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正文內(nèi)容

基于語義技術(shù)的電子病歷doc-展示頁

2024-08-02 01:05本頁面
  

【正文】 推理從心電圖的知識(shí)概念來看,左圖顯示ST段弓背向上抬高,Q波呈病理性倒置,推導(dǎo)出心電圖的“心肌梗塞”診斷。應(yīng)用語義技術(shù)進(jìn)行知識(shí)推理有三個(gè)層次:首先是遵循三元組之間的關(guān)系,在RDF層的推理;第二是本體層推理;最后是醫(yī)學(xué)知識(shí)驅(qū)動(dòng)性的邏輯層推理。該論文發(fā)表在美國(guó)2006年醫(yī)學(xué)信息方法雜志。經(jīng)多次試驗(yàn),可接近75%的匹配度。張主任醫(yī)師查房意見:患者經(jīng)4治療后 心絞痛 癥狀緩解,治療方案有效,同意勞力性心絞痛 診斷。20080216 16:00 患者***,今日仍訴有 心絞痛 發(fā)作,體格檢查:HR 86次/分,節(jié)律齊,心電圖提示ST段下移,王主任醫(yī)師查房,認(rèn)為心絞痛診斷成立。圖124是一位患者兩天的病程記錄,出現(xiàn)了5個(gè)完全一樣的“心絞痛”醫(yī)學(xué)詞匯,但是第1組三個(gè)“心絞痛”表示癥狀,第2組的二個(gè)“心絞痛”表示診斷,語義截然不同。本體映射的基本原理是發(fā)現(xiàn)兩個(gè)異構(gòu)本體內(nèi)實(shí)體之間是否存在相關(guān)性,即進(jìn)行相關(guān)度匹配,如果高度匹配,則表示電子病歷中某一實(shí)體與所映射的本體的某一數(shù)據(jù)(或術(shù)語)具有一致的語義。這些為語義電子病歷提供了標(biāo)準(zhǔn)化的基礎(chǔ)。最適用于電子病歷的有SNOMED(系統(tǒng)化臨床醫(yī)學(xué)術(shù)語集)、ICD(國(guó)際疾病分類)、LOINC(檢驗(yàn)報(bào)告邏輯命名與編碼系統(tǒng))等。醫(yī)學(xué)術(shù)語在本質(zhì)上就是醫(yī)學(xué)概念的語言符號(hào),醫(yī)學(xué)分類系統(tǒng)是將相關(guān)的自然語言列入分類范疇,是一種按醫(yī)學(xué)概念或原理序化整理的邏輯系統(tǒng),是一種聚合的術(shù)語。(3)電子病歷醫(yī)學(xué)概念的標(biāo)準(zhǔn)化醫(yī)學(xué)概念的標(biāo)準(zhǔn)化是電子病歷的基礎(chǔ)。③ 本體主要是由計(jì)算機(jī)可應(yīng)用的數(shù)學(xué)方式來表達(dá)的,因此電子病歷中的醫(yī)學(xué)知識(shí)以本體表達(dá)后就可以用EMRS進(jìn)行處理。它們?cè)陔娮硬v中的作用有如下特點(diǎn):① 由于醫(yī)學(xué)本體精確定義了醫(yī)學(xué)知識(shí)概念和概念間的關(guān)系,就可以使電子病歷系統(tǒng)正確識(shí)別和理解自由文本中的信息,消除信息的歧義、多義和同義,而依據(jù)本體概念間的關(guān)系有利于進(jìn)行正確的邏輯推導(dǎo)。針對(duì)特定知識(shí)領(lǐng)域又開發(fā)了各種本體Ontology,表達(dá)了某一領(lǐng)域概念的標(biāo)準(zhǔn)化。有關(guān)設(shè)計(jì)原理如下。局限性:醫(yī)學(xué)本身有許多未知領(lǐng)域,每一個(gè)患者有其獨(dú)特的臨床表現(xiàn),嚴(yán)格的結(jié)構(gòu)化錄入難以涵蓋復(fù)雜多變的臨床表現(xiàn),會(huì)限制醫(yī)生的創(chuàng)造性思維,阻礙對(duì)醫(yī)學(xué)未知領(lǐng)域的發(fā)現(xiàn)和思考。(5)歧義性:自然語言文本各個(gè)層次存在歧義性或多義性,特別是方塊形漢語單詞切分的難題,即“字—詞—詞組—句子—段”的判斷,而消除歧義現(xiàn)象需要大量的知識(shí)和推理。