生物信息學(xué)4733545076-閱讀頁
2025-04-19 23:37本頁面
【正文】 imer 實驗?zāi)康模菏煜CR引物設(shè)計工具Primer ，能夠根據(jù)實驗需要選擇相應(yīng)的引物設(shè)計方法設(shè)計PCR引物。本實驗延續(xù)ESTs分析結(jié)果，對于其中需要獲得全長的基因進行RACE引物的設(shè)計，及5’和3’RACE引物，配合接頭序列設(shè)計單向引物，并模擬練習(xí)通過連接獲得全長的基因CDS序列。實驗內(nèi)容：1. 從網(wǎng)站下載并安裝Primer ；2. 從 GenBank 中任意獲取一個 DNA 序列，設(shè)計出該序列的合適引物；實驗報告：1. 實驗各步驟使用的數(shù)據(jù)、運算平臺、結(jié)果文件記錄；2. 比較不同引物設(shè)計平臺和不同PCR實驗的差別；參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003 。實驗原理：目前在結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域有許多圖形顯示的程序，每個都有自己不同的特點。Rasmol（）程序有多種版本，有unix, windows, Mac等實驗內(nèi)容：1. ；2. 在PDB網(wǎng)站下載感興趣的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)文件；3. 在Windows用Rasmol打開這個文件；4. 按照要求，找出感興趣的區(qū)域如保守區(qū)等，用特殊顏色標(biāo)出。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003 。實驗原理：現(xiàn)有的蛋白質(zhì)功能分析工具和平臺都是根據(jù)已知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行注釋分析、總結(jié)結(jié)構(gòu)規(guī)律建立參考數(shù)據(jù)庫，并以此作為預(yù)測未知蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的依據(jù)。實驗報告：1. 闡述實驗步驟；2. 記錄實驗結(jié)果；3. 對實驗進行總結(jié)。實驗原理：Perl語言是一門通用的腳本語言，具有強大的字符串處理功能，是生物信息學(xué)研究的強大幫手，學(xué)會了perl語言，就能方便地處理生物信息學(xué)研究中遇到的各種字符串文本，促進研究的快速進行。實驗報告：1. perl解釋器安裝方法；2. perl解釋器debug方法；3. 討論：perl語言在生物信息學(xué)研究中所起到的積
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