蛋白質的三維結構(1)-資料下載頁
2025-05-01 18:19本頁面
【正文】 ATP酶結構域和肽結合結構域 New view bines energy landscape with classic framework mechanism to require an obligatory nucleus along the pathways Energy landscape Carbamate carboxylate activation Rubisco Activase: an ATPase。 causing a conformational change in Rubisco from a close to an open form。 allowing release of tightly bound substrate (RuBP leaving the active site), promoting carbamate formation. inhibitors Rubisco activase 圖 546 (一 ) 蛋白質的變性 (二 )氨基酸序列規(guī)定蛋白質的三維結構 (三 ) 蛋白質折疊的熱力學 (四 )蛋白質折疊的動力學 (五 )蛋白質結構的預測 Glu、 Met、 Ala、 Leu在 α螺旋中出現(xiàn)頻率高 。 Gly、Pro、 Ser、 Thr、 Asn、 Ile不利于 α螺旋的形成 ； Gly、 Pro在 β 轉角中很高。 Val、 Ile 及芳香族氨基酸在 β折疊片中頻率高 。而Asp、 Glu、和 Pro則很 低 。 Chou和 Fasman二級結構預測的經(jīng)驗規(guī)則： （殘基傾向性因子） Pi=Ai/Ti (1)α螺旋預測： 4/6→4,P α≥, Pα P β (2) β折疊預測： 3/5 →4 (3) β轉角預測： Pt≥, Pα和 P β 其他預測法： GOR算法，多序列列線預測，基于神經(jīng)網(wǎng)絡的序列預測，混合方法等。 — 折疊的計算機模擬 十、亞基締合和四級結構 ? 關于蛋白四級結構的一些概念： ? 蛋白質的四級結構是指由多條各自具有一、二、三級結構的肽鏈通過非共價鍵連接起來的結構形式；各個亞基在這些蛋白質中的空間排列方式及亞基之間的相互作用關系。 ? 這種蛋白質分子中，最小的單位通常稱為亞基或亞單位 Subunit，它一般由一條肽鏈構成，無生理活性； ? 維持亞基之間的作用力主要是疏水相互作用。 ? 由多個亞基聚集而成的蛋白質常常稱為寡聚蛋白或多聚蛋白；由一個亞基組成無四級結構的稱為單體蛋白質。 有關四級結構的一些概念 同多聚蛋白質由單一類型亞基組成的蛋白質稱同多聚 (homomultimeric) 蛋白質 ?雜多聚蛋白質 由幾種不同類型的亞基組成的蛋白質稱雜多聚（ heteromultimeric）蛋白質。如血紅蛋白 (α2β2)、天冬氨酸轉甲酰酶 (r6c6)等。 ?對稱寡聚蛋白質 可視為由兩個或多個不對稱的相同結構成分組成，這種相同結構成分被稱為原聚體或原體 (protomer)。同多聚蛋白質中原體就是亞基，但是雜多聚蛋白質中原體由兩種或多種不同的亞基組成。如血紅蛋白 (α2β2)的原體是 αβ。因此把原體看作單體，血紅蛋白為二聚體，亞基為單體，血紅蛋白是四聚體。 ?蛋白質四級結構內容 亞基種類和數(shù)目以及各亞基或原聚體在整個分子中的空間排布，包括亞基間的接觸位點和作用力。大多數(shù)寡聚蛋白質分子中亞基數(shù)目為偶數(shù)，其中以 2個和 4個為主。個別的為奇數(shù)。如熒光素酶分子含 3個亞基。 四級締合在結構和功能上的優(yōu)越性 ? 增強結構穩(wěn)定性 ? 提高遺傳經(jīng)濟性和效率 ? 使催化基團聚在一起，提高催化效率（對酶而言） ? 具有協(xié)同性和別構效應 ? 多亞基蛋白一般具有多個結合部位，結合在蛋白分子的特定部位上的配體對該分子的其他部位所產生的影響稱為 別構效應 。具有別構效應的蛋白質稱為 別構蛋白質。 ? 別構效應具有正協(xié)同作用和負協(xié)同作兩種 常利用蛋白質數(shù)據(jù)庫 //////
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