【正文】 TTAATGGGAAAAGGCAATCAGCTAATCATGCAGTAATCCCCCATTGCAAGAATTAAGGGAACCAACCACAAGAGTGGCCAGAGGAAGCAACAAAAGGACATCATCATATTTGCCTTGCTTTGTGGCCTTAATTGTATATATATTGTATCCTTCTCTTCTTCACCTAGCTAGCTTAACTATATTTAGCTGCATATCTATCTTTTGGTACTAATGATTTGTTACAGACACATCTAACAATGCACTTTTAGATTCTTCTCTAACCTCCCAGGCTCATCCTTCTAATAGTAAAATGCTTGAGGTCTGCCACTAATAATATTGNAATAAGTTCCGACACTAGGAGTGGTTAAAGATAACTTGATCAATTTCGTCAAACGAGAATACTATTATGCCCATGCTTGCAACTAGTANGATTTGATTCCGCACGCATACACACAAGGTTGGGGCTTCAACATCCGCCTAAAAAATCTAATTATAAAAANAAAGGGTGCAGTTTAAAGAAAACATGTTGGGGGTACAATACATAAGTAATTTCATCTTAACCCCGNTTATCGGGGANTATNAAATGGTTNANNTNNANGGTTNANAAGGGGNCCATTTNGAANTNANTNNNNTTGGCGTANGNNGNNGAATATNAAANCCGNCNANCNNNANAAC 03Z15AI83 ZH15 CK 561bp 03Z15AI83 RB flanking sequence Rice genome 只可以通過序列比對來檢索是否有對應的基因突變體。最大的特色是提供了大量的外觀突變表型描述與圖片、脅迫篩選結(jié)果和基因表達譜等信息，內(nèi)容豐富。研究者可以根據(jù)序列來檢索本庫，也可以根據(jù)突變表型，表達模式和發(fā)育時期來檢索出現(xiàn)感興趣性狀的突變體，更為直觀、快捷地找尋目標突變體。 Shanghai TDNA Insertion Population (SHIP) 特色在于大量關于水稻品質(zhì)方面的突變體數(shù)據(jù) TDNA插入突變體庫 澳大利亞水稻 Ac/Ds以及 TDNA插入突變體庫 轉(zhuǎn)座子插入突變體庫 Tos17插入突變體庫 同時收錄了多家突變體庫的數(shù)據(jù)，豐富全面。 整合了多家科研單位的水稻 TDNA， Tos17和 Ac/Ds轉(zhuǎn)座子的側(cè)翼序列，能提供基因組瀏覽器的功能，信息更新比較及時 ，同時還提供擬南芥突變體庫的相關信息。 綜合類數(shù)據(jù)庫 6. FST Resources Group Sequence Mapped Update RMD (FST) 16,158 15,971 08/25/2022 POSTECH (TDNA) 85,267 84,680/58,943 lines 04/28/2022 EuCIRAD/Genoplante 29,263 28,324 10/22/2022 NIAS (Tos17) 18,024 17,937 08/25/2022 UCD (dSpm/Ds) 13,922 13,666 07/29/2022 TRIM (FST) 11,799 11,646 06/05/2022 SHIP (TDNA) 6,962 6,761 08/25/2022 EUOSTID (Ds) 1,315 1,301 08/25/2022 PSNU (Ds) 1,072 1,046 08/25/2022 ZJU (TDNA) 741 714 08/25/2022 CSIRO (FST) 611 589 08/25/2022 Total 185,134 182,635 1. Rice Mutant Data, Huazhong Agricultural University, China 2. Postech PFG TDNA, Korea 3. CIRAD / Genoplante oryza tag lines, France 4. NIAS Tos17 insertion mutants, Japan 5. UCD dSpm/Ds, USA 6. Taiwan Rice Insertion Mutant (TRIM), Academia Sinica 7. SHIP TDNA, Shanghai Institute of Plant Physiology and Ecology， China 8. EUOSTID Ds, Plant Research International, Wageningen UR, Wageningen, Netherlands 9. PSNU Ds, Plant Molecular Biology amp。 Biotechnology Research Center (PMBBRC), Gyeongsang National University, Korea 10. Zhejiang Univ. rice TDNA, China 11. CSIRO Ac/Ds, Australia 僅僅完成了估計飽和插入數(shù)目的一半 ！ Krishnan等（ 2022）收集了全球公布的 206, 668條水稻側(cè)翼序列，其中有 180, 639條序列是在基因組中獨立插入的。他們對 Tos1 TDNA、 DS、 dSpm這些不同的插入類型進行了分析，發(fā)現(xiàn)每種插入類型都有自己的特點。目前通過分離側(cè)翼序列，已經(jīng)獲得了 20多萬個插入位點，覆蓋了超過 50％蛋白編碼基因，更多突變位點的側(cè)翼序列的分離還在進行中。 Krishnan et al. Plant Physiol, 2022, 149: 165170 A B C D E F G H I J K L M N O A B C D E F G H I J K L 7. 利用 TDNA突變體分離克隆基因 正向遺傳學 突變性狀與 TDNA的共分離檢測（ PCR） Very import！ 功能互補驗證，遺傳分析，表型分析、等位突變體 分離突變體的 側(cè)翼序列 共分離檢測 基因功能分析，表達分析等 利用 TDNA插入文庫分離基因?qū)嵗?RID 1 （ Rice Indeterminate1） Wu et al. Proc. Natl. Aced. Sci. 2022, 35: 12915–12920 生長一年以上的突變體 ，仍然不能開花 RID1: 控制水稻開花的總開關 ? 對于沒有突變體文庫的研究者來說，反向遺傳學的方法更常用。 ? 根據(jù)網(wǎng)上搜索的 FST序列想突變體庫創(chuàng)建研究小組索要突變體 基因組測序帶來的 …… 前基因組時代的“釣魚”和后基因組時代的“撈魚” 第二章的主要內(nèi)容 ? 所有介紹的基因分離的主要方法和原理 ? 熱點：酵母雙雜交 ? 術語的名詞解釋比如： 圖位克隆、物理圖譜、遺傳圖譜等 注意：有時候名詞解釋只有英文