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sas的anova正式方差分析-資料下載頁

2024-08-20 14:18本頁面

【導(dǎo)讀】掌握方差分析基本思想、應(yīng)用條件以及計(jì)算方法;掌握兩階段交叉設(shè)計(jì)資料的特征及其SAS分析程序;t檢驗(yàn)和u檢驗(yàn)適用于兩個(gè)樣本均數(shù)的比較。有效地控制第一類錯(cuò)誤。計(jì)量,故方差分析又稱F檢驗(yàn)。下面結(jié)合單個(gè)處理因素的情況介紹方差分。方差分析的目的就是在H0:成立。差別大小,推斷k個(gè)總體均數(shù)間有無差別,從而說明處理因素的效果是否存在。總變異的離均差平方和為各變量值與總均。組間離均差平方和為各組樣本均數(shù)與總均。組內(nèi)離均差平方和為各處理組內(nèi)部觀察值??梢?,完全隨機(jī)設(shè)計(jì)的單因素方差分析時(shí)。體;各總體方差相等,即方差齊性。檢驗(yàn);兩樣本的方差齊性檢驗(yàn)等。的若干部分,然后求各相應(yīng)部分的變異;的大小確定P值,作出統(tǒng)計(jì)推斷。,并用數(shù)量表示。SAS系統(tǒng)提供的有關(guān)方差分析過程有ANOVA、,樣本數(shù)相同,否則稱為非平衡數(shù)據(jù)。PROCGLM過程可用于平衡和非?,F(xiàn)對(duì)兩個(gè)過程分別予以介紹。TEST語句指定效應(yīng)平方和和誤差項(xiàng),構(gòu)建檢驗(yàn),裂區(qū)設(shè)。REPEATED語句指定模型中的重復(fù)測(cè)量因子(MODEL

  

【正文】 ? TEST語句定義需檢驗(yàn)的變量,即生存時(shí)間與該變量是否有關(guān),如果它后面定義的變量為數(shù)值變量,則把該變量當(dāng)作協(xié)變量檢驗(yàn)與生存時(shí)間的關(guān)系。如果它定義的為分組變量,則分組比較生存時(shí)間有無差別。 例題 1-生存率計(jì)算 ? 為了比較不同手術(shù)方法治療腎上腺腫瘤的療效,某研究者隨機(jī)將 43例病人分成兩組,甲組 23例、乙組 20例的生存時(shí)間(月)如下所示: ? 甲組: 1, 3, 5( 3), 6( 3), 7, 8, 10( 2), 14+, 17, 19+, 20+ , 22+, 26+, 31+, 34, 34+, 44, 59 ? 乙組: 1( 2), 2, 3( 2), 4( 3), 6( 2), 8, 9( 2), 10, 11, 12, 13, 15, 17, 18 ? 其中有“ +”者是刪失數(shù)據(jù),表示病人仍生存或失訪,括號(hào)內(nèi)為重復(fù)死亡數(shù)。試計(jì)算甲組的生存率與標(biāo)準(zhǔn)誤。 例題 2-壽命表法 ? 某研究者隨訪收集了某地男性心絞痛患者 2418例,試計(jì)算該地男性心絞痛患者的生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤。 例題 3- logrank檢驗(yàn) ? 試比較甲、乙兩種手術(shù)方式的生存率有無差別? Cox模型 ? 像通常的回歸分析一樣,人們也希望能建立起生存時(shí)間(因變量或反應(yīng)變量)隨危險(xiǎn)因素(自變量或協(xié)變量)變化的回歸方程,以便對(duì)危險(xiǎn)因素的作用大小有一個(gè)全面的了解和掌握、并根據(jù)危險(xiǎn)因素的不同取值對(duì)生存 概率 進(jìn)行預(yù)測(cè)。由于很難獲得準(zhǔn)確的生存時(shí)間, 前述目的較難直接實(shí)現(xiàn)。 1972年 Cox提出了比例危險(xiǎn)模型,簡(jiǎn)稱為 Cox模型。 由于此模型在表達(dá)形式上與參數(shù)模型相似,但在對(duì)模型中各參數(shù)進(jìn)行估計(jì)時(shí)卻不依賴于特定的假設(shè),所以又稱為半?yún)?shù)模型。 Cox模型 ? Cox模型是目前生存分析多因素預(yù)后評(píng)價(jià)中較好的統(tǒng)計(jì)分析方法,醫(yī)學(xué)上經(jīng)常遇到“時(shí)間 反應(yīng)”類型資料。如生命現(xiàn)象生存期、疾病潛伏期、藥物試驗(yàn)的生效時(shí)間等。