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正文內(nèi)容

藥物代謝酶及藥物作用靶點(diǎn)基因檢測(cè)技術(shù)指南[試行]doc(編輯修改稿)

2024-08-27 20:58 本頁(yè)面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 后者利用熒光染料或特殊設(shè)計(jì)的引物來(lái)指示擴(kuò)增產(chǎn)物的增加。Taqman探針?lè)ㄍ瑫r(shí)綜合了5’端核酸酶活性和熒光等技術(shù),其在反應(yīng)過(guò)程使用4條寡核苷酸鏈,其中兩條為等位基因特異性探針,兩條為PCR引物。兩條探針可分別與突變型和野生型模板互補(bǔ),其兩端分別應(yīng)用含報(bào)告基團(tuán)和淬滅基團(tuán)的染料進(jìn)行標(biāo)記,兩條探針的報(bào)告基團(tuán)熒光染料不一樣。在進(jìn)行SNP檢測(cè)時(shí),PCR擴(kuò)增的退火過(guò)程導(dǎo)致探針與模板雜交結(jié)合,當(dāng)引物延伸至探針處時(shí),DNA聚合酶的5’端外切酶活性將探針的5’端報(bào)告基團(tuán)從探針上切除,使之與淬滅基團(tuán)分離,從而釋放出相對(duì)應(yīng)的熒光,而沒(méi)有配對(duì)的探針仍然保持完整而不會(huì)發(fā)熒光。不同的等位基因探針由于標(biāo)記的熒光染料不同,因此所發(fā)熒光信號(hào)不同,可通過(guò)對(duì)熒光信號(hào)的檢測(cè)判斷樣本的基因型。實(shí)時(shí)熒光PCR法靈敏度高,分型準(zhǔn)確,操作簡(jiǎn)便快捷,所用儀器容易普及,易于推廣使用。但該方法通量不高,探針成本較高,單個(gè)位點(diǎn)的檢測(cè)成本與樣本量有關(guān),樣本量越小,成本越高。本方法主要適于對(duì)少量位點(diǎn)、大樣本進(jìn)行分型。目前CFDA已批準(zhǔn)CYP2CVKORC1等多種基因多態(tài)性檢測(cè)的PCR熒光檢測(cè)試劑盒。4)PCR基因芯片法該方法以特定的寡核苷酸片段作為探針,將其有規(guī)律地排列固定于支持物上,然后將樣品DNA通過(guò)PCR擴(kuò)增、熒光標(biāo)記等程序,按堿基配對(duì)原理與芯片雜交,再通過(guò)熒光檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)芯片上的熒光信號(hào)進(jìn)行檢測(cè)和分析,從而迅速獲得個(gè)體的基因型信息?;蛐酒中头ǖ牟僮鬟^(guò)程包括PCR核酸擴(kuò)增、雜交、芯片掃描和結(jié)果分析。該方法用于DNA基因分型時(shí)屬于定性檢測(cè),靈敏度為50 ng/μL?;蛐酒ǚ治鰰r(shí)需設(shè)置陰性對(duì)照和陽(yáng)性質(zhì)控品。應(yīng)用基因芯片檢測(cè)試劑盒時(shí)應(yīng)確保試劑在開(kāi)封前按要求保存、各組分液體使用前振蕩混勻,雜交和洗片操作務(wù)必在避光條件下進(jìn)行,PCR反應(yīng)液和定位參照需避光保存,芯片加樣時(shí)注意使液體鋪滿(mǎn)整個(gè)反應(yīng)區(qū),但不能溢出、不能出現(xiàn)氣泡,以防交叉污染。其主要優(yōu)點(diǎn)是可同時(shí)對(duì)多個(gè)待測(cè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)。我國(guó)CFDA已批準(zhǔn)多種用于藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因如ALDHCYP2CCY2C1CYP2DADRACE、VKORC1多態(tài)性檢測(cè)的基因芯片試劑盒。5)PCR電泳分析該方法是指對(duì)待分析的目的基因片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳或毛細(xì)管電泳分析,根據(jù)PCR產(chǎn)物的大小對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。該方法屬于定性檢測(cè),且只能用于對(duì)已知的多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè),不能識(shí)別未知多態(tài)性。