復(fù)雜先心?。╰ga）的基因組學(xué)及其網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)制研究-預(yù)覽頁
【正文】 C, cTnT, cTnI, ACTC, MYL2, and MYL3) 作基因突變檢測 ? 在 23個先癥者中檢測到 26個基因突變，發(fā)生率為 (29%) ? 以往的研究主要集中在候選的信號通路或基因 ? 在全基因組范圍全面發(fā)現(xiàn)新的先心病的致病基因突變，闡明其遺傳傳遞規(guī)律，并系統(tǒng)地揭示其致病機(jī)制成為目前全世界研究重點 。 ? TGA嚴(yán)重影響威脅人口素質(zhì)，給社會和家庭帶來極大負(fù)擔(dān)。 3. 通過系統(tǒng)生物學(xué)的方法識別基因組中關(guān)鍵節(jié)點基因及其網(wǎng)絡(luò)，對于致病基因突變的機(jī)制研究具有方向性指導(dǎo)作用。 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 Tools: Pearson correlation, Soft thresholding Rationale: make use of interaction patterns between genes 模塊識別 Tools: TOM, Hierarchical clustering Rationale: module (pathway) based analysis 找到模塊代表性基因 Tools: eigengene (1st Principal Component)? Rationale: Condense each module into one profile 進(jìn)一步分析 模塊相關(guān)性，模塊重要性、析因分析等 . 第一部分：全基因組外顯子測序?qū)ふ?TGA的致病錯義基因突變 完全性大動脈轉(zhuǎn)位患者(12例 ) Agilent 全外顯子捕獲＋Solexa測序 生物信息學(xué)分析 注釋和統(tǒng)計分析、排除非基因、內(nèi)含子、同義突變、已知 SNP 潛在致病突變 Sanger測序 排除沒有驗證的潛在致病突變 TGA患者 150例 包括核心家系 50個 健康志愿者 500例 基因型與表型是否發(fā)生共分離 驗證潛在致病突變 2. 驗證階段 TGA主動脈瓣下圓錐組織 權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 TGA肺動脈瓣下圓錐組織 TGA肺動脈瓣下圓錐與干下型肺動脈瓣下圓錐的差異模塊 干下型患者的肺動脈瓣下圓錐組織 TGA的關(guān)鍵信號通路及關(guān)鍵節(jié)點基因 TGA主動脈瓣下圓錐與干下型肺動脈瓣下圓錐的差異模塊 TGA的 差異模塊 1. 權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析識別 TGA的關(guān)鍵信號通路及關(guān)鍵節(jié)點基因， 第二部分：致病錯義基因突變 的分子機(jī)制 野生型 致病基因 P19細(xì)胞功能 Nodal信號應(yīng)答 突變型 致病基因 基因突變的功能及其分子機(jī)制 致病基因與 NODAL信號通路基因細(xì)胞定位與表達(dá) 高糖 2. 致病錯義基因突變通過 TGA關(guān)鍵節(jié)點對 NODAL信號通路的調(diào)控機(jī)制 預(yù)期結(jié)果 1. 在全基因組外顯子組范圍發(fā)現(xiàn) TGA致病錯義基因突變發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)； 2. 闡明致病錯義基因突變在父母代與子代之間的傳遞規(guī)律，為早期診斷提供分子遺傳預(yù)警的標(biāo)記
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