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正文內(nèi)容

基于語義技術的電子病歷doc-在線瀏覽

2024-08-28 01:05本頁面
  

【正文】 具有唯一的語義含義,并歸納到19個層級結構中,還有1,360,000種語義關聯(lián)。圖 123 SNOMED 的概念分類與語義關聯(lián)(請俞老師刪除公司標記和PPT模板)(4)電子病歷中的語義共識不同廠商開發(fā)的電子病歷都是異構系統(tǒng),如何使其中的自由文本語言做到語義上的共識,只有靠本體映射的方法來實現(xiàn)。本體映射的關鍵有兩點:一是對病歷內(nèi)容分解的粒度能獨立匹配;二是特定的語境,包括醫(yī)學領域、上下文提示、語言習慣等。通過上下文的語境和概念的關聯(lián),進行本體映射,就可以得到正確的語義解釋。(1)識別出三處心絞痛癥狀含義20080220 08:00患者***,今日無訴有 心絞痛 發(fā)作,服用抗心絞痛藥物已經(jīng)4天,體格檢查:HR 84次/分,節(jié)律齊,聽診心臟無雜音。 (2)識別出兩處心絞痛診斷含義圖 124 利用本體映射達到醫(yī)學知識語義共識2005年我們與荷蘭鹿特丹鹿特丹Erasmus大學進行了一項關于本體映射的研究,將中國100多份心臟科病歷譯成英文,將其用結構化數(shù)據(jù)錄入,然后采用Collexis 元素搜索引擎向SNOMED映射,進行機械配對,以探討電子病歷內(nèi)容被SNOMED術語匹配表覆蓋比例。證明本體映射的可信度。(5)電子病歷中醫(yī)學知識的推理臨床決策支持(CDSS)是電子病歷的重要功能,其關鍵就是能夠依據(jù)臨床醫(yī)學原理,對患者的病歷數(shù)據(jù)進行知識推理。如圖125所示。右圖顯示ST段下降,T波倒置,提示心電圖的“心絞痛”診斷。綜合分析左右兩份病歷,可以發(fā)現(xiàn)根據(jù)特征性的“癥狀(胸痛) + 實驗室檢查(心電圖、心肌酶)→臨床診斷(心肌梗塞或心絞痛)”,形成另一種推理途徑。第三層是語義數(shù)據(jù)處理工作流,它包含了五種核心語義處理工具,對底層的數(shù)據(jù)進行全盤語義技術處理。以上功能是雙向的,即自然語言書寫的、或半結構化的電子病歷也可以通過自上而下的流程被語義技術識別、理解、處理、應用。圖127 基于語義技術的電子病歷中各醫(yī)學本體的語義關系 基于語義技術的電子病歷使用方法根據(jù)上述設計原理和病歷模型,使用方法如下:1)醫(yī)生利用衛(wèi)生部制定的格式化的病歷模板上,在相應欄目(如主訴、現(xiàn)病史、體格檢查……)用Word文檔類形式錄入病歷內(nèi)容。形成基于語義的若干個三元組。綜合起來,對這段語義就可以得到唯一正確的語義理解。當然,也可以具有其他功能,如統(tǒng)計分析、查詢檢索等等。 基于語義技術電子病歷研發(fā)的基礎和問題 1)基于語義電子病歷研發(fā)的基礎①語義具有領域性特征,自然語言的理解易于建立在有限的詞匯、句型和特定的主題范圍內(nèi),電子病歷具有明確的“域”,即臨床醫(yī)學。 ②對于醫(yī)學知識已創(chuàng)建了許多近似醫(yī)學本體的分類系統(tǒng)或術語庫,如SNOMED、UMLS等。所以迄今為止,生物醫(yī)學領域是語義技術應用規(guī)模最大且技術探索最為活躍的領域之一。②醫(yī)學是一個廣闊、復雜的領域,盡管在基因等領域獲得極大成功,但在臨床醫(yī)學領域還存在大量未知的問題。 語義技術在電子病歷發(fā)展中的重要作用語義技術對電子病歷中的發(fā)展帶來巨大的變革,其重要作用如下:醫(yī)生采用自由文本錄入的方式,較結構化錄入更方便、快捷,減輕病歷書寫負擔、提高效率。語義標注等功能使電子病歷的內(nèi)容真正為計算機自動識別與理解。有利于從語義角度準確、自動地閱讀理解病歷,檢索資料,用于臨床科研。醫(yī)生不必改變他們習慣的病歷記錄方式,不受病歷結構化的限制,可以自由地思維和創(chuàng)新。第四節(jié) 基于語義技術的電子健康檔案(董建成)電子健康檔案是人們在健康相關活動中直接形成的具有保存?zhèn)洳閮r值的電子化歷史記錄。電子健康檔案全面、連續(xù)記錄個人身體指標、體檢指標、疾病史、用藥史、手術史、過敏藥物、家庭病史、吸煙史、飲酒史等的電子文檔、圖形信息記錄。