復(fù)雜先心病tga的基因組學(xué)及其網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)制研究-資料下載頁(yè)
2024-09-29 10:29本頁(yè)面
【導(dǎo)讀】究中扮有重要作用?；蚪M學(xué)的分子生物學(xué)基礎(chǔ)；TGA的基因組學(xué)及其網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)制研究簡(jiǎn)介。常見先心病的基因組學(xué)：。其他較少見的染色體缺失包括：9q34,,Holt-Oram綜合征主要表現(xiàn)為肢體和心臟畸形，故又稱。單倍體TBX5基因可導(dǎo)致Holt-Oram綜合征，TBX5基因突。變也是人類首個(gè)在心臟間隔缺損畸形中找到的單基因突變。TBX5基因的錯(cuò)義突變導(dǎo)致心臟或肢體的畸形則取決于其。有一些顯示出明顯的孟德爾遺傳模型；有的顯性遺傳、有的隱性遺傳、有的伴性遺傳；有一些是為一個(gè)基因的結(jié)構(gòu)或功能的改變，即“單基因。估計(jì)這種遺傳缺陷占8%；MYH712–20%LMNA2–6%PKP211–43%KCNQ130–35%SCN5A20–25%. 確定胎兒或個(gè)體是否處于遺傳。使個(gè)人和家人難于決斷；可能負(fù)面影響家庭穩(wěn)定性和個(gè)
【正文】 子聚類成一族，稱作一個(gè)模塊 (module)，然后識(shí)別與臨床相關(guān)的模塊，最后用模塊內(nèi)連通性（ intramodular connectivity）和基因重要性（ gene significance）識(shí)別信號(hào)通路上關(guān)鍵調(diào)控基因（ Hub genes）。 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 Tools: Pearson correlation, Soft thresholding Rationale: make use of interaction patterns between genes 模塊識(shí)別 Tools: TOM, Hierarchical clustering Rationale: module (pathway) based analysis 找到模塊代表性基因 Tools: eigengene (1st Principal Component)? Rationale: Condense each module into one profile 進(jìn)一步分析 模塊相關(guān)性，模塊重要性、析因分析等 . 第一部分：全基因組外顯子測(cè)序?qū)ふ?TGA的致病錯(cuò)義基因突變 完全性大動(dòng)脈轉(zhuǎn)位患者(12例 ) Agilent 全外顯子捕獲＋Solexa測(cè)序 生物信息學(xué)分析 注釋和統(tǒng)計(jì)分析、排除非基因、內(nèi)含子、同義突變、已知 SNP 潛在致病突變 Sanger測(cè)序 排除沒有驗(yàn)證的潛在致病突變 TGA患者 150例 包括核心家系 50個(gè) 健康志愿者 500例 基因型與表型是否發(fā)生共分離 驗(yàn)證潛在致病突變 2. 驗(yàn)證階段 TGA主動(dòng)脈瓣下圓錐組織 權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 TGA肺動(dòng)脈瓣下圓錐組織 TGA肺動(dòng)脈瓣下圓錐與干下型肺動(dòng)脈瓣下圓錐的差異模塊 干下型患者的肺動(dòng)脈瓣下圓錐組織 TGA的關(guān)鍵信號(hào)通路及關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因 TGA主動(dòng)脈瓣下圓錐與干下型肺動(dòng)脈瓣下圓錐的差異模塊 TGA的 差異模塊 1. 權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析識(shí)別 TGA的關(guān)鍵信號(hào)通路及關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因， 第二部分：致病錯(cuò)義基因突變 的分子機(jī)制 野生型 致病基因 P19細(xì)胞功能 Nodal信號(hào)應(yīng)答 突變型 致病基因 基因突變的功能及其分子機(jī)制 致病基因與 NODAL信號(hào)通路基因細(xì)胞定位與表達(dá) 高糖 2. 致病錯(cuò)義基因突變通過(guò) TGA關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)對(duì) NODAL信號(hào)通路的調(diào)控機(jī)制 預(yù)期結(jié)果 1. 在全基因組外顯子組范圍發(fā)現(xiàn) TGA致病錯(cuò)義基因突變發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)； 2. 闡明致病錯(cuò)義基因突變?cè)诟改复c子代之間的傳遞規(guī)律，為早期診斷提供分子遺傳預(yù)警的標(biāo)記。 3. 通過(guò)權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析識(shí)別 TGA的關(guān)鍵信號(hào)通路及關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)基因。 4. 闡明致病錯(cuò)義基因突變對(duì)細(xì)胞功能的影響，揭示致病基因通過(guò) TGA關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)對(duì) NODAL信號(hào)通路作用的分子機(jī)制，并闡明闡明環(huán)境因素如高糖對(duì)致病錯(cuò)義基因突變作用效果的協(xié)同作用。 謝謝
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