瓊脂糖電泳法適用于對(duì)片段較長(zhǎng)的插入缺失多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè),如ACE插入缺失多態(tài)性;毛細(xì)管電泳法適于對(duì)較短的插入缺失多態(tài)性如UGT1A1*28多態(tài)性和微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)進(jìn)行檢測(cè)。PCR過(guò)程中需建立陽(yáng)性質(zhì)控品和陰性質(zhì)控品,電泳分析時(shí)需同時(shí)用分子量標(biāo)記物進(jìn)行片段大小的判斷。當(dāng)分子量標(biāo)記物反應(yīng)管無(wú)條帶或出現(xiàn)較弱的條帶時(shí),可能的原因包括點(diǎn)樣孔漏、熒光染料不夠或失效、電泳時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或電壓過(guò)大。該方法的優(yōu)點(diǎn)是成本低,在普通實(shí)驗(yàn)室即可開(kāi)展;缺點(diǎn)是只適合對(duì)DNA插入/缺失多態(tài)性或融合基因進(jìn)行定性測(cè)定,不能用于SNP的檢測(cè)。6)PCR高分辨率熔解曲線(HRM)法該方法通過(guò)對(duì)PCR反應(yīng)的熔解曲線分析進(jìn)行基因分型。PCR擴(kuò)增的熔解曲線取決于其擴(kuò)增序列,序列中一個(gè)堿基的差異都可導(dǎo)致雙鏈DNA的解鏈溫度發(fā)生變化。HRM法應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀監(jiān)測(cè)這種細(xì)微的溫度變化,確定所擴(kuò)增的目的片段中是否存在突變,從而用于基因分型。HRM分析使用LC Green等飽和熒光染料,該類(lèi)染料在飽和濃度時(shí)對(duì)PCR反應(yīng)無(wú)抑制作用,因此可以高濃度使用,從而全部結(jié)合DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)中的小溝。在雙鏈DNA的變性過(guò)程不存在熒光分子的重排,其特異度得到大幅提升,因此,熔解曲線細(xì)微的變化可以反映擴(kuò)增片段中堿基的差異。應(yīng)用本方法進(jìn)行基因分型屬于定性分析。該方法操作簡(jiǎn)便、快速、通量大、使用成本低、結(jié)果準(zhǔn)確,有利于實(shí)現(xiàn)閉管操作,在進(jìn)行甲基化檢測(cè)時(shí)可根據(jù)熔解曲線確定甲基化程度的高低。該方法的缺點(diǎn)是:不能排除待測(cè)核酸中新出現(xiàn)的遺傳變異;由于單個(gè)堿基突變導(dǎo)致DNA解鏈溫度的變化非常小,該方法對(duì)儀器的靈敏度和分辨率有較高要求。7)等位基因特異性PCR(Allelespecific PCR,ASPCR)又稱(chēng)為擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)PCR(Amplification Refractory Mutation System PCR,ARMSPCR)。該技術(shù)的基本原理:由于Taq DNA聚合酶缺乏3’到5’端的外切酶活性,3’端錯(cuò)配的堿基會(huì)導(dǎo)致引物延伸速度變慢,當(dāng)錯(cuò)配達(dá)到一定程度時(shí),引物延伸將終止,得不到特異長(zhǎng)度的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,從而提示模板DNA沒(méi)有與引物3’端配對(duì)的堿基,反之則有。因此,ASPCR反應(yīng)需要兩條等位基因特異的引物和一條共用的反向引物,兩條非特異性引物在3’端與模板錯(cuò)配,但其他部分堿基序列完全一樣。只有引物的3’端與模板完全配對(duì)時(shí),PCR擴(kuò)增才可以進(jìn)行。PCR產(chǎn)物可通過(guò)凝膠電泳進(jìn)行分析和基因型的判斷。該方法也可與實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)合起來(lái)進(jìn)行基因分型。