6x射線衍射在藥學(xué)中的應(yīng)用(編輯修改稿)
2024-10-05 21:01 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 HHH3C H2CHHHHC H3O2134567891 01 11 21 31 41 51 61 7NH O HHHH3C H2CHHHHC H3H ONH OHHHH3C H2CHHHHC H3B r C6H4O C OL i A l H44 b r o m o b e n z o y l c h l o r i d e1 23NH OHHHH3C H2CHHHHC H3H O4C H3I+C l+C H3IJiang, et al. J. Mol. Struct. 2024, 966(13), 1822. 第二十頁，共四十五頁。 中間產(chǎn)物 2的絕對構(gòu)型分析 Flack parameter x= 3(2) Flack parameter x= 4(2) 第二十一頁，共四十五頁。 產(chǎn)物 3的絕對構(gòu)型分析 Flack parameter x= (1) 第二十二頁，共四十五頁。 產(chǎn)物 4的絕對構(gòu)型分析 Flack parameter x= () 絕對構(gòu)型與產(chǎn)物 3一致 第二十三頁，共四十五頁。 Absolute configuration of stenine C1 S C9 R C9a R C10 R C11 R C12 R C13 S Jiang, et al. J. Mol. Struct. 2024, 966(13), 1822. 第二十四頁，共四十五頁。 單晶 X射線衍射測定天然產(chǎn)物絕對構(gòu)型的局限性 ? 能否得到合用的單晶〔制約環(huán)節(jié)〕 第二十五頁，共四十五頁。 2〕如晶體屬于含對稱中心和對稱面的空間群，不能測定絕對構(gòu)型，例如： 三斜： P1； 單斜： P21/c； C2/c 正交： Pbca P1 外消旋體 Jiao, et al. J. Nat. Prod. 2024, 73(2), 167171. 需要折分 第二十六頁，共四十五頁。 ? 3) 局部 Cuk 輻射數(shù)據(jù)，其最終絕對構(gòu)型因子大于 ，或偏差較大，難以判斷其絕對構(gòu)型?？赡茉蛴校汉?、氧比例低，測定時(shí)沒有用低溫。 ?解決方法：可用前面的引入局部已知構(gòu)型、引入重原子或與手性試劑共結(jié)晶等方法，也可降低衍射數(shù)據(jù)收集時(shí)的溫度。 第二十七頁，共四十五頁。 4 構(gòu)象分析 ? 從單晶 X射線衍射分析所得分子的立體結(jié)構(gòu)中 ,可以準(zhǔn)確地計(jì)算出被測化合物的構(gòu)象信息 : 即組成藥物分子骨架各環(huán)的船或椅式構(gòu)象、環(huán)與環(huán)間的順反聯(lián)接方式、環(huán)自身的平面性質(zhì)、環(huán)與環(huán)間的扭轉(zhuǎn)角、側(cè)鏈的相對取向位置、大環(huán)構(gòu)象等。 Tetrahedron Letters 2024, 43, 24152418 第二十八頁，共四十五頁。 5 氫鍵、鹽鍵、配位鍵等的計(jì)算與分子排列規(guī)律 ? 氫鍵、鹽鍵、配位鍵等是研究藥物分子生物活性中的重要信息。利用單晶 X 射線衍射分析結(jié)果 ,可以準(zhǔn)確地計(jì)算出藥物分子的氫鍵、鹽鍵、
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