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基因克隆載體ppt課件(2)-文庫吧在線文庫

2025-06-06 22:05上一頁面

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【正文】 ?噬菌體感染 , 除能裂解細(xì)胞( 溶菌狀態(tài) ) 外 , 還能將其 DNA整合到宿主細(xì)胞染色體 DNA上 , 而不產(chǎn)生子代噬菌體顆粒 , 即 溶源狀態(tài) 。 ?DNA載體的構(gòu)建 野生型 ?噬菌體 能包裝原 ?DNA長度的75105%( 3751kb) , 本身長度為 , 只有當(dāng)插入的外源 DNA片段 ≤ , 才能被包裝成有感染力的噬菌體顆粒 。 甲基化酶處理、定點(diǎn)突變。 基因工程實(shí)驗(yàn)中使用的受體是具有 琥珀型突變體校正功能 的菌株 。 ?DNA的分離純化 將 加入 ?噬菌體懸浮液, 37℃ 培養(yǎng) 1hr 用新鮮培養(yǎng)基稀釋,繼續(xù)培養(yǎng) 412hr (噬菌體顆粒密度達(dá) 10131014/L, ) 超速離心,沉淀噬菌體 酚抽提,釋放 ?DNA 乙醇或異丙醇沉淀 ?DNA ?DNA作為載體的特點(diǎn): 可在體外包裝成噬菌體顆粒,高效感染 ; 裝載容量大,最大 25 kb; 篩選方便; 提取比質(zhì)粒簡便; 適合外源基因的克隆和擴(kuò)增,但不適合其表達(dá)。 常用的動物病毒載體 腺病毒 腺相關(guān)病毒 逆轉(zhuǎn)錄病毒 慢病毒 改造的猴腎病毒 SV40 痘苗病毒 皰疹病毒 昆蟲桿狀病毒 應(yīng)用動物病毒弱毒或無毒株 : (四)考斯質(zhì)粒與噬菌粒 ?DNA和 M13DNA載體的最大裝載量分別為 25kb和 , 但很多情況下 , 往往需要克隆更大的外源 DNA片段 。 Cosmid克隆的過程 用 CIP去除線性載體的 5’P, 可防止載體自連 。 細(xì)菌人工染色體 酵母人工染色體 將 細(xì)菌 接合因子或 酵母 染色體的復(fù)制區(qū) 、分配區(qū) 、 穩(wěn)定區(qū)與 質(zhì)粒 組裝在一起 , 即構(gòu)成 人工染色體載體 (artificial chromosome)。 裝載量大,為 350400kb; 染色體復(fù)制和遺傳的三個(gè)基本組件: DNA復(fù)制起始點(diǎn)( ori) 著絲粒( centromere) 兩個(gè)端粒( telomeres) YAC載體應(yīng)含有下列元件: 酵母染色體的復(fù)制起點(diǎn) ARS 酵母染色體的著絲粒 CEN4 酵母染色體的端粒 TEL 酵母篩選標(biāo)記 TRP1 酵母篩選標(biāo)記 URA3 ori Ampr CEN4 pYAC4 EcoR I URA3 TEL BamH I TEL ori Ampr TRP1 ARS1 TRP1: 色氨酸生物合成基因 URA3: 尿嘧啶生物合成基因 YAC載體的使用: pYAC4 CEN EcoR I URA TEL BamH I TEL ori Ampr TRP ARS EcoR I EcoR I EcoR I BamH I 連接 轉(zhuǎn)化酵母菌 重組酵母染色體 幾種載體的最大裝載量: 15 kb 25 kb 45 kb 300 kb 400 kb plasmid ?DNA Cosmid BAC YAC 構(gòu)建其 cDNA文庫: 構(gòu)建其基因組文庫: 構(gòu)建動、植物和人類大型基因組文庫: 絕大多數(shù)真核生物 mRNA 10 kb: 載體常選 ?DNA、 Cosmid; 載體選 plasmid; 載體選 BAC或 YAC。 在細(xì)菌細(xì)胞中擴(kuò)增; CMR:氯霉素抗性基因; parA、 parB:控制拷貝數(shù); oriS、 repE:復(fù)制起點(diǎn),控制質(zhì)粒單向復(fù)制; oriS、 repE、 parA、 parB來自性因子; Not I:用于切下外源 DNA。 