利用結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)人為設(shè)置所有醫(yī)學(xué)知識(shí)的邏輯推理也是難以解決的,即無法根據(jù)臨床醫(yī)學(xué)的驅(qū)動(dòng)進(jìn)行正確推理。(3)知識(shí)驅(qū)動(dòng)性:臨床醫(yī)學(xué)是是一個(gè)龐大深?yuàn)W的領(lǐng)域,數(shù)百年理論研究和經(jīng)驗(yàn)積累已形成一個(gè)規(guī)范化的體系。(2)關(guān)聯(lián)性:電子病歷海量信息之間的復(fù)雜的邏輯關(guān)系如何表示?復(fù)雜多變、又嚴(yán)謹(jǐn)規(guī)范的臨床醫(yī)學(xué)知識(shí)如何推理?例如“急性單純性闌尾炎”,若用結(jié)構(gòu)化劃分:“急性”指疾病的分期;“單純性”指疾病的分型,不含其它合并癥;“闌尾”指解剖部位;“炎癥”指病理改變。(1)組合性:病歷內(nèi)容都是由多個(gè)詞匯組合的,的為了表達(dá)病歷中海量的醫(yī)學(xué)知識(shí)的含義,結(jié)構(gòu)化通過切分這些知識(shí),直到基本的詞或術(shù)語(常是自定義的,或非標(biāo)準(zhǔn)的),而它們并不能表達(dá)精確的、獨(dú)一無二的語義。它的最大優(yōu)勢(shì)就是病歷的部分內(nèi)容能被計(jì)算機(jī)識(shí)別和理解,從而可以處理、應(yīng)用。這些數(shù)據(jù)必須根據(jù)其內(nèi)在概念的序化或原理的序化已被準(zhǔn)確地分類和編碼,并歸屬于某一醫(yī)學(xué)分類系統(tǒng)中。結(jié)構(gòu)化模型為分層次結(jié)構(gòu),它的前三層表達(dá)了病歷規(guī)范的格式,后幾層表達(dá)了疾病的臨床醫(yī)學(xué)知識(shí)和診斷治療的規(guī)律(如圖121所示)。為了研制出“計(jì)算機(jī)能識(shí)別和理解的”的電子病歷,目前有兩條途徑:結(jié)構(gòu)化的電子病歷和基于語義技術(shù)的電子病歷。闡明電子病歷的本質(zhì)是研究的核心和關(guān)鍵問題。電子病歷系統(tǒng)(electronic medical record system, EMRS)是:“指記錄、檢索、處理電子健康信息的系統(tǒng)。. . . . .電子病歷(electronic medical record, EMR)是以電子化方式管理的個(gè)人醫(yī)療保健信息,涉及保健和臨床信息的采集、存儲(chǔ)、傳輸、處理和利用。它可在醫(yī)療衛(wèi)生服務(wù)中作為主要的信息源,取代紙張病歷,滿足所有的醫(yī)療、管理和法律的需求(美國(guó)國(guó)立醫(yī)院研究所的定義)?!保?003年ISO/TC215的定義)回顧電子病歷的發(fā)展,經(jīng)歷了電子化的病歷文檔(包括手工錄入、語音錄入,計(jì)算機(jī)掃描等方式)、表格式的電子病歷,到結(jié)構(gòu)化的電子病歷。早在1997年美國(guó)Richard : 電子病歷決不只是利用計(jì)算機(jī)將紙質(zhì)病歷移植為電子載體,而是將紙質(zhì)病歷中文字的、圖表的信息變?yōu)橛?jì)算機(jī)能識(shí)別和理解的格式化數(shù)據(jù)予以輸入、存儲(chǔ)、處理、查詢。1)結(jié)構(gòu)化電子病歷概念與優(yōu)勢(shì)基于結(jié)構(gòu)化的電子病歷主要由結(jié)構(gòu)化的模型與結(jié)構(gòu)化的數(shù)據(jù)組成。結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)是指能夠用數(shù)字或統(tǒng)一的數(shù)據(jù)模型加以描述的數(shù)據(jù),具有嚴(yán)格的長(zhǎng)度和格式。通常采用開放式結(jié)構(gòu)化錄入(SDE)方法錄入電子病歷中(如圖122所示)。