生物信息學(xué)4733545076-資料下載頁
2025-04-04 23:37本頁面
【正文】 解與蛋白質(zhì)功能分析相關(guān)的數(shù)據(jù)庫，如：SwissProt蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、PDB結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫等。實驗原理：現(xiàn)有的蛋白質(zhì)功能分析工具和平臺都是根據(jù)已知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行注釋分析、總結(jié)結(jié)構(gòu)規(guī)律建立參考數(shù)據(jù)庫，并以此作為預(yù)測未知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的依據(jù)。實驗內(nèi)容：1. 熟悉與蛋白質(zhì)分析相關(guān)的數(shù)據(jù)庫資源，如SwissProt蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、PDB結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫、PROSITE；2. 利用PredictProtein對蛋白質(zhì)序列進行分析；3. 利用swissmodel對蛋白質(zhì)序列進行三維結(jié)構(gòu)預(yù)測。實驗報告：1. 闡述實驗步驟；2. 記錄實驗結(jié)果；3. 對實驗進行總結(jié)。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003； 。實驗八 perl程序的安裝、編寫、調(diào)試實驗?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生能在windows和Linux兩種平臺安裝perl解釋器、編寫perl程序以及debug和運行的能力，熟悉perl語言基本語法，學(xué)會熟練編寫和運用perl程序進行基礎(chǔ)生物信息學(xué)研究。實驗原理：Perl語言是一門通用的腳本語言，具有強大的字符串處理功能，是生物信息學(xué)研究的強大幫手，學(xué)會了perl語言，就能方便地處理生物信息學(xué)研究中遇到的各種字符串文本，促進研究的快速進行。實驗內(nèi)容：1. 下載perl程序在Windows和Linux下的安裝包并進行安裝；2. 編寫簡單的perl程序，并學(xué)會debug；3. 編寫具有簡單功能的堿基處理perl程序。實驗報告：1. perl解釋器安裝方法；2. perl解釋器debug方法；3. 討論：perl語言在生物信息學(xué)研究中所起到的積極作用。參考書目： 《PERL 編程24學(xué)時教程》 （美）皮爾斯著 王建華等譯，機械工業(yè)出版社， 2000； 《生物信息學(xué)手冊》 郝柏林 等著， 上?？萍汲霭嫔纾?2004； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 200310 / 10
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