蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)(2)-資料下載頁
2025-05-03 07:58本頁面
【正文】 折疊和結(jié)構(gòu)預(yù)測 Protein fold and structure calculation ?蛋白質(zhì)變性的實(shí)質(zhì)是蛋白質(zhì)分子中 次級鍵 被破壞，引起天然構(gòu)象解體。 Protein denature ? 蛋白質(zhì)變性的過程中 ， 往往發(fā)生下列現(xiàn)象： ? １ ） 生物活性的喪失 ? ２ ） 一些側(cè)鏈基團(tuán)的暴露 ? ３ ） 一些物理化學(xué)性質(zhì)的改變 :① 溶解度降低 。② 分 子形狀發(fā)生改變 ,不對稱性增加 ， 黏度增減 ， 旋光和紫外吸收變化 4） 生物化學(xué)性質(zhì)的改變：易被酶水解 Protein denature ? 變性劑 ： 尿素和鹽酸胍 ， 能與多肽主鏈競爭氫鍵 ， 因此破壞蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu) 。 十二烷基硫酸鈉 （ ＳＤＳ ） 。 ? 關(guān)于蛋白質(zhì)變性的學(xué)說 ， 我國生物化學(xué)家吳憲在２０世紀(jì)３０年代就已提出 ， 天然蛋白質(zhì)分子因環(huán)境的種種關(guān)系 ， 從有序而緊密的結(jié)構(gòu) ，變?yōu)闊o序而松散的結(jié)構(gòu) ， 這就是 變性 。 Protein denature 當(dāng)變性因素去除后，變性蛋白質(zhì)又可重新恢復(fù)到天然構(gòu)象，為 蛋白質(zhì)的復(fù)性 Protein denature ? 氨基酸序列 規(guī)定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu) Amino acid sequence determine protein 3dimenational structure ? 核糖核酸酶的變性和復(fù)性實(shí)驗(yàn) ? 牛胰核糖核酸酶 （ RNA酶 ） 有 4個二硫鍵 ? ? 8mol/L尿素或 6mol/L鹽酸胍 +巰基乙醇 酶 無規(guī)線團(tuán) 透析除去變性劑和巰基乙醇 Amino acid sequence determine protein 3dimenational structure Amino acid sequence determine protein 3dimenational structure ? 8個 SH重新氧化，隨機(jī)重組形成 4個正確配對二硫鍵的概率 =1/7*1/5*1/3=1/105 ? 當(dāng)還原后的 RNA酶在 8mol/L尿素中被重新氧化時(shí)，只恢復(fù)到原來天然活性的 1% 左右。 Amino acid sequence determine protein 3dimenational structure ? 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測 Calculation of protein structure ? 二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測 (自學(xué) ) Secondary structure calculation ? 三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測 折疊的計(jì)算機(jī)模擬(自學(xué) ) 3dimensional calculation puter simulate protein fold ? 亞基締合 和四級結(jié)構(gòu) ? Subunits 結(jié)合 conjection Protein Quaternary structure ? concepts relate to quaternary structure ? 亞基 (subunit)\單體 ( monomer) ? 單體蛋白質(zhì) ? 寡聚蛋白 (oligomer) ? 原聚體 （ protomer） ? 同多聚 （ homomultimeric)蛋白質(zhì) ? 雜多聚 （ heteromultimeric)蛋白質(zhì) 亞基締合和四級結(jié)構(gòu) ? 蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)涉及 ① 亞基種類和數(shù)目 ② 各亞基和原聚體在整個分子中的空間排布 亞基締合和四級結(jié)構(gòu) ? 四級締合的推動力 亞基締合和四級結(jié)構(gòu) ? Van der Waals forces ? Hydrogen bond ? Ionic interactions ? Hydrophobic interaction ? Disulfide bond ? 具有四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)的有關(guān)概念： ? 結(jié)合在蛋白質(zhì)分子的特定部位上的 配體 對該分子的其他部位所產(chǎn)生的影響 （ 如改變親和力和催化能力 ） 稱為 別構(gòu)效應(yīng) （ allosteric effect） 。 ? 具有別構(gòu)效應(yīng)的蛋白質(zhì)稱為 別構(gòu)蛋白質(zhì) 。 ? 別構(gòu)效應(yīng)中亞基之間的信息傳遞是通過蛋白質(zhì) 構(gòu)象的變化 實(shí)現(xiàn)的 ， 別構(gòu)效應(yīng)具有 協(xié)同性 (cooperativity)。 ? 別構(gòu)效應(yīng)分為 同促效應(yīng) 和 異促效應(yīng) 。 ? 同促效應(yīng)包括 正協(xié)同性 和 負(fù)協(xié)同性 。 45蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)構(gòu)，三維結(jié)構(gòu)作業(yè) ? 名詞解釋： ? 單純蛋白 （ 舉例 ） ， 綴合蛋白 （ 舉例 ） ， ? 輔基 ， 配體 ， ? 蛋白質(zhì)的一 、 二 、 三 、 四級結(jié)構(gòu) ， ? 超二級結(jié)構(gòu) ， 結(jié)構(gòu)域 ， ? 肽平面 （ 酰胺平面 ） ， 谷胱甘肽 （ 結(jié)構(gòu)式 ） ，對角線電泳 ， 完全水解 ， 部分水解 ， ? 同源蛋白質(zhì) ， 不變殘基 ， 可變殘基 ， ? α螺旋 β折疊 ， 膜內(nèi)在蛋白 ， ? 蛋白質(zhì)的變性與復(fù)性 ， ? 單體 ， 同聚體 ， 雜多聚蛋白 ? ? ? 回答問題： ? 1. 試舉例說明蛋白質(zhì)功能的多樣性 ？ ? 2. 哪些實(shí)驗(yàn)?zāi)苷f明肽鍵是蛋白質(zhì)的連接方式 ？ ? 3. 試述肽鍵的性質(zhì) 。 ? 4. 試述蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)測定的策略 。 ? 5. 如何測定 N端氨基酸 ？ ? 6. 圖示胰蛋白酶 、 胰凝乳蛋白酶 、 嗜熱菌蛋白酶 ? 及胃蛋白酶的作用專一性 。 ? 7. 書 p194— 第 2題 ? 8. 研究蛋白質(zhì)構(gòu)象的方法都有哪些 ？ ? 9. 穩(wěn)定蛋白質(zhì)的三微結(jié)構(gòu)的作用力有哪些 ？ ? 10. 影響 α螺旋形成的因素有哪些 ？ ? 11. 膠原蛋白的氨基酸組成有何特點(diǎn) ？ ? 12. 蛋白質(zhì)變性后有哪些現(xiàn)象 ？ ? 13. 舉例說明蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)決定三級結(jié)構(gòu) 。 ? ? What are the Characteristics of globular protein 3dimentional structure? ? What are the Characteristics of globular protein 3dimentional structure? ? What are the elements of protein Secondary structure? ? Subunit ? Homomultimeric protein ? Heteromultimeric protein ? Protein denature
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