蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)原理(1)-資料下載頁(yè)
2025-08-16 02:11本頁(yè)面
【正文】 形成了許多的氫鍵，各種相互作用造成更多的的復(fù)雜性 由相應(yīng)二級(jí)結(jié)構(gòu)通過(guò)轉(zhuǎn)角或連接而組合成為聚合體，聚合體結(jié)構(gòu)內(nèi)成分間存在著特定的相互作用 多肽鏈中一級(jí)順序相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)，在三維空間相近，形成有規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)聚合體，往往充作空間構(gòu)象的建筑塊，如（ αα），（ βββ），（ β α β ）等 超二級(jí)結(jié)構(gòu)的手性特征 結(jié)構(gòu)域 可看成超二級(jí)結(jié)構(gòu)單元的組合。蛋白質(zhì)分子中某些特定的區(qū)域，在結(jié)構(gòu)與功能兩個(gè)方面有著特征性意義。 有別于蛋白質(zhì)其它區(qū)域 結(jié)構(gòu)有相對(duì)的完整或獨(dú)立性 功能也有著特征性標(biāo)志 在某些條件下，它們可被分離。從 DNA→RNA→蛋白質(zhì)法則中，基因在 DNA 序列上被內(nèi)含子分隔成一段段的外顯子，許多蛋白質(zhì)分子中發(fā)現(xiàn)這些外顯子對(duì)應(yīng)的即蛋白質(zhì)分子中的結(jié)構(gòu)域部分 免疫球蛋白的 2個(gè)重鏈和 2個(gè)輕鏈，可區(qū)別為 12個(gè)結(jié)構(gòu)域；肌動(dòng)蛋白分子的馬達(dá)結(jié)構(gòu)域；細(xì)胞色素 b5可分為血紅素結(jié)合部分與膜結(jié)合部分兩個(gè)結(jié)構(gòu)域等 三 .蛋白質(zhì)分子的三級(jí)結(jié)構(gòu) 三級(jí)結(jié)構(gòu) 即蛋白質(zhì)分子多肽鏈的 3維空間構(gòu)象 在 X線(xiàn)衍射分析中，從蛋白質(zhì)晶體的不對(duì)稱(chēng)單元的二維電子密度截面的堆積，可得到三維的電子密度分布，這種由計(jì)算機(jī)輸出的三維電子密度分布，包含著蛋白質(zhì)分子的 3級(jí)結(jié)構(gòu)的全部?jī)?nèi)容，并用能夠從一個(gè)側(cè)面強(qiáng)調(diào)構(gòu)象特征的一些圖形表示出來(lái)。 空間填滿(mǎn)圖形 包含所有原子（大多數(shù)可省略 H原子）、顯示外觀整體表象復(fù)雜結(jié)構(gòu)，可以讓人想象出空間構(gòu)象，包括它可能的動(dòng)態(tài)構(gòu)象變化。 線(xiàn)段抽象圖形 基于填滿(mǎn)圖形上的簡(jiǎn)化，用線(xiàn)段描述主鏈走向，更抽象些，常突出某些部分，如 α碳原子、結(jié)合的重金屬原子等。 卡通圖形 更為常見(jiàn)的一種圖形，通常突出某些部分的結(jié)構(gòu)，如 α螺旋、 β折疊、扭曲彎折 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)給出的信息或內(nèi)容 多肽鏈骨架所有的二級(jí)結(jié)構(gòu)情況 類(lèi)型 出現(xiàn)百分?jǐn)?shù) 空間相對(duì)排列順序與位置關(guān)系 側(cè)鏈殘基在蛋白質(zhì)深部與表面的分布規(guī)律 空間 3維的排列與分布 三級(jí)結(jié)構(gòu) 4方面特征規(guī)律 ； ，并且 電荷的分布相間又常不均勻，以保證出現(xiàn)最大的相 互作用，一旦在分子內(nèi)部出現(xiàn)電荷便意味著是分子 功能發(fā)揮具重要意義的殘基 ； ， 這是疏水力驅(qū)使的必然結(jié)果 ； ，以 避免穩(wěn)定自由能的損失，包括表面上與水分子或溶 劑的氫鍵、蛋白質(zhì)分子內(nèi)部各極性基團(tuán)間的氫鍵、 和鄰近肽鏈骨架上基團(tuán)形成的氫鍵等 。 一個(gè)蛋白質(zhì)分子的三級(jí)結(jié)構(gòu)中若包含結(jié)構(gòu)域構(gòu)象，那么結(jié)構(gòu)域與結(jié)構(gòu)域之間相鄰部位必定是功能敏感區(qū)域。 四 .蛋白質(zhì)分子的四級(jí)結(jié)構(gòu) 四級(jí)結(jié)構(gòu)見(jiàn)于多條多肽鏈構(gòu)成的蛋白質(zhì)，用有特定三級(jí)結(jié)構(gòu)的亞單位表示相應(yīng)多肽鏈空間構(gòu)象。 三級(jí)結(jié)構(gòu)亞單位彼此在 3維空間中相對(duì)位置關(guān)系各亞單位多肽鏈間存在共價(jià)鍵或非共價(jià)鍵的連接 幾個(gè)亞單位形成的四級(jí)結(jié)構(gòu)也同樣符合三級(jí)結(jié)構(gòu)組成規(guī)律基本要求 Crystallographic structure of cdb3 14Fig 22 Structure of cdb3 dimer細(xì)胞色素氧化酶Imaging By Atomic Force Microscope (AFM)CaATPase 耐熱性()鄰苯二酚雙加氧酶
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