生物信息學(xué)4733545076(完整版)
【正文】 . 闡述BLAST原理和比對(duì)步驟；2. 不同類(lèi)型BLAST的結(jié)果及其說(shuō)明；3. 討論：不同平臺(tái)運(yùn)行BLAST的需求比較。實(shí)驗(yàn)一 熟悉生物信息學(xué)網(wǎng)站及其數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義實(shí)驗(yàn)?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生利用互聯(lián)網(wǎng)資源獲取生物信息學(xué)研究前沿和相關(guān)數(shù)據(jù)的能力，熟悉生物信息學(xué)相關(guān)的一些重要國(guó)內(nèi)外網(wǎng)站，及其核酸序列、蛋白質(zhì)序列及代謝途徑等功能相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)，學(xué)會(huì)下載生物相關(guān)的信息數(shù)據(jù)，了解不同的數(shù)據(jù)文件格式和其中重要的生物學(xué)意義。生物信息學(xué)是上世紀(jì)90年代初人類(lèi)基因組計(jì)劃(HGP)依賴(lài)，隨著基因組學(xué)、蛋白組學(xué)等新興學(xué)科的建立，逐漸發(fā)展起來(lái)的生物學(xué)、數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)信息科學(xué)的一門(mén)交叉應(yīng)用學(xué)科。實(shí)驗(yàn)原理：利用互聯(lián)網(wǎng)資源檢索相關(guān)的國(guó)內(nèi)外生物信息學(xué)相關(guān)網(wǎng)站，如：NCBI、SANGER、TIGR、KEGG、SWISSPORT、Ensemble、中科院北京基因組研究所、北大生物信息學(xué)中心等，下載其中相關(guān)的數(shù)據(jù)，如fasta、genbank格式的核算和蛋白質(zhì)序列、pathway等數(shù)據(jù)，理解其重要的生物學(xué)意義。參考書(shū)目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003； 。實(shí)驗(yàn)四 ESTS分析實(shí)驗(yàn)?zāi)康模菏煜な褂靡幌盗猩镄畔W(xué)分析工具對(duì)測(cè)序得到ESTs序列數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi)處理，由此對(duì)獲得表達(dá)基因的豐度等相關(guān)信息，并且對(duì)這些表達(dá)基因進(jìn)行功能的初步詮釋?zhuān)瑸楹罄m(xù)實(shí)驗(yàn)通過(guò)設(shè)計(jì)RACE引物獲得全長(zhǎng)基因，以及進(jìn)一步的功能注釋和代謝途徑分析做好準(zhǔn)備。實(shí)驗(yàn)原理：PCR實(shí)驗(yàn)是當(dāng)代分子生物學(xué)的基本實(shí)驗(yàn)之一，由于目標(biāo)序列和實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡牟煌鄳?yīng)設(shè)計(jì)引物的要求也不一樣。實(shí)驗(yàn)報(bào)告：1. 實(shí)驗(yàn)各步驟使用的數(shù)據(jù)、運(yùn)算平臺(tái)、結(jié)果文件記錄；2. 討論：如何應(yīng)用命令行生成腳本文件來(lái)完成大批量工作。實(shí)驗(yàn)八 perl程序的安裝、編寫(xiě)、調(diào)試實(shí)驗(yàn)?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生能在windows和Linux兩種平臺(tái)安裝perl解釋器、編寫(xiě)perl程序以及debug和運(yùn)行的能力，熟悉perl語(yǔ)言基本語(yǔ)法，學(xué)會(huì)熟練編寫(xiě)和運(yùn)用perl程序進(jìn)行基礎(chǔ)生物信息學(xué)研究。實(shí)驗(yàn)
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