該方法可以用于檢測(cè)各種類(lèi)型的SNP,其優(yōu)勢(shì)是靈敏度高,特別適合于對(duì)腫瘤組織中的體細(xì)胞突變進(jìn)行檢測(cè);缺點(diǎn)是假陽(yáng)性率較高。8)PCR限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性方法限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性方法(RFLP)是一種基于酶切原理的方法,是最早用于基因分型的經(jīng)典方法之一,現(xiàn)在仍被廣泛采用。該方法主要基于某些限制性?xún)?nèi)切酶可以特異性識(shí)別某一特定序列和結(jié)構(gòu)DNA,并對(duì)其進(jìn)行剪切的原理。限制性?xún)?nèi)切酶通常識(shí)別雙鏈DNA的某一特定序列,并在特定位置或者附近將雙鏈DNA切斷,從而產(chǎn)生較短的DNA片段。由于限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別序列的嚴(yán)格性,一個(gè)堿基的變化都可以導(dǎo)致酶切活性的消失。利用這一特性,若待分型的SNP位點(diǎn)在某一限制性?xún)?nèi)切酶的識(shí)別位點(diǎn)上,將會(huì)導(dǎo)致該酶只對(duì)其中的一種等位基因具有酶切活性。因此,對(duì)位于限制性酶切識(shí)別位點(diǎn)的SNP進(jìn)行分型時(shí),可以使用包含該位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物與相應(yīng)的限制性?xún)?nèi)切酶進(jìn)行溫育。酶切以后的產(chǎn)物進(jìn)行電泳,并根據(jù)酶切產(chǎn)物片段的大小來(lái)進(jìn)行基因分型。該方法不需要任何探針,也不需要特別的儀器設(shè)備,成本較低,實(shí)驗(yàn)過(guò)程簡(jiǎn)單,可操作性強(qiáng)。但缺點(diǎn)也很明顯,主要是通量太低,大量分型時(shí)工作量大,并且只適用于部分SNP分型。9)原位雜交(ISH)法ISH法以各種人體標(biāo)本,包括相應(yīng)實(shí)驗(yàn)方法制備的細(xì)胞學(xué)和組織學(xué)標(biāo)本(福爾馬林固定石蠟包埋)作為靶標(biāo),采用目的DNA探針與該靶標(biāo)進(jìn)行分子雜交,從而檢測(cè)相關(guān)的靶基因異常。ISH技術(shù)按照探針標(biāo)記物的類(lèi)型,可分為亮視野原位雜交和熒光原位雜交(FISH)。ISH法檢測(cè)的靶標(biāo)具有完整的細(xì)胞核,無(wú)需進(jìn)行核酸的提取。其具體的方法學(xué)原理見(jiàn)《原位雜交(ISH)指南》。在藥物代謝酶和靶點(diǎn)基因檢測(cè)中,ISH法主要用于測(cè)定基因擴(kuò)增和基因缺失異常。表1. 各種藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測(cè)技術(shù)優(yōu)缺點(diǎn)及適用性比較方 法優(yōu) 點(diǎn)缺 點(diǎn)適用性ASPCR靈敏度高,適于對(duì)腫瘤組織中突變比例較低的體細(xì)胞突變進(jìn)行檢測(cè)。通量低對(duì)小樣本、低突變比例的體細(xì)胞突變進(jìn)行檢測(cè)。實(shí)時(shí)熒光PCR通量較高,操作簡(jiǎn)單,儀器設(shè)備易普及。探針較昂貴對(duì)相同位點(diǎn)、大樣本標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),可用于mRNA表達(dá)檢測(cè)。焦磷酸測(cè)序高通量,高靈敏度,可以檢測(cè)插入/缺失突變和未知突變。等位基因含量的比例可用于室內(nèi)質(zhì)控。需要特殊儀器設(shè)備。適合于較大樣本、突變比例高于5%的各種類(lèi)型SNP檢測(cè)、甲基化位點(diǎn)的確定。HRM成本低,靈敏度高,閉管操作,降低污染風(fēng)險(xiǎn)。需要特殊儀器設(shè)備,條件摸索過(guò)程較為困難適合有該類(lèi)機(jī)器的實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展各種類(lèi)型SNP分型研究;可用于已知甲基化位點(diǎn)的檢測(cè)。