第13章基因組學(xué)-資料下載頁
2024-10-12 08:17本頁面
【導(dǎo)讀】本章教學(xué)時數(shù)：4學(xué)時。1986年提出，至今20年，已經(jīng)發(fā)展成為。遺傳學(xué)中最重要的分支學(xué)科。對物種的所有基因進行定位、作圖、測。獲得生物體全部基因組序列。鑒定所有基因的功能。明確基因之間的相互作用關(guān)系。闡明基因組的進化規(guī)律。在20世紀初，遺傳學(xué)剛剛誕生的時候，遺傳。理、化學(xué)因素誘發(fā)突變。知基因的相互關(guān)系，繪制遺傳連鎖圖。基因表達調(diào)控的研究。鑒定蛋白質(zhì)的產(chǎn)生過程、結(jié)構(gòu)、功能和。2020年2月，公布人類基因組圖譜的修訂版。要知道序列在Chr上的位置才能正確拼接。有可以識別的標記，才能確定目標的方位。很多突變是致死的。明確顯示遺傳多態(tài)性的染色體結(jié)構(gòu)特征。遍布整個基因組，數(shù)量無限。DNA序列能或不能被某一酶酶切，相當于一對?？蓪FLP作為標記，定位在基因組中某一位。有兩個等位基因。但又不能相差太大以導(dǎo)致引起子代不育。對備選材料進行多態(tài)(差異)性檢測
【正文】 組 克隆重疊群法（ clone contig） ? 將基因組 DNA切割長度為 － 1Mb的大片段，克隆到 YAC或 BAC載體上 ? 然后再進行亞克隆，分別測定單個亞克隆的序列 ? 再裝配、連接成連續(xù)的 DNA分子。 ? 這是一種自上而下（ up to down） 的測序策略 ? clonebyclone method 兩種基因組測序策略 The genome A portion of the chromosome showing genes and operons. A dot indicates the promoter for each gene or operon. Arrows and color indicate the direction of transcribtion: dark blue genes are transcribed left to right, light blue are transcribed right to gene are shown in green. 功能基因組學(xué) ? 完成基因組測序 ， 僅僅是基因組計劃的第一步 ， 更重要的工作在于弄清楚： ① 基因組序列中所包含的全部遺傳信息是什么； ② 基因組作為一個整體如何行使功能 。 ?就是對基因組序列進行詮釋的過程，也就是功能基因組學(xué)的研究內(nèi)容。 根據(jù)序列分析搜尋基因 ? 查找開放閱讀框 （ open reading frame, ORF） ? 開放閱讀框都有一個起始密碼子 ， ATG， 還要有終止密碼子 。 ? 從 ATG開始 ， 然后向下游尋找終止密碼子 。 ? 起始密碼子和終止密碼子之間的堿基數(shù)目要能夠被 3整除 ? 每一條鏈都有 3種可能的閱讀框 ， 2條連共計有 6種可能的閱讀框 . ? 計算機可以很快給出結(jié)果 。 同源查詢 ? 利用已經(jīng)存入數(shù)據(jù)庫的基因序列與待查的基因組序列比對 ， 從中查找可以與之匹配的堿基序列及其比例 ， 用于界定基因 。 ? 同源查詢可以部分彌補 ORF掃描的不足 。 同源查詢的依據(jù) 有親緣關(guān)系的物種 ， 基因組可能存在某種程度的相似性： ? 存在某些完全相同的序列； ? ORF的排列相似 ， 如等長的外顯子； ? ORF指令的氨基酸序列相似； ? 模擬的多肽鏈的高級結(jié)構(gòu)相似 ， 等 。 基因功能研究 計算機預(yù)測基因功能 ? 依據(jù)仍然是同源性比較。同源基因擁有一個共同的祖先基因，它們之間有許多相似的序列。 ? 種間同源基因 ? 種內(nèi)同源基因 基因功能研究 實驗確認基因功能 基因克隆 基因敲除 （ knockout） 基因的超表達 反義 RNA技術(shù) RNAi 轉(zhuǎn)座子插入突變 反義 RNA（ antisense RNA） 技術(shù)
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