生物信息學實驗(參考版)
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【正文】 6 / 6。主要強調利用各種公用的生物信息學資源進行上機實習過程的學習。 Sons, Inc., Publication. 2004[2]Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis》. D. W. Mount. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001網上公共資源：[1]NCBI (Human) 網站：[2]UCSC (Human) 網站：[3]Ensembl (Human) 網站：[4]PubMed網站：[5]UniProt網站：[6]InterPro網站：[7]Gene Ontology網站：[8]Pfam網站：本地化數(shù)據庫資源：[1]Ensembl 本地化數(shù)據庫：[2]SPIDer本地化數(shù)據庫：教學課件：[1]Bioinformatics_Experiment_01_Genomic [2][3]Bioinformatics_Experiment_03_Genetic [4][5][6],[7][8]四、先修課要求及教學策略與方法建議先修課要求：計算機基本操作、生物化學或分子生物學（對基因組知識有一定的了解）。同時，學生可以在論壇中（專門為生物信息學試驗課設計的）發(fā)表自己的見解、交流學習心得。其它教學環(huán)節(jié)：實驗課剛開始，授課老師結合ppt，講授本次實驗課的主要內容，并布置本次實驗作業(yè)。重點：學會PSIBLAST的在線使用，和Pfam數(shù)據庫的檢索。掌握（1）PSIBLAST的在線使用，包括輸入，結果分析。(2)與BLAST相比，PSIBLAST有哪些特點。實驗八、PSIBLAST And HMMER 4學時 基礎性主要內容：PSIBLAST（PositionSpecific Iterated BLAST）,HMMER（Biosequence analysisi using profile hidden markov models）,Pfam教學要求：了解什么是PSIBLAST,HMMER,都分別有哪些應用。在實驗過程中，授課老師提議同一個小組的學生一起討論，有問題向授課老師或助教提問。難點：分析ClustalW/X的結果，并理解構建出來的系統(tǒng)發(fā)育樹。掌握如何使用ClustalW/X軟件，包括
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