生物信息學(xué)新進(jìn)展-資料下載頁
2025-09-25 15:37本頁面
【正文】 因組知識的藥物發(fā)現(xiàn)方法中得到新的藥物靶。(Base4 Bioinformatics, Mississauga, Ontario, Canada)描述了一種相關(guān)的策略。藥物發(fā)現(xiàn)階段中所要求的軟件工具的任務(wù)是多樣化的，要能注釋基因，并闡明它的生理和病理功能及其商業(yè)潛質(zhì)。對這樣多種來源的信息的集成與分析，在派生的、項目取向的數(shù)據(jù)庫(projectspecific database, PSD)中可以很好完成。由于項目貫穿于發(fā)現(xiàn)到開發(fā)全過程，其間不斷加入不同背景的成員，PSD在項目的管理與發(fā)展中成為一種關(guān)鍵性的資源。(Boston University, Boston, MA, USA)的觀點[2]，我們并不需要更快捷的計算機(jī)或更多的計算機(jī)科學(xué)家，而是需要更多的生物學(xué)家和生物化學(xué)家來解釋序列的功能。這對有些軟件或硬件專家來說是個打擊，但生物學(xué)系統(tǒng)的復(fù)雜性是令人生畏的，并且對基因功能的認(rèn)識可能需要生物學(xué)方法和計算方法的結(jié)合。探索基因的功能很可能要花費生物學(xué)家們數(shù)十年的時間，本次會議表明沒有任何單一的方法可以得出一個答案；但是，將計算生物學(xué)同大規(guī)模篩選結(jié)合起來識別一種化學(xué)靶物(hit)是一種產(chǎn)生化學(xué)工具來探索基因功能的方法，這些化學(xué)工具接下來就可以用作理解基因功能的“探針”。Gene Transcription Technologies, Philadelphia, PA, USA)的描述中，既是一種檢查基因功能的簡單方法，也是為潛在的藥物靶發(fā)現(xiàn)化學(xué)導(dǎo)向物的簡單方法。他描述了一種可以在酵母中重建人類基因功能的酵母大規(guī)模篩選系統(tǒng)。在此系統(tǒng)中，可以迅捷地在一個化學(xué)文庫中發(fā)現(xiàn)配基。這種技術(shù)的重要特征是它不僅僅是發(fā)現(xiàn)一種藥物靶的配基的篩板(screen)，相反，由于該系統(tǒng)的高速度，它也是發(fā)現(xiàn)導(dǎo)向靶基因的一種篩板。過去，世界上的制藥公司通常在任一時間內(nèi)僅能對有限數(shù)目（約20多個）的藥物靶基因進(jìn)行工作，鑒于此，我們需要根本不同的方法如基因組學(xué)來打開通向“新”生物學(xué)的通路。由于機(jī)器人和組合化學(xué)的進(jìn)步，藥物發(fā)現(xiàn)中最關(guān)鍵的問題不再是得到一種導(dǎo)向化合物（lead pound)，而是得到導(dǎo)向靶基因。此次會議為從計算和實驗方法中發(fā)展出的新生物學(xué)邁出了很好的一步。參考文獻(xiàn)1. 蔡立羽，王志中．人類基因組計劃中的生物信息學(xué)．國外醫(yī)學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程分冊1998。 21(1): 44472. Lim HA, Batt TR. Bioinformatics takes charge. Trends in Biotechnology 1998。 16(3):1041073. Williams N. Drug firms back move to link database. Science 1997。 277(5328): 9024. Stein LD, Cartinhour S, Therry MD, et al. JADE: an approach for interconnecting bioinformatics databases. Gene 1998。 209(12): GC39GC4
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