生物信息學(xué)4733545076(留存版)
【正文】 相關(guān)數(shù)據(jù)的能力，熟悉生物信息學(xué)相關(guān)的一些重要國內(nèi)外網(wǎng)站，及其核酸序列、蛋白質(zhì)序列及代謝途徑等功能相關(guān)數(shù)據(jù)庫，學(xué)會下載生物相關(guān)的信息數(shù)據(jù)，了解不同的數(shù)據(jù)文件格式和其中重要的生物學(xué)意義。參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003。Rasmol（）程序有多種版本，有unix, windows, Mac等實驗內(nèi)容：1. ；2. 在PDB網(wǎng)站下載感興趣的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)文件；3. 在Windows用Rasmol打開這個文件；4. 按照要求，找出感興趣的區(qū)域如保守區(qū)等，用特殊顏色標(biāo)出。實驗報告：1. perl解釋器安裝方法；2. perl解釋器debug方法；3. 討論：perl語言在生物信息學(xué)研究中所起到的積極作用。實驗內(nèi)容：1. 從網(wǎng)站下載并安裝Primer ；2. 從 GenBank 中任意獲取一個 DNA 序列，設(shè)計出該序列的合適引物；實驗報告：1. 實驗各步驟使用的數(shù)據(jù)、運算平臺、結(jié)果文件記錄；2. 比較不同引物設(shè)計平臺和不同PCR實驗的差別；參考書目： 《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯， 北京大學(xué)出版社， 2002； 《生物信息學(xué)實驗指導(dǎo)》 胡松年 等著， 浙江大學(xué)出版社， 2003 。系統(tǒng)樹圖是通過UPGMA方法計算的。本實驗指導(dǎo)書中的8個實驗均設(shè)計為綜合性開發(fā)實驗，面向生物信息學(xué)院全體本科學(xué)生和研究生，以及全校對生物信息學(xué)感興趣的其他專業(yè)學(xué)生開放。實驗二 利用BLAST進(jìn)行序列比對實驗?zāi)康模毫私釨LAST及其子程序的原理和基本參數(shù)，熟練地應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)平臺和Linux計算平臺進(jìn)行本地BLAST序列比對，熟悉BLAST結(jié)果的格式和內(nèi)容并能描述其主要意義，同時比較網(wǎng)上平臺和本地平臺的優(yōu)缺點。2. 使用CodonCode Aligner程序里的Clip Ends, Trim Vector, Assemble等功能，完成序列的剪切、去雜質(zhì)、組裝工作。實驗內(nèi)容：1. 熟悉與蛋白質(zhì)分析相關(guān)的數(shù)據(jù)庫資源，如Swis
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