生物信息學4733545076(專業(yè)版)
【正文】 實驗報告：1. 闡述實驗步驟；2. 記錄實驗結果；3. 對實驗進行總結。實驗報告：1. 實驗各步驟記錄和中間結果文件；2. 舉例簡要說明結果文件中數(shù)據(jù)的生物學意義。實驗原理：利用實驗一下載的核算和蛋白質(zhì)序列，提交到NCBI或者其他擁有BLAST運算平臺的網(wǎng)頁上，觀察其基本參數(shù)設定庫文件類型，并得到計算結果；同時在本地服務器上學會用formatdb格式化庫文件，并輸入BLAST命令進行計算，獲得結果文件。生物信息學作為新型交叉應用學科，可以依托本校已有的計算機科學、信息學、生物學和數(shù)學等學科優(yōu)勢，充分展現(xiàn)投入少、見效快、起點高的特色，推動學校學科建設和本科教學水平。實驗原理：首先對于輸入的每一條序列，兩兩之間進行聯(lián)配，總共進行n*（n1）/2次聯(lián)配，這一步通過一種快速的近似算法實現(xiàn)，其得分用來計算指導樹，系統(tǒng)樹圖能用于指導后面進行的多序列聯(lián)配的過程。最后設計已知全長基因序列的PCR擴增引物。實驗內(nèi)容：1. 下載perl程序在Windows和Linux下的安裝包并進行安裝；2. 編寫簡單的perl程序，并學會debug；3. 編寫具有簡單功能的堿基處理perl程序。實驗報告：1. 實驗各步驟使用的數(shù)據(jù)、運算平臺、結果文件記錄；2. 討論：如何應用命令行生成腳本文件來完成大批量工作。實驗四 ESTS分析實驗目的：熟悉使用一系列生物信息學分析工具對測序得到ESTs序列數(shù)據(jù)進行聚類處理，由此對獲得表達基因的豐度等相關信息，并且對這些表達基因進行功能的初步詮釋，為后續(xù)實驗通過設計RACE引物獲得全長基因，以及進一步的功能注釋和代謝途徑分析做好準備。實驗原理：利用互聯(lián)網(wǎng)資源檢索相關的國內(nèi)外生物信息學相關網(wǎng)站，如：NCBI、SANGER、TIGR、KEGG、SWISSPORT、Ensemble、中科院北京基因組研究所、北大生物信息學中心等，下載其中相關的數(shù)據(jù)，如fasta、genbank格式的核算和蛋白質(zhì)序列、pathway等數(shù)據(jù)，理解其重要的生物學意義。實驗一 熟悉生物信息學網(wǎng)站及其數(shù)據(jù)的生物學意義實驗目的：培養(yǎng)學生利用互聯(lián)網(wǎng)資源獲取生物信息學研究前沿和
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