這種類型的資料可以用各種參數(shù)或非參數(shù)方法進(jìn)行分析,但都有一定的局限性。 Cox模型以半?yún)?shù)方式出現(xiàn),適用于許多分布未知的資料和多因素分析,可以在眾多預(yù)后因素共存的情況下,排除混雜因子的影響,提高預(yù)后分析質(zhì)量,并能處理截尾數(shù)據(jù)。此模型的適用面很寬,在 生存分析 中占有特殊的地位。 Cox模型 ? 設(shè)是影響生存時(shí)間 t的 k個(gè)危險(xiǎn)因素。設(shè) hi(t)為第 i名受試者在時(shí)刻 t的風(fēng)險(xiǎn)率,即 t時(shí)刻外后一瞬間的死亡速率。又設(shè) h0(t)表示不受危險(xiǎn)因素 x的影響下,在時(shí)刻 t的風(fēng)險(xiǎn)率,又稱為基準(zhǔn)風(fēng)險(xiǎn)率或基準(zhǔn)函數(shù)。其模型的具體形式為: ? hi(t)=h0(t)exp(β1xi1+β2xi2+…+βmxim) ? 式中 hi(t)為第 i名受試者生存到 t時(shí)刻的危險(xiǎn)率函數(shù), h0(t)是當(dāng)所有危險(xiǎn)因素 (即 xij=0)不存在時(shí)的基礎(chǔ)危險(xiǎn)率函數(shù), X=(xi1,xi2,…,xim)39。 是可能與生存時(shí)間有關(guān)的m個(gè)危險(xiǎn)因素所構(gòu)成的向量。 Cox模型 ? ln[hi(t)/h0(t)]=β1xi1+β2xi2+…+ βmxim ? 此式表明:各危險(xiǎn)因素與回歸系數(shù)的線性組合就是第i名受試者的相對(duì)危險(xiǎn)率函數(shù)的自然對(duì)數(shù)值。再設(shè)有 i、 j兩個(gè)受試者 ,其危險(xiǎn)因素向量分別為X1與 X2,不難得出他們的相對(duì)危險(xiǎn)率的自然對(duì)數(shù)為: ? ln[hi(t)/h0(t)]=β1(xi1xj1)+β2(xi2xj2) ? 即利用 “具有某預(yù)后因素向量的受試者的死亡風(fēng)險(xiǎn)與不具有該預(yù)后因素向量的受試者的死亡風(fēng)險(xiǎn)在所有時(shí)間上都保持一個(gè)恒定比例”的假設(shè),巧妙地獲得了各時(shí)間點(diǎn)上2個(gè)受試者相對(duì)危險(xiǎn)率函數(shù)的估計(jì)值。 Cox模型 ? 然而,當(dāng)資料不滿足上述假設(shè)時(shí),即有些危險(xiǎn)因素作用的強(qiáng)度是隨時(shí)間而變化的,2個(gè)受試者的危險(xiǎn)率函數(shù)之比 (相對(duì)危險(xiǎn) )隨時(shí)間而改變,就應(yīng)改用時(shí)變協(xié)變量模型,也稱為非比例危險(xiǎn)模型。當(dāng)只有一個(gè)危險(xiǎn)因素時(shí),其模型的具體形式為: ? hi(t)=h0(t)exp[βxi+γ(xiti)] ? 式中 ti為第 i個(gè)受試者的生存時(shí)間。 ? 上述各式中的回歸系數(shù)需用最大似然法進(jìn)行估計(jì),一旦有了危險(xiǎn)率函數(shù)的估計(jì)值,再利用生存時(shí)間函數(shù)之間的相互關(guān)系,可獲得其他生存時(shí)間函數(shù)的估計(jì)值。 Cox模型中參數(shù)意義的解釋 ? 對(duì)于一元 Cox模型,如果因素 x的取值為 1和 0,那么,受 x影響與不受 x影響的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)是: ? 對(duì)于一元 Cox模型,如果因素 x是連續(xù)變量,那么,表示相鄰水平的風(fēng)險(xiǎn)率之比。 ? 多余多元 Cox模型,表示其它因素不變的情況下,因素 xi相鄰水平的風(fēng)險(xiǎn)率之比(相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)率)。 )e xp ()( )e xp ()()0,( )1,(00 ?? ???ththththRHCox模型中參數(shù)意義的解釋 ? 例如,高血壓( x1)和高血脂( x2)對(duì)冠心病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)率的 Cox模型是: ? 