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正文內(nèi)容

生物信息學(xué)4733545076(參考版)

2025-04-07 23:37本頁面
  

【正文】 參考書目: 《PERL 編程24學(xué)時教程》 (美)皮爾斯著 王建華等譯,機械工業(yè)出版社, 2000; 《生物信息學(xué)手冊》 郝柏林 等著, 上??萍汲霭嫔?, 2004; 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著, 浙江大學(xué)出版社, 200310 / 10。實驗內(nèi)容:1. 下載perl程序在Windows和Linux下的安裝包并進(jìn)行安裝;2. 編寫簡單的perl程序,并學(xué)會debug;3. 編寫具有簡單功能的堿基處理perl程序。實驗八 perl程序的安裝、編寫、調(diào)試實驗?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生能在windows和Linux兩種平臺安裝perl解釋器、編寫perl程序以及debug和運行的能力,熟悉perl語言基本語法,學(xué)會熟練編寫和運用perl程序進(jìn)行基礎(chǔ)生物信息學(xué)研究。參考書目: 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯, 北京大學(xué)出版社, 2002; 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著, 浙江大學(xué)出版社, 2003; 。實驗內(nèi)容:1. 熟悉與蛋白質(zhì)分析相關(guān)的數(shù)據(jù)庫資源,如SwissProt蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、PDB結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫、PROSITE;2. 利用PredictProtein對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析;3. 利用swissmodel對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行三維結(jié)構(gòu)預(yù)測。實驗七 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能分析實驗?zāi)康模赫莆盏鞍踪|(zhì)一級、二級和三級結(jié)構(gòu)分析的一些工具,了解與蛋白質(zhì)功能分析相關(guān)的數(shù)據(jù)庫,如:SwissProt蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫、PDB結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫等。實驗報告:1. 實驗各步驟使用的數(shù)據(jù)、運算平臺、結(jié)果文件記錄;2. 討論:如何應(yīng)用命令行生成腳本文件來完成大批量工作。Rasmol除了圖形界面中的一些功能外,該程序的命令行方式有著很強大的功能。實驗蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析軟件——Rasmol 實驗?zāi)康模菏煜さ鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)分析軟件RasMol ,了解RasMol ,能夠根據(jù)實驗需要為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同區(qū)域畫出不同顏色。最后設(shè)計已知全長基因序列的PCR擴(kuò)增引物。實驗原理:PCR實驗是當(dāng)代分子生物學(xué)的基本實驗之一,由于目標(biāo)序列和實驗
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