Sanger法測(cè)序直接獲取序列,分型的金標(biāo)準(zhǔn),可發(fā)現(xiàn)未知突變。通量低,不能檢測(cè)突變比例小于20%的SNP。各種SNP的檢測(cè),未知突變的篩查以及驗(yàn)證其他分型的結(jié)果。PCRRFLP無(wú)需特殊的儀器設(shè)備,成本較低,實(shí)驗(yàn)過(guò)程簡(jiǎn)單,可操作性強(qiáng)。通量低,只適用于部分SNP分型適用于無(wú)條件夠買(mǎi)貴重儀器設(shè)備的實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展小樣本的分型檢測(cè)。基因芯片法通量高靈活度低,成本高,需要特殊的儀器設(shè)備。適用于具備芯片檢測(cè)能力的實(shí)驗(yàn)室對(duì)已知固定位點(diǎn)、大樣本標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)。原位雜交(ISH)在細(xì)胞核原位對(duì)基因的異常進(jìn)行檢測(cè)成本高,通量低,時(shí)間較長(zhǎng)。適于對(duì)基因擴(kuò)增和缺失異常進(jìn)行檢測(cè)。 藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測(cè)項(xiàng)目及類(lèi)型遺傳藥理學(xué)知識(shí)庫(kù)(PharmGKB)根據(jù)項(xiàng)目成熟程度將個(gè)體化用藥基因檢測(cè)項(xiàng)目分為4級(jí),并認(rèn)為其中1級(jí)項(xiàng)目(包括1A級(jí)和1B級(jí))滿(mǎn)足臨床應(yīng)用的最高標(biāo)準(zhǔn),而4級(jí)項(xiàng)目適于臨床應(yīng)用的證據(jù)最少[1]。1A級(jí)項(xiàng)目為同時(shí)獲臨床遺傳藥理學(xué)實(shí)施聯(lián)盟(Clinical Pharmacogenetics Implementation consortium,CPIC)、認(rèn)可CPIC藥物基因組學(xué)指南的醫(yī)學(xué)會(huì)、以及美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生研究院藥物基因組學(xué)研究網(wǎng)絡(luò)(Pharmagenomics Research Network,PGRN)認(rèn)同的項(xiàng)目,這類(lèi)項(xiàng)目通常經(jīng)大規(guī)模隨機(jī)對(duì)照臨床試驗(yàn)(RCT)對(duì)項(xiàng)目的意義進(jìn)行了論證;1B級(jí)項(xiàng)目有確切的臨床證據(jù)提示相關(guān)性,且這種相關(guān)性被具有一定樣本規(guī)模的研究所證實(shí),但還需進(jìn)一步的臨床證據(jù)。根據(jù)檢測(cè)項(xiàng)目所涉及的基因在影響藥物反應(yīng)中的作用機(jī)制和被測(cè)靶分子(DNA或RNA)的不同,個(gè)體化用藥分子檢測(cè)項(xiàng)目包括藥物代謝酶與轉(zhuǎn)運(yùn)體基因遺傳多態(tài)性檢測(cè)、藥物作用靶點(diǎn)基因遺傳變異檢測(cè)、其他基因變異檢測(cè)和藥物作用靶點(diǎn)基因mRNA表達(dá)檢測(cè)四種類(lèi)型(附錄C)。、維護(hù)與保養(yǎng)原則上按照《個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)質(zhì)量保證指南》的要求進(jìn)行。藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測(cè)涉及的儀器設(shè)備眾多,實(shí)驗(yàn)室可參考生產(chǎn)商提供的操作說(shuō)明書(shū)編寫(xiě)書(shū)面的、有案可查的預(yù)防性維護(hù)及校準(zhǔn)計(jì)劃,確定儀器設(shè)備的維護(hù)周期,建立儀器設(shè)備日常維護(hù)的SOP。對(duì)于某些計(jì)量分析儀器,應(yīng)依照我國(guó)計(jì)量法規(guī)定,由計(jì)量檢定機(jī)構(gòu)定期進(jìn)行校驗(yàn),并保存好校驗(yàn)證書(shū)。