生物信息學(xué)基礎(chǔ)大作業(yè)報(bào)告-資料下載頁
2025-04-04 23:37本頁面
【正文】 的數(shù)目為；并出現(xiàn)缺損現(xiàn)象：假定出現(xiàn)缺損的核苷酸可能發(fā)生轉(zhuǎn)換的數(shù)目為，缺損核苷酸可能發(fā)生顛換的數(shù)目為，它們滿足關(guān)系式是：，則在模型假設(shè)下序列與的核苷酸替代概率為穎芻莖蛺餑億頓裊賠瀧漲負(fù)這惻鮭觶。假設(shè)()條長度均為的序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)是有根樹，概率模型是—模型，第次序列比對中核苷酸相同的數(shù)目為，核苷酸相異的數(shù)目為，存在缺損的核苷酸位點(diǎn)數(shù)為，則系統(tǒng)發(fā)育樹中各分枝長度的最優(yōu)估計(jì)為濫驂膽閉驟羥闈詔寢賻減棲綜訴鮐巹。 礦區(qū)的氧化亞鐵硫桿菌新菌系的鑒定.[目的]：以結(jié)瘤豆科植物紫花苜蓿根際土壤為研究材料,篩選具有脫氨酶活力的氫氧化細(xì)菌,。[方法]：利用持續(xù)通 的氣體循環(huán)培養(yǎng)體系、礦質(zhì)鹽固體培養(yǎng)基,分離、培養(yǎng)氫氧化細(xì)菌,觀察菌株形態(tài)并測定生理生化特征 序列分析法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。采用薄層層析法篩選脫氨酶陽性菌株,。[結(jié)果]：分離的株細(xì)菌中有株菌氧化氫和自養(yǎng)生長能力較強(qiáng),初步確定為氫氧化細(xì)菌,、生理生化特征與惡臭假單胞菌( )的特征基本一致 序列(登錄號為)在系統(tǒng)發(fā)育樹中與惡臭假單胞菌同屬一個(gè)類群,其脫氨酶活力為 μ[結(jié)論]采用氣體循環(huán)培養(yǎng)體系分離氫氧化細(xì)菌,克服了傳統(tǒng)配氣法的局限脫氨酶陽性菌株的篩選,。 株芽孢桿菌 基因序列測定與系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析采用 基因序列分析法對中國工業(yè)微生物菌種保藏管理中心（）保藏的株枯草芽孢桿菌（ ）進(jìn)行復(fù)核鑒定。菌株經(jīng)純化培養(yǎng)，以改良法提取總，采用細(xì)菌 通用引物、方法（)進(jìn)行 基因序列擴(kuò)散，產(chǎn)物純化后直接進(jìn)行序列測定，序列經(jīng)人工校對后用 進(jìn)行比對分析，最后用軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果表明：株枯草芽孢桿菌中油株菌種與原鑒定結(jié)果一致，有株菌種與原鑒定結(jié)果存在差異，其中株鑒定結(jié)果為巨大芽孢桿菌（)，另一株鑒定結(jié)果為地衣芽孢桿菌（）。塤礙籟饈決穩(wěn)賽釙冊庫麩適緄撾鲅傯。 酸馬奶中乳桿菌和—的 基因序列及聚類分析 序列同源性分析作為細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育和親緣關(guān)系研究已被普遍接受和應(yīng)用。目前，乳桿菌的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系也主要建立在 序列分析的基礎(chǔ)上。尤其是在復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)中乳桿菌資源調(diào)查研究方面中的應(yīng)用。有助于更加準(zhǔn)確地描述和揭示乳桿菌的種及其菌株間的親緣關(guān)系和演化過程，也為新種的發(fā)現(xiàn)提供有力的工具。裊樣祕廬廂顫諺鍘羋藺遞燦擾諗魴莖。參考文獻(xiàn)（不少于篇）[] 劉清雪 遺傳模擬退火算法在系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建中的應(yīng)用研究碩士學(xué)位論文[] 馮思鈴系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法研究海南大學(xué)信息科學(xué)技術(shù)學(xué)院[] 謝強(qiáng)，卜文俊以貝葉斯方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院昆蟲學(xué)研究所昆蟲分子系統(tǒng)學(xué)實(shí)驗(yàn)室，天津)倉嫗盤紲囑瓏詁鍬齊驁絛鯛鱧俁魷親。[] 孫嘯，路祖宏，謝建明 生物信息學(xué)基礎(chǔ) 清華大學(xué)出版社[]田鵬，劉占林分子系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建的簡易方法期刊：生物信息學(xué)；作者單位: 西部資源生物與現(xiàn)代生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,西北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,西安綻萬璉轆娛閬蟶鬮綰瀧恒蟬轅紗魚臚。[]劉琳，劉洋，劉紅娟發(fā)育分析在微生物進(jìn)化關(guān)系中的應(yīng)用作者單位：首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,北京驍顧燁鶚巰瀆蕪領(lǐng)鱺賻驃弒綈閶魎齠。[] 唐曉嗣，[].應(yīng)用概率統(tǒng)計(jì)，()瑣釙濺曖惲錕縞馭篩涼貿(mào)錒戧晉魘繅。[] 程池，劉光全，李金霞，姚粟株芽孢桿菌 基因序列測定與系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析[].食品與發(fā)酵工業(yè)，（），鎦詩涇艷損樓紲鯗餳類礙穡鰳責(zé)髕鵲。[] 張文，唐煥文，方偉武，蔡旭，[].大連理工大學(xué)學(xué)報(bào)()櫛緶歐鋤棗鈕種鵑瑤錟奧傴輥刪髖綠。[] 唐先華,[].地址科技情報(bào)，()轡燁棟剛殮攬瑤麗鬮應(yīng)頁諳絞綽髏鱉。[] 程池，劉光全，李金霞，姚粟株芽孢桿菌 基因序列測定與系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析[].食品與發(fā)酵工業(yè)，（），峴揚(yáng)斕滾澗輻灄興渙藺詐機(jī)憒頇驤經(jīng)。[] [].湘潭大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào)，（）詩叁撻訥燼憂毀厲鋨驁靈韜鰍櫝驥鱭。[] 楊宇，彭宏，萬民熙，邱冠周，黃菊芳，[].中國有色金屬學(xué)報(bào)()則鯤愜韋瘓賈暉園棟瀧華縉輅贊驏紆。[] [].大連:大連理工大學(xué)[] 烏日娜，張和平，—的 基因序列及聚類分析[].中國乳品工業(yè)，()，脹鏝彈奧秘孫戶孿釔賻鏘詠繞敘驄驗(yàn)。 9 / 9
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