生物信息學(xué)4733545076(完整版)
【正文】 . 闡述BLAST原理和比對步驟；2. 不同類型BLAST的結(jié)果及其說明；3. 討論：不同平臺運行BLAST的需求比較。實驗一 熟悉生物信息學(xué)網(wǎng)站及其數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義實驗?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生利用互聯(lián)網(wǎng)資源獲取生物信息學(xué)研究前沿和相關(guān)數(shù)據(jù)的能力，熟悉生物信息學(xué)相關(guān)的一些重要國內(nèi)外網(wǎng)站，及其核酸序列、蛋白質(zhì)序列及代謝途徑等功能相關(guān)數(shù)據(jù)庫，學(xué)會下載生物相關(guān)的信息數(shù)據(jù)，了解不同的數(shù)據(jù)文件格式和其中重要的生物學(xué)意義。生物信息學(xué)是上世紀(jì)90年代初人類基因組計劃(HGP)依賴，隨著基因組學(xué)、蛋白組學(xué)等新興學(xué)科的建立，逐漸發(fā)展起來的生物學(xué)、數(shù)學(xué)和計算機信息科學(xué)的一門交叉應(yīng)用學(xué)科。實驗原理：利用互聯(lián)網(wǎng)資源檢索相關(guān)的國內(nèi)外生物信息學(xué)相關(guān)網(wǎng)站，如：NCBI、SANGER、TIGR、KEGG、SWISSPORT、Ensemble、中科院北京基因組研究所、北大生物信息學(xué)中心等，下載其中相關(guān)的數(shù)據(jù)，如fasta、genbank格式的核算和蛋白質(zhì)序列、pathway等數(shù)據(jù)，理解其重要的生物學(xué)意義。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003； 。實驗四 ESTS分析實驗?zāi)康模菏煜な褂靡幌盗猩镄畔W(xué)分析工具對測序得到ESTs序列數(shù)據(jù)進行聚類處理，由此對獲得表達基因的豐度等相關(guān)信息，并且對這些表達基因進行功能的初步詮釋，為后續(xù)實驗通過設(shè)計RACE引物獲得全長基因，以及進一步的功能注釋和代謝途徑分析做好準(zhǔn)備。實驗原理：PCR實驗是當(dāng)代分子生物學(xué)的基本實驗之一，由于目標(biāo)序列和實驗?zāi)康牡牟煌?，相?yīng)設(shè)計引物的要求也不一樣。實驗報告：1. 實驗各步驟使用的數(shù)據(jù)、運算平臺、結(jié)果文件記錄；2. 討論：如何應(yīng)用命令行生成腳本文件來完成大批量工作。實驗八 perl程序的安裝、編寫、調(diào)試實驗?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生能在windows和Linux兩種平臺安裝perl解釋器、編寫perl程序以及debug和運行的能力，熟悉perl語言基本語法，學(xué)會熟練編寫和運用perl程序進行基礎(chǔ)生物信息學(xué)研究。實驗
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