加熱系統(tǒng)及冰箱等設(shè)備的維護(hù)包括對(duì)溫度進(jìn)行監(jiān)測(cè)。儀器維護(hù)過(guò)程中要注意清潔劑的使用,尤其是儀器的光路系統(tǒng)。每臺(tái)儀器應(yīng)該配備專(zhuān)用的清潔工具。在例行儀器的維護(hù)和保養(yǎng)后,應(yīng)填寫(xiě)儀器維護(hù)保養(yǎng)記錄表。如維護(hù)中發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,應(yīng)及時(shí)匯報(bào)并將出現(xiàn)的問(wèn)題詳細(xì)記錄,最后由維護(hù)操作人員簽名。原則上按照《個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)質(zhì)量保證指南》的要求進(jìn)行。藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測(cè)通常要涉及試劑配制、核酸提取、儀器編程、結(jié)果分析和報(bào)告等步驟。操作人員需要有一定的專(zhuān)業(yè)技術(shù)知識(shí)和經(jīng)驗(yàn)才能獲得穩(wěn)定可靠的檢測(cè)結(jié)果。加強(qiáng)人員培訓(xùn)是確保檢測(cè)質(zhì)量的關(guān)鍵。人員培訓(xùn)分為入職培訓(xùn)、內(nèi)部培訓(xùn)和外部培訓(xùn)。通過(guò)培訓(xùn),讓操作人員掌握和建立安全操作的概念、“防污染”的概念、具備獨(dú)立進(jìn)行質(zhì)控活動(dòng)和儀器維護(hù)的能力,可對(duì)試劑和質(zhì)控品的出入庫(kù)及使用情況、設(shè)備保養(yǎng)等情況進(jìn)行準(zhǔn)確記錄,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。實(shí)驗(yàn)室工作人員在培訓(xùn)后書(shū)面確認(rèn)其已接受適當(dāng)?shù)呐嘤?xùn),閱讀并理解了相關(guān)SOP。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對(duì)實(shí)驗(yàn)室工作人員進(jìn)行處事能力考核和周期性能力再考核,定期開(kāi)展內(nèi)部培訓(xùn)。外部培訓(xùn)包括國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委臨床檢驗(yàn)中心和國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)培訓(xùn)基地等機(jī)構(gòu)組織開(kāi)展的各種技術(shù)培訓(xùn)。原則上按照《個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)質(zhì)量保證指南》的要求進(jìn)行。臨床檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用的體外診斷試劑包括國(guó)家藥品食品監(jiān)督管理總局(CFDA)批準(zhǔn)的試劑盒和國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)試點(diǎn)單位通過(guò)性能評(píng)定、具有嚴(yán)格標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程(SOP)的自配試劑(LDT)。所有試劑都需進(jìn)行性能評(píng)價(jià)。實(shí)驗(yàn)室所購(gòu)買(mǎi)的商業(yè)化的儀器應(yīng)根據(jù)說(shuō)明書(shū)進(jìn)行驗(yàn)證。在報(bào)告結(jié)果之前實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該證明其性能能夠滿(mǎn)足廠家規(guī)定的準(zhǔn)確度、精密度、線性與可報(bào)告范圍和參考區(qū)間。實(shí)驗(yàn)室還應(yīng)該為每個(gè)檢測(cè)系統(tǒng)建立性能規(guī)范,包括適用性、準(zhǔn)確度、精密度和分析特異性(包括干擾物質(zhì))、可報(bào)告范圍和其他重要特性,并根據(jù)性能規(guī)范確定系統(tǒng)的校準(zhǔn)和質(zhì)控程序,保持性能特征建立、校準(zhǔn)和質(zhì)控程序相關(guān)活動(dòng)的記錄。