生物信息學4733545076(已修改)
2025-04-16 23:37 本頁面
【正文】 生物信息學是上世紀90年代初人類基因組計劃(HGP)依賴，隨著基因組學、蛋白組學等新興學科的建立，逐漸發(fā)展起來的生物學、數(shù)學和計算機信息科學的一門交叉應(yīng)用學科。目前生物信息學的研究領(lǐng)域主要包括基于生物序列數(shù)據(jù)的整理和注釋、生物信息挖掘工具開發(fā)及利用這些工具揭示生物學基礎(chǔ)理論知識等領(lǐng)域。生物信息學作為新型交叉應(yīng)用學科，可以依托本校已有的計算機科學、信息學、生物學和數(shù)學等學科優(yōu)勢，充分展現(xiàn)投入少、見效快、起點高的特色，推動學校學科建設(shè)和本科教學水平。本實驗指導(dǎo)書中的8個實驗均設(shè)計為綜合性開發(fā)實驗，面向生物信息學院全體本科學生和研究生，以及全校對生物信息學感興趣的其他專業(yè)學生開放。生物信息學實驗室將提供系統(tǒng)的保障，包括采用mail服務(wù)器和linux帳號管理等進行實驗過程管理和支持。限選《生物信息學及實驗》的生物技術(shù)專業(yè)本科生至少選擇其中5個實驗，并不少于8個學時。其他選修者按照課時和學校相關(guān)規(guī)定計算創(chuàng)新學分。實驗一 熟悉生物信息學網(wǎng)站及其數(shù)據(jù)的生物學意義實驗?zāi)康模号囵B(yǎng)學生利用互聯(lián)網(wǎng)資源獲取生物信息學研究前沿和相關(guān)數(shù)據(jù)的能力，熟悉生物信息學相關(guān)的一些重要國內(nèi)外網(wǎng)站，及其核酸序列、蛋白質(zhì)序列及代謝途徑等功能相關(guān)數(shù)據(jù)庫，學會下載生物相關(guān)的信息數(shù)據(jù)，了解不同的數(shù)據(jù)文件格式和其中重要的生物學意義。實驗原理：利用互聯(lián)網(wǎng)資源檢索相關(guān)的國內(nèi)外生物信息學相關(guān)網(wǎng)站，如：NCBI、SANGER、TIGR、KEGG、SWISSPORT、Ensemble、中科院北京基因組研究所、北大生物信息學中心等，下載其中相關(guān)的數(shù)據(jù)，如fasta、genbank格式的核算和蛋白質(zhì)序列、pathway等數(shù)據(jù)，理解其重要的生物學意義。實驗內(nèi)容：1. 瀏覽和搜索至少10個國外和至少5個國內(nèi)生物信息學相關(guān)網(wǎng)站，并描述網(wǎng)站特征；2. 下載各網(wǎng)站的代表性數(shù)據(jù)各10條（組）以上，并說明其生物學意義；3. 討論各網(wǎng)站適合做何種生物信息學研究的平臺，并設(shè)計一個研究設(shè)想。實驗報告：1. 各網(wǎng)站網(wǎng)址及特征描述；2. 代表性數(shù)據(jù)的下載和生物學意義的描述；3. 討論：這些生物信息學相關(guān)網(wǎng)站的信息資源，可以被那些生物信息學研究所利用。參考書目： 《生
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