生物信息學(xué)4733545076(存儲(chǔ)版)
【正文】 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《基因表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）數(shù)據(jù)分析手冊(cè)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2005。Rasmol除了圖形界面中的一些功能外，該程序的命令行方式有著很強(qiáng)大的功能。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003； 。參考書目： 《PERL 編程24學(xué)時(shí)教程》 （美）皮爾斯著 王建華等譯，機(jī)械工業(yè)出版社， 2000； 《生物信息學(xué)手冊(cè)》 郝柏林 等著， 上?？萍汲霭嫔?， 2004； 《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 200310 / 10。實(shí)驗(yàn)內(nèi)容：1. 熟悉與蛋白質(zhì)分析相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)資源，如SwissProt蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)、PDB結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)、PROSITE；2. 利用PredictProtein對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析；3. 利用swissmodel對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。實(shí)驗(yàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析軟件——Rasmol 實(shí)驗(yàn)?zāi)康模菏煜さ鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)分析軟件RasMol ，了解RasMol ，能夠根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同區(qū)域畫出不同顏色。2. 使用CodonCode Aligner程序里的Clip Ends, Trim Vector, Assemble等功能，完成序列的剪切、去雜質(zhì)、組裝工作。在系統(tǒng)樹圖繪制完以后，輸入的所有序列按照得分高低被分成n1個(gè)組，然后再對(duì)組與組之間進(jìn)行聯(lián)配，這一步用Myers和Miller算法實(shí)現(xiàn)。實(shí)驗(yàn)二 利用BLAST進(jìn)行序列比對(duì)實(shí)驗(yàn)?zāi)康模毫私釨LAST及其子程序的原理和基本參數(shù)，熟練地應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)和Linux計(jì)算平臺(tái)進(jìn)行本地BLAST序列比對(duì)，熟悉BLAST結(jié)果的格式和內(nèi)容并能描述其主要意義，同時(shí)比較網(wǎng)上平臺(tái)和本地平臺(tái)的優(yōu)缺點(diǎn)。生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室將提供系統(tǒng)的保障，包括采用mail服務(wù)器和linux帳號(hào)管理等進(jìn)行實(shí)驗(yàn)過程管理和支持。本實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)書中的8個(gè)實(shí)驗(yàn)均設(shè)計(jì)為綜合性開發(fā)實(shí)驗(yàn)，
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