2007年,致力于衛(wèi)生信息標準開發(fā)的國際組織HL7宣布《電子健康檔案系統(tǒng)功能(ANSF/HL7 HER)》獲得美國國家標準局(ANSI)正式批準,成為世界上第一個關于電子健康檔案的國家標準。我國電子健康檔案相關研究起步稍晚,但隨著衛(wèi)生改革的日益深入、人們對社區(qū)衛(wèi)生服務的要求越來越高,作為社區(qū)衛(wèi)生服務重要組成部分之一的健康檔案工作也日益受到重視。標準統(tǒng)一、數(shù)據(jù)準確、更新頻率合理的電子健康檔案系統(tǒng)中存儲的龐大數(shù)據(jù)信息對衛(wèi)生防疫管理機構、醫(yī)療機構和個人都有重要的意義。盡管在其開發(fā)過程中將遇到許多難點和待開發(fā)的研究領域,但是其理論、方法和探索過程對于計算機本體語義技術和醫(yī)學生物學科未來的發(fā)展均有著較大的意義。一、電子健康檔案文獻信息資源結構分析電子健康檔案記錄的是人們在健康相關活動中直接形成的具有保存?zhèn)洳閮r值的電子化歷史記錄,主要由各種關系表組成,包括居民基本信息表、居民體檢表、居民輔助檢查表、社區(qū)醫(yī)生表、兒童信息表、兒童體檢表、家庭信息表、婦科保健信息表、婦科檢查治療表、孕婦信息表、常見疾病表、保健信息表、慢性病人信息表、流行病信息表、慢性病人發(fā)病記錄表、慢性病人體檢表等,如圖121 電子健康檔案關系表圖121所示。然而,未經(jīng)過信息抽取加工和語義處理的數(shù)據(jù)庫其表與表之間雖然存在著一定的關聯(lián)度,但是表與表之間的數(shù)據(jù)較孤立,只適合進行宏觀的統(tǒng)計學意義上的統(tǒng)計,其挖掘度和智能性不強。本體具有良好的概念層次結構和對邏輯推理的支持,具有通過概念之間的關系來表達概念語義的能力,能較好地為語義檢索和概念檢索提供知識基礎。在創(chuàng)建本體之前,首先需要確定本體的專業(yè)領域和范疇,明確該本體的目的和專業(yè)領域,應用本體的目的,確定本體中信息涉及的問題。在此基礎上,需要充分考慮健康檔案知識庫的內(nèi)容特征進行基于醫(yī)學分類體系的本體類的定義和類的等級體系界定,確定其屬性特征。醫(yī)學本體中醫(yī)本體西醫(yī)本體醫(yī)學共性本體西醫(yī)槽類西醫(yī)概念類疾病屬性類化學物質(zhì)類疾病類診斷類器官類病理屬性類診斷屬性類病因?qū)傩灶悎D122 醫(yī)學本體體系醫(yī)學是關于疾病防治及人類健康保健的科學,因此在醫(yī)學知識中,最重要的以及最核心的知識就是關于疾病的知識。疾病概念涉及到病理、生理、解剖、實驗室檢查、治療、統(tǒng)計和分類等各個方面。進行領域本體的構建首先要確立該領域中的關鍵概念。在此基礎上,通過本體構建工具(如Prot233。)便可以輕松進行本體構建。(一)多學科融合基于本體的健康檔案知識庫的建設是集醫(yī)學、計算機學、統(tǒng)計學和美術設計等多學科為一體的綜合性項目,主要是計算機和醫(yī)學兩大學科的融合。專業(yè)知識的缺乏將導致平臺在設計和創(chuàng)建過程中會出現(xiàn)功能缺陷或?qū)I(yè)性錯誤。除此之外,統(tǒng)計學和情報學專業(yè)人才也需要擴充到團隊中去,并充分聽取醫(yī)生、病人及各層次其他使用者的意見,使其功能和界面能滿足用戶的需求。其他專業(yè)領域的本體或通用本體也不能照搬到醫(yī)學領域的本體上來。在語義抽取的時候,可利用分詞工具、詞意消歧工具、術語及關系提取工具等計算機手段來提高效率,但是在準確性問題上,需要人工參與,確保語義抽取的準確。龐大的數(shù)據(jù)量雖然具有極其優(yōu)良的研究價值,但是如果因此而侵犯到個人隱私,也是不道德的。四、基于語義的電子健康檔案知識庫的挖掘價值數(shù)據(jù)挖掘技術可以使得用戶從大量的、不完全的、有噪聲的、模糊的、隨機的實際應用數(shù)據(jù)中采掘出隱含的、先前未知的、對決策有潛在價值的知識和規(guī)則的過程,主要技術有分類、聚類、關聯(lián)規(guī)則挖掘、特征與偏差、時序模式發(fā)現(xiàn)、趨勢分析等等。這些數(shù)據(jù)挖掘技術在電子健康檔案上有著很廣泛的應用前景,在電子健康檔案知識庫建成的基礎上,利用挖掘技術可實現(xiàn)電子健康檔案的網(wǎng)絡瀏覽、文本檢索、文檔總結等功能。比如:某個人的健康檔案中顯示患有高血壓,電子健康檔案知識庫里將在網(wǎng)頁上提供有關高血壓癥
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