同時(shí)也需對(duì)檢驗(yàn)中的耗材進(jìn)行質(zhì)檢。個(gè)體化醫(yī)學(xué)分子檢測(cè)包括定性檢測(cè)和定量檢測(cè)。定性檢測(cè)的性能驗(yàn)證指標(biāo)主要包括重復(fù)性/精密度、準(zhǔn)確度(突變型的檢測(cè)能力)、分析特異性、檢出限等,可參考美國(guó)臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)的EPl2一A2文件進(jìn)行。定量檢測(cè)監(jiān)測(cè)體系性能驗(yàn)證的指標(biāo)主要包括準(zhǔn)確度、精密度、線性、可報(bào)告范圍、檢出限、參考區(qū)間、靈敏度、特異性等。準(zhǔn)確度的評(píng)價(jià)有兩種方法,一種方法是與標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)進(jìn)行比較,使用待評(píng)估的項(xiàng)目對(duì)已知標(biāo)準(zhǔn)的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)(如定性檢測(cè)中用到的陽(yáng)性參照品)進(jìn)行分析,將檢測(cè)結(jié)果與已知標(biāo)準(zhǔn)值進(jìn)行比較;第二種方法是同時(shí)用待評(píng)估項(xiàng)目與標(biāo)準(zhǔn)方法(或參考方法)對(duì)同一批次樣品進(jìn)行分析,然后將不同方法得到的結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析。精密度是指重復(fù)檢測(cè)條件下,獲得的獨(dú)立測(cè)量結(jié)果間的一致程度,是對(duì)檢測(cè)體系隨機(jī)誤差的一種度量,常用標(biāo)準(zhǔn)差表示,標(biāo)準(zhǔn)差越小精密度越好。定性檢測(cè)的精密度還包括一份陽(yáng)性或陰性樣本在多次檢測(cè)中,是否能得到可重復(fù)的陽(yáng)性或陰性結(jié)果。藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因變異檢測(cè)體系進(jìn)行準(zhǔn)確度、精密度等性能驗(yàn)證時(shí)所使用的參考物質(zhì)為各種突變型和野生型質(zhì)?;蛲蛔兗?xì)胞株。線性分析可直接分析已知濃度的樣品,也可將一定濃度的樣品進(jìn)行系列稀釋后,根據(jù)稀釋因子來(lái)研究檢測(cè)值與逐步下降的預(yù)期估計(jì)濃度之間是否存在線性。可報(bào)告范圍是能夠報(bào)告的可靠的最低和最高檢測(cè)結(jié)果,實(shí)驗(yàn)室可通過(guò)“多點(diǎn)法”進(jìn)行簡(jiǎn)單驗(yàn)證,推薦應(yīng)用5個(gè)不同濃度水平的樣品進(jìn)行驗(yàn)證。LoD是指可被檢測(cè)體系檢出的最低檢測(cè)濃度,又稱(chēng)最小檢測(cè)濃度或檢測(cè)底限。建立和驗(yàn)證LoD時(shí),需同時(shí)建立、驗(yàn)證空白檢測(cè)限。檢出限一般由廠家、方法建立者完成,實(shí)驗(yàn)室LDT試劑應(yīng)確立方法的LoD。臨界值是鑒別樣品、作為判斷特定疾病、狀態(tài)或被測(cè)量物存在與否的界限的量值。測(cè)量結(jié)果高于臨界值判斷為陽(yáng)性,低于臨界值判斷為陰性,接近臨界值判斷為非確定性。臨界值的選擇決定檢驗(yàn)的診斷特異性和診斷靈敏度。目前已有部分臨床治療指南將藥物靶點(diǎn)基因的mRNA表達(dá)水平高低(如ERCC1和RRM1)作為指導(dǎo)用藥的依據(jù),然而目前對(duì)待測(cè)靶mRNA表達(dá)水平臨界值的確定尚未明確。分子診斷實(shí)驗(yàn)室可通過(guò)繪制受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic,ROC)確定診斷閾值,得到合適的敏感度和特異度。ROC曲線趨左上角靠近,曲線下面積
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