的特點(diǎn): 單拷貝復(fù)制; 可以像提取質(zhì)粒一樣直接提取克隆的 DNA。 在細(xì)菌細(xì)胞中擴(kuò)增; CMR:氯霉素抗性基因; parA、 parB:控制拷貝數(shù); oriS、 repE:復(fù)制起點(diǎn),控制質(zhì)粒單向復(fù)制; oriS、 repE、 parA、 parB來自性因子; Not I:用于切下外源 DNA。 Hind III和 BamH I:克隆位點(diǎn); BAC的組成: BAC主要適用于: 克隆大型基因簇( gene cluster) ; 構(gòu)建動(dòng)植物基因文庫( gene library or gene bank)。 酵母人工染色體 ( yeast artificial chromosome, YAC) 1983年, ; 1987年, 。 按染色體結(jié)構(gòu)構(gòu)建; 特點(diǎn): 在酵母細(xì)胞中擴(kuò)增。 裝載量大,為 350400kb; 染色體復(fù)制和遺傳的三個(gè)基本組件: DNA復(fù)制起始點(diǎn)( ori) 著絲粒( centromere) 兩個(gè)端粒( telomeres) YAC載體應(yīng)含有下列元件: 酵母染色體的復(fù)制起點(diǎn) ARS 酵母染色體的著絲粒 CEN4 酵母染色體的端粒 TEL 酵母篩選標(biāo)記 TRP1 酵母篩選標(biāo)記 URA3 ori Ampr CEN4 pYAC4 EcoR I URA3 TEL BamH I TEL ori Ampr TRP1 ARS1 TRP1: 色氨酸生物合成基因 URA3: 尿嘧啶生物合成基因 YAC載體的使用: pYAC4 CEN EcoR I URA TEL BamH I TEL ori Ampr TRP ARS EcoR I EcoR I EcoR I BamH I 連接 轉(zhuǎn)化酵母菌 重組酵母染色體 幾種載體的最大裝載量: 15 kb 25 kb 45 kb 300 kb 400 kb plasmid ?DNA Cosmid BAC YAC 構(gòu)建其 cDNA文庫: 構(gòu)建其基因組文庫: 構(gòu)建動(dòng)、植物和人類大型基因組文庫: 絕大多數(shù)真核生物 mRNA 10 kb: 載體常選 ?DNA、 Cosmid; 載體選 plasmid; 載體選 BAC或 YAC。
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