500 個(gè)拷貝 2)單鏈?zhǔn)删w滾環(huán)復(fù)制模式 當(dāng)宿主細(xì)胞被 M13輔助噬菌體感染后 ,受 M13的復(fù)制起點(diǎn)控制 , 按單鏈?zhǔn)删w滾環(huán)復(fù)制模式復(fù)制 。 將 噬菌體 DNA包裝有關(guān)序列 與 質(zhì)粒 組裝在一起 , 既能縮短載體長度 、 提高裝載量 , 又能保證重組 DNA在體外仍被包裝成有感染性的顆粒 。 該區(qū)存在 M13的 ori, 插入外源 DNA而不影響M13噬菌體的活力 , 可作為克隆區(qū) 。 重組 ?DNA的體外包裝 用于體外包裝的蛋白可直接從感染 ?噬菌體的 , 已商品化 , 通常為互補(bǔ)的兩部分:一部分 缺少 E組份 , 另一部分 缺少 D組份 。 噬菌體感染細(xì)菌形成的噬菌斑 空載體 ?DNA產(chǎn)生藍(lán)色透明斑; 顏色反應(yīng)類標(biāo)記: lacZ lacZ基因編碼 ?半乳糖苷酶 ,在 IPTG誘導(dǎo)下 , 能催化無色底物 Xgal生成藍(lán)色化合物 。 體外包裝 插入位點(diǎn) 載體長度: 37 kb 體外包裝 插入片段 插入片段: 014 kb 插入型載體 (insertion vectors): 取代型載體 (substitution vectors): 載體長度: 26 kb 體外包裝 插入片段 插入片段: 1125 kb 含某一限制酶的兩個(gè)切點(diǎn) , 兩切點(diǎn)間的片段(可置換區(qū) )可被外源 DNA替代 , 如 ?MBL系列 。 可根據(jù)需要 , 改變 ?DNA或宿主細(xì)胞的性質(zhì) , 使噬菌體或處于溶菌狀態(tài) , 或處于溶源狀態(tài) 。 溶菌周期: 吸附 LamB受體 注入 復(fù)制 包裝 裂解 感染細(xì)菌后 , 立即在菌體內(nèi)復(fù)制和合成蛋白質(zhì)外殼 , 重新組裝成噬菌體顆粒 , 并導(dǎo)致細(xì)菌細(xì)胞裂解 , 釋放出大量子代噬菌體 。 (三)噬菌體或病毒 DNA 噬菌體 (bacteriophage)或病毒 (virus)是一類非細(xì)胞微生物 , 能 高效率高特異性 地侵染宿主細(xì)胞 , 然后或 自主復(fù)制繁殖 , 或整合入宿主基因組中潛伏起來 , 而且在一定條件下這兩種狀態(tài)會相互轉(zhuǎn)化 。 克隆的外源基因可不用更換載體、直接從一種受體菌轉(zhuǎn)入另一種受體菌中復(fù)制并遺傳。 溫敏質(zhì)粒: 即溫度敏感型復(fù)制控制質(zhì)粒,在不同溫度 下表現(xiàn)出拷貝數(shù)、整合等不同性質(zhì)。 實(shí)驗(yàn)室用質(zhì)粒多以少數(shù)幾個(gè)野生型質(zhì)粒為基礎(chǔ)構(gòu)建: pSC101: ,拷貝數(shù) 5,四環(huán)素抗性基因 Tetr。 1) 刪除不必要的 DNA區(qū)域 , 滅活對質(zhì)粒復(fù)制產(chǎn)生負(fù)調(diào)控效應(yīng)的基因 ,提高質(zhì)粒的 拷貝數(shù) 。 按分子量大小: 15kb,多為接合型質(zhì)粒; 15kb,多為非接合型質(zhì)粒。 攜帶特殊的遺傳標(biāo)記 這些標(biāo)記基因?qū)χ亟M DNA篩選 有重要意義 。 兩種含 相似 復(fù)制子結(jié)構(gòu)的不同質(zhì)粒 , 在復(fù)制時(shí)受同一拷貝數(shù)控制系統(tǒng)的干擾 , 致使兩種質(zhì)粒的最終拷貝數(shù)不同 , 其中拷貝數(shù)多的質(zhì)粒在以后
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