圖121 結(jié)構(gòu)化電子病歷模型的多層結(jié)構(gòu)示意圖圖 122 結(jié)構(gòu)化錄入的用戶界面2)結(jié)構(gòu)化電子病歷的問題完全結(jié)構(gòu)化的電子病歷是一個(gè)理想的目標(biāo),但要實(shí)現(xiàn)它存在下列一些難以解決的問題。而這種人工的切分既耗時(shí)費(fèi)力,又缺乏標(biāo)準(zhǔn)。因此人為設(shè)置這些變化多端的相互關(guān)聯(lián)是非常困難的。例如“冠心病”診斷依據(jù)必須具有特征性的心絞痛癥狀、典型心電圖表現(xiàn)和特定的心肌酶變化。(4)全面性:電子病歷除了醫(yī)學(xué)知識(shí),還也包含大量的日常用語信息也需要語義識(shí)別,例如現(xiàn)病史、病程記錄中描述性的自然語言,例如“酒駕”、“交通事故”等遠(yuǎn)超出醫(yī)學(xué)術(shù)語范疇。例如:一只 手提 除顫器一只手提除顫器 (數(shù)量詞 形容詞 名詞) (詞組)一只 手 提 除顫器(修飾詞)(主語)(謂語)(賓語) (句子)方便性:要求醫(yī)生放棄傳統(tǒng)的、習(xí)慣的文本錄入方式,采用完全結(jié)構(gòu)化錄入是一件既耗費(fèi)時(shí)間、又類似機(jī)械性的操作,必然受到他們的反感乃至抵制。例如,2003年前誰會(huì)設(shè)計(jì)一個(gè)“非典型肺炎”的結(jié)構(gòu)化病歷呢? 基于語義技術(shù)的電子病歷的設(shè)計(jì)原理結(jié)構(gòu)化電子病歷的上述問題促使我們?nèi)ふ伊硪粭l途徑,這就是基于語義技術(shù)的電子病歷。(1) 醫(yī)學(xué)本體知識(shí)在電子病歷中的應(yīng)用我們已經(jīng)介紹了語義技術(shù)是采用國(guó)際統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)的基于語義的數(shù)據(jù)表達(dá)語言,如元數(shù)據(jù)RDF/RDFs和OWL本體語言的表達(dá)方式,OWL是RDF/RDFs的進(jìn)一步擴(kuò)充,主要增加了邏輯運(yùn)算描述能力等許多特征。因此,醫(yī)生可以用自由文本的方式書寫電子病歷,由語義技術(shù)將病歷中的醫(yī)學(xué)信息逐步拆分到基本的顆?!t(yī)學(xué)元數(shù)據(jù)或醫(yī)學(xué)本體。② 由于電子病歷必須與許多異構(gòu)的醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)(如實(shí)驗(yàn)室系統(tǒng)、影像系統(tǒng)、區(qū)域衛(wèi)生系統(tǒng)等)實(shí)現(xiàn)信息的互操作,醫(yī)學(xué)本體對(duì)知識(shí)唯一、精確的描述有利于信息在語義層次的共享、交互、檢索和重用。(2)電子病歷中知識(shí)的標(biāo)識(shí)電子病歷中的醫(yī)學(xué)概念和日常用語概念在轉(zhuǎn)化為RDF或OWL后都被賦予唯一的語義,并被分配到一個(gè)唯一的標(biāo)識(shí)符,即統(tǒng)一的資源定位URL,這就為電子病歷對(duì)醫(yī)學(xué)知識(shí)、數(shù)據(jù)資源的快速準(zhǔn)確訪問、識(shí)別和交互奠定了基礎(chǔ)。醫(yī)學(xué)本體就是對(duì)醫(yī)學(xué)概念的標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá),但這種概念是分散的,概念間的關(guān)系是多向的,并不適用于電子病歷對(duì)臨床診斷、治療的專業(yè)要求。UMLS就是一個(gè)接近上層本體的分類系統(tǒng)。以SNOMED為例,它涵蓋了醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域的311,000個(gè)概念都
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