其中, h0(t)表示既沒有高血壓( x1=0)也沒有高血脂( x2=0)的研究對(duì)象在時(shí)刻 t的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)率。 )5 1 0 7 5 x p ()(),( 210 xxthxth ??Cox模型中參數(shù)意義的解釋 ? 由此可以估計(jì)出: ? 有高血壓但沒有高血脂者( x1=1, x2=0)相對(duì)于既沒有高血壓也沒有高血脂者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)率之比為: ? 有高血脂但沒有高血壓者( x1=0, x2=1)相對(duì)于既沒有高血壓也沒有高血脂者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)率之比為: ? 有高血壓又有高血脂者( x1=1, x2=1)相對(duì)于既沒有高血壓也沒有高血脂者發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)率之比為: ? )8 7 5 x p ()e x p ( 1 ??? ?RH) x p ()e x p ( 2 ??? ?RH)5 1 0 7 5 x p ()e x p ( 21 ????? ??RHCox模型的應(yīng)用 ? Cox模型由于以下特點(diǎn)具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值: ? 與參數(shù)法相比,它不需要考慮資料的分布,即任何分布的生存研究資料都可以利用 Cox模型進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。 ? 它是一種多元統(tǒng)計(jì)分析方法,可以用來分析多種因素對(duì)生存時(shí)間的影響。而流行病學(xué)研究的重要目標(biāo)之一就是分析各種因子與發(fā)病之間的關(guān)系, Cox模型回歸分析模型可以用來分析各因子對(duì)發(fā)病的影響,使得生存分析更適合于流行病學(xué)研究。 Cox模型的應(yīng)用 ? 它與其它一般回歸分析方法類似,可用于比較和預(yù)測(cè),多元 Cox模型回歸分析可以校正其它因素的影響,用于某一因素不同水平的比較;并可以在研究對(duì)象的各因素已知時(shí),預(yù)測(cè)研究對(duì)象在某時(shí)刻的生存概率。 ? 它與 Logistic回歸分析類似,在得到回歸系數(shù)的估計(jì)值后,則可以估計(jì) t時(shí)刻的相對(duì)危險(xiǎn)度:。 Cox回歸的 SAS程序 ? SAS系統(tǒng)中利用 PHREG過程對(duì)生存數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析,結(jié)局變量(因變量)為生存時(shí)間,可以處理有截尾數(shù)據(jù)的生存時(shí)間。 ? PHREG過程的語法格式如下: ? PROC PRREG DATA= [選項(xiàng) ]。 ? MODEL 生存時(shí)間變量 *截尾指示變量 (數(shù)值 )=自變量名 /[選項(xiàng) ]。 ? STRATA 分組變量名列 。 ? FREQ 變量名列 。 ? BY 變量名列 。 ? RUN。 Cox回歸的 SAS程序 ? MODEL語句為必需的 ,定義生存時(shí)間和截尾指示變量和說明變量: NOPRINT,不打印輸出;NOSUMMARY,不打印輸出事件和截尾數(shù)值;SIMPLE輸出 MODEL語句中每一個(gè)說明變量的簡(jiǎn)單的描述統(tǒng)計(jì)量。 ? TIES=方法,指定估計(jì)生存率所用的方法:BRESLOW使用 Breslow的近似似然估計(jì),為默認(rèn)的選項(xiàng); DISCRETE,用離散 Logistic模型替代比例風(fēng)險(xiǎn)模型,多用于 m:n的 Logistic回歸;EFRON 使用 Efron的近似似然。 Cox回歸的 SAS程序 ? EXACT,計(jì)算在比例危險(xiǎn)假定下所有失效事件發(fā)生在具有相同值的刪失時(shí)間或較大值時(shí)間之前的精確條件概率。 ? ENTRYTIME=變量名,規(guī)定一個(gè)替代左截?cái)鄷r(shí)間的變量名。 