生物信息學(xué)軟件介紹(參考版)
2025-01-19 11:18本頁面
【正文】 如 Alignment (同源性分析 ) 推薦軟件 ? 相似性分析 ? Peptool Lite ? 同源性分析 – Vector NTI 6AlignX ? Contig ExpressDNA 序列 片斷拼接 Vector NTI Suit 同源比較 —主窗口 Vector NTI Suit 同源比較 —進化樹 DNA 模擬電泳 一點體會 ? DNA模擬電泳具有一定實驗預(yù)示功能， ? 模擬電泳不能作為實驗結(jié)果或依據(jù) Vector NTI Suit 模擬電泳 Gene Construction Kit 模擬電泳 重要生物數(shù)據(jù)庫簡介 三大數(shù)據(jù)庫 ? NCBI (美國 ) ? DDBJ (日本 ) ? EBI (歐洲 ) 其他重要數(shù)據(jù)庫 ? 酵母基因組數(shù)據(jù)庫（ SGD） ? 酵母蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫（ YPD） ? 擬南芥數(shù)據(jù)庫（ AtDB） ? 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫（ OMIM） ? 線蟲數(shù)據(jù)庫（ ACEDB） 四 . 生物信息學(xué)服務(wù) 服務(wù)內(nèi)容 1. PCR引物 、 測序引物及雜交探針的設(shè)計及評價 2. DNA， 蛋白質(zhì)序列同源分析及進化樹構(gòu)建 3. 生物大分子二級結(jié)構(gòu)模擬顯示及基本序列分析 4. 有關(guān)蛋白質(zhì)親疏水性 ， 等電點 ， 抗原性 ，跨膜蛋白 ， 信號肽等分析以及 Dot Plot服務(wù) 5. 質(zhì)粒載體構(gòu)建及克隆策略 6. 小型數(shù)據(jù)庫建設(shè)及協(xié)助實驗室進行數(shù)據(jù)管理維護 四 . 生物信息學(xué)服務(wù) 服務(wù)內(nèi)容 7. 醫(yī)學(xué)相關(guān)的圖像 、 病例統(tǒng)計 、 分析及小型數(shù)據(jù)庫建設(shè) 8. 網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫應(yīng)用輔助：包括序列拉長（ 擴大實驗成果 ） ， Blastn/Blastp，NCBI Entrez查詢 (多維查詢 )， 新序列 、snip等申報 9. 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)初步預(yù)測（此為生物信息學(xué)目前研發(fā)的焦點，正在探索中，結(jié)果可能不十分準(zhǔn)確或者不能出結(jié)果） 服務(wù)內(nèi)容 ?？蛇M行自身局部比較。 ? 對引物的修飾一般是增加酶切位點，應(yīng)參考載體的限制酶識別序列確定，常常對上下游引物修飾的序列選用不同限制酶的識別序列，以有利于以后的工作。 引物設(shè)計要
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