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5-蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測-資料下載頁

2025-09-24 10:05本頁面
  

【正文】 求解這些方程的解析解是極其困難的 用離散動力系統(tǒng)的方法來確定數(shù)值解 ? 問題 模擬蛋白質(zhì)折疊過程是非常消耗時(shí)間的 模擬 109 秒的蛋白質(zhì)折疊過程大約需要一天時(shí)間 蛋白質(zhì)的實(shí)際折疊時(shí)間大約在 104 秒的數(shù)量級或者更多 需要超級計(jì)算機(jī) 第三十五頁,共四十頁。 新的趨勢 混合預(yù)測方法 在比較建模法和折疊識別法中使用從頭預(yù)測法來預(yù)測局部難以找到模板的片斷 在從頭預(yù)測法中使用二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的結(jié)果和其他能看出結(jié)構(gòu)信息輔助建模 Metapredictor 使用多個(gè)預(yù)測方法 對收集的結(jié)果進(jìn)行綜合比較和分析 改進(jìn)收集的結(jié)果 第三十六頁,共四十頁。 本章小結(jié) ? 重點(diǎn)介紹一些常用的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析技術(shù) 獲取蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)方法 預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的理論方法 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測 ? 隨著蛋白質(zhì)分析技術(shù)的不斷深入,將促進(jìn)我們從系統(tǒng)生物學(xué)的層次全面了解蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能 第三十七頁,共四十頁。 Thanks for your attention! The end~ 第三十八頁,共四十頁。 用 Swissmodel分析如下序列,進(jìn)行三級結(jié)構(gòu)建模,取 3個(gè)結(jié)果,并分析所得模型 ? MSSGQCRSANAEDAQEFISDVERAIETLIIKNFHQSYSSVESNLAIGGKESTLTPSELRDLVTLLLKSSKPHLMPSNCGLEEKIASNLGSCKKNDSKLEEFRSFWAELLIGEAAKKSSVKLERPVRGH。 第三十九頁,共四十頁。 內(nèi)容總結(jié) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。對于具有 60%等同的序列,用上述方法所建立的三維模型非常準(zhǔn)確。一般如果序列的等同局部大于 30%,那么可以期望得到比較好的預(yù)測結(jié)果。〔 2〕一種適合于進(jìn)行序列 結(jié)構(gòu)比對的三維折疊信息的表示方法。〔 3〕一個(gè)序列 結(jié)構(gòu)匹配函數(shù),該函數(shù)對匹配程度進(jìn)行打分?!?4〕建立最優(yōu)線索的策略,或者是進(jìn)行序列 結(jié)構(gòu)比對的策略。 Cij為第 i個(gè)核心區(qū)域第 j個(gè)氨基酸位置。 g3 ( ,t)評價(jià)環(huán)區(qū),根據(jù)環(huán)區(qū)的大小進(jìn)行打分 第四十頁,共四十頁。
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