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蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)原理(1)(專業(yè)版)

2025-09-27 02:11上一頁面

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【正文】 有別于蛋白質(zhì)其它區(qū)域 結(jié)構(gòu)有相對的完整或獨立性 功能也有著特征性標志 在某些條件下,它們可被分離。 蛋白質(zhì)由氨基酸聚合而成 核酸由核苷酸聚合而成 多糖由單糖聚合而成 脂類,所有能被脂溶性溶劑提取的動植物組織部分均定義為脂類。蛋白質(zhì)分子多肽鏈經(jīng)常出現(xiàn) 180?的回折 ,此回折部分大多數(shù)是 β 轉(zhuǎn)角,也稱作 β 發(fā)夾結(jié)構(gòu)、 β 回轉(zhuǎn)等 4個連續(xù)殘基構(gòu)成的普通轉(zhuǎn)角和甘氨酸轉(zhuǎn)角 普通轉(zhuǎn)角 —— 4位 α 碳原子間形成氫鍵, 2位殘基屬α 螺旋構(gòu)象, 3位取 310構(gòu)象; 甘氨酸轉(zhuǎn)角 —— 2位殘基主鏈以二面角為 60、 120的聚脯氨酸構(gòu)象出現(xiàn), 3位上為左手 310構(gòu)象而只能是甘氨酸( φ 、 ψ 為 90、 0附近)。 線段抽象圖形 基于填滿圖形上的簡化,用線段描述主鏈走向,更抽象些,常突出某些部分,如 α碳原子、結(jié)合的重金屬原子等。 構(gòu)型( configuration)和構(gòu)像 (conformation) 顯然,構(gòu)型的改變,必需有 化學鍵的斷裂和手性的改變 ,例如氨基酸分子中,一個 C α原子和四個不同的原子或基團相連時,只能有兩種不同的空間結(jié)構(gòu),L型和 D型氨基酸,沒有共價健的斷裂,這兩種旋光異構(gòu)體是不能互相轉(zhuǎn)變的。 β 折疊結(jié)構(gòu)中 一般 610股 股平均長度為 6個殘基 整個結(jié)構(gòu)常呈扭曲,這種扭曲也具手性規(guī)律如圖 常用皺褶( pleat)、扭曲( twist)、 拱起( arch)、卷曲( curl) 多肽鏈主鏈骨架中,與有規(guī)則的右手 α 螺旋和 β 折疊結(jié)構(gòu)不同的構(gòu)象,都稱為無規(guī)則卷曲或無規(guī)線團、自由折疊等。 四 .蛋白質(zhì)分子的四級結(jié)構(gòu) 四級結(jié)構(gòu)見于多條多肽鏈構(gòu)成的蛋白質(zhì),用有特定三級結(jié)構(gòu)的亞單位表示相應多肽鏈空間構(gòu)象。 手性是生物界長期選擇和進化的結(jié)果,還不知原因。 L型的定義 :從 H 到 C? 看, 順時針依次為 C0, R, N 氨基酸的 構(gòu)象 黑色代表 C? 蛋白質(zhì)的多肽鏈是 20種氨基酸通過形成肽鍵而連接得到的 肽鍵或酰胺鍵平面上 6個原子 共平面 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu) ( primary) 肽平面上 Cα C鍵、 C— N 鍵和 NCα 鍵 構(gòu)成長肽鏈的骨架主鏈 ψ 、 ω、 φ 為這 3個鍵軸相應的旋轉(zhuǎn)角 規(guī)定由 4個原子 ABC— D 形成的二面角,沿B— C鍵軸俯視,順時針為正 相鄰肽單位形成的主鏈結(jié)構(gòu)中 3個鍵軸的旋轉(zhuǎn)二面角( ψ 、 ?、 φ ) 肽平面上 C— N鍵 鍵軸 的旋轉(zhuǎn)角 ω 鍵軸旋轉(zhuǎn)涉及 2個 Cα 原子的相對位置 剛性平面, ω僅有 2種可能 ω=0? 順式結(jié)構(gòu) ω=180? 反式結(jié)構(gòu) 反式結(jié)構(gòu)常見,順式存在空間位阻, ω=180o ω= 0o φ =180、 ψ =180,充分伸展的全反構(gòu)型 φ =0、 ψ =0,發(fā)生嚴重的 空間位阻, 不能使原子間距離接近甚至小于范德華半徑 由二面角決定多肽鏈的構(gòu)像 任何 1個 α 碳原子的( φ 、 ψ ) 二面角發(fā)生變化 ,多肽 主鏈骨架構(gòu)象 將產(chǎn)生相應 變化
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