Cox回歸的 SAS程序 ? SELECTION=method,方法可以選擇以下幾種: FORWARD(或 F),按照規(guī)定的 P值 SLE從無到有依次選一個(gè)變量進(jìn)入模型; BACKWARD,按照規(guī)定的 P值 SLS從含有全部變量的模型開始,依次剔除一個(gè)變量; STEPWISE,按照 SLE的標(biāo)準(zhǔn)依次選入變量,同時(shí)對(duì)模型中現(xiàn)有的變量按 SLS的標(biāo)準(zhǔn)剔除不顯著的變量; SCORE,采用最優(yōu)子集選擇法。其中, SLE選擇項(xiàng)用于指定協(xié)變量進(jìn)入模型的顯著水平, SLS選擇項(xiàng)用于指定協(xié)變量停留在模型中的顯著水平,缺省值皆為 。 Cox回歸的 SAS程序 ? STRATA語句:比例風(fēng)險(xiǎn)的假定可能不會(huì)對(duì)所有的層都成立,此時(shí)需要作分層分析。 STRATA語句要求按照分層變量名列的水平數(shù)擬合一個(gè)多層的 Cox模型。與 BY語句不同,后者是要求按分組變量名列分別估計(jì)模型及參數(shù)。 ? PHREG過程中還可以加入編程語句用以創(chuàng)建模型中的新的自變量,但不能用以修改應(yīng)變量,截尾變量,組變量或分層變量的值。當(dāng)省略所有的選項(xiàng),并且只有一個(gè)分類自變量(分組變量)時(shí),模型的檢驗(yàn)相當(dāng)于生存曲線的比較。 例題- COX回歸 ? 為探討某惡性腫瘤的預(yù)后,某研究者收集了 63例患者的生存時(shí)間、生存結(jié)局及影響因素。影響因素包括病人年齡、性別、組織學(xué)類型、治療方式、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、腫瘤浸潤(rùn)程度,生存時(shí)間 以月計(jì)算。試用 Cox回歸模型進(jìn)行分析。 116 本章小節(jié) ? 在醫(yī)學(xué)研究中,常常用隨訪的方式來研究事物發(fā)展的規(guī)律。例如,了解某藥物的療效,了解某儀器設(shè)備的使用壽命,了解手術(shù)后的存活時(shí)間等等。這種研究的特點(diǎn)是追蹤研究的現(xiàn)象都要經(jīng)過一段時(shí)間,統(tǒng)計(jì)學(xué)上將這段時(shí)間稱為生存時(shí)間。生存分析就是用來研究生存時(shí)間的分布規(guī)律以及生存時(shí)間和相關(guān)因素之間關(guān)系的一種統(tǒng)計(jì)分析方法。 本章小節(jié) ? 生存數(shù)據(jù),指的是生存時(shí)間以及與生存時(shí)間有關(guān)聯(lián)的一組獨(dú)立變量。這里主要解釋與生存時(shí)間有關(guān)的幾個(gè)概念。在生存分析中將生存時(shí)間定義為從某起始事件起到某終止事件為止所經(jīng)歷的時(shí)間跨度。所以,生存時(shí)間也稱為失效時(shí)間。 ? 描述生存時(shí)間分布規(guī)律的函數(shù)統(tǒng)稱為生存時(shí)間函數(shù)。常用的有生存函數(shù)、死亡函數(shù)、死亡密度函數(shù)和風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)。進(jìn)行生存分析有四種基本方法:統(tǒng)計(jì)描述、非參數(shù)檢驗(yàn)、半?yún)?shù)模型回歸分析、參數(shù)模型回歸分析。 本章小節(jié) ? 本章介紹了生存率的兩種估計(jì)方法:乘積極限法和壽命表法,以及結(jié)合實(shí)例介紹了進(jìn)行生存率估計(jì)兩種方法的 SAS程序。最后,重點(diǎn)介紹了 Cox模型、 Cox模型的參數(shù)估計(jì)、 Cox模型的參數(shù)檢驗(yàn)、 Cox模型的意義解釋、 Cox模型的應(yīng)用和 Cox模型的 SAS分析實(shí)例( PHREG過程)。我們需要重點(diǎn)掌握乘積極限法和壽命表法、 Cox模型的意義和應(yīng)用,尤其是 Cox模型的意義和應(yīng)用(PHREG過程)。
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