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分子生物學重點習題-資料下載頁

2025-08-05 03:54本頁面
  

【正文】 胞中DNA與組蛋白和大量非組蛋白結(jié)合,并有核膜將其與細胞質(zhì)隔離,結(jié)果真核細胞的轉(zhuǎn)錄和翻譯在時間上和空間上都是分離的,而原核細胞的基因轉(zhuǎn)錄和翻譯是同步的;⑷真核生物的基因是不連續(xù)的,中間存在不被翻譯的內(nèi)含子序列,而原核生物幾乎每一個基因都是完整的連續(xù)的DNA片段;⑸真核生物基因組中非編碼序列遠多于編碼序列;⑹真核生物基因組存在重復序列,重復次數(shù)從幾次到幾百萬次不等;⑺真核生物基因組的復制起點多,缺少明顯的操縱子結(jié)構(gòu),而原核生物基因組一般是一個復制子;⑻真核生物與原核基因組中存在轉(zhuǎn)座因子。?與順式作用元件結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)形式有哪些?答:是指能直接或間接的識別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。大多數(shù)真核轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子由某一基因表達后,可通過另一基因的特異的順式作用元件相互作用,從而激活另一基因的轉(zhuǎn)錄,這種調(diào)節(jié)蛋白稱反式作用因子。其DNA結(jié)構(gòu)域的常見形式有:鋅指結(jié)構(gòu)、堿性亮氨酸拉鏈、堿性螺旋環(huán)螺旋。?常見的順式作用元件有哪些?答:基因中能影響基因表達,但不編碼 RNA 和蛋白質(zhì)的 DNA 序列。順式作用元件主要包括啟動子、增強子、負調(diào)控元件等。?答:PCR,Sanger雙脫氧鏈終止法,等電聚焦,Southern 雜交,Northern 雜交。?答:是以斑點雜交為基礎(chǔ)建立的高通量檢測基因表達的一種方法,它是通過某些特殊的微加工技術(shù)將大量已知序列的寡核苷酸或cDNA探針有序的固定于固相支持物表面作為探針,然后與標記的待測核酸進行雜交,通過對雜交信號的檢測分析,獲得待測核酸的各種序列及表達信息。?答:基本原理是以待擴增的DNA分子為模板,以一對人工合成的、分別與模板的5’端及3’端互補的單鏈寡核苷酸作為引物,在耐熱DNA聚合酶的催化下,按照半保留復制的原則合成兩個子代DNA;接著以子代DNA為模板,再次進行合成,如此反復循環(huán)數(shù)十次,最終將原是模板放大數(shù)百萬倍。?答:DNA合成是在DNA聚合酶的催化下,以單鏈或雙鏈DNA模板,以四種2’脫氧核苷三磷酸(dNTP)為底物,在引物或新和成子鏈的3’OH末端依次連接上新的脫氧核苷一磷酸,使新生鏈不斷延長。DNA分子中核苷酸是通過3’,5’磷酸二酯鍵相互連接。如果在底物中加入2’,3’雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)。那么當ddNTP摻入到新生鏈中時,由于ddNTP沒有3’OH,不能與其他dNTP上的磷酸集團形成磷酸二酯鍵,DNA新鏈的合成就會終止,此即為雙脫氧末端終止法測序的基本原理。四、論述題1. 雙脫氧末端終止法測序的基本步驟包括哪些?答:1)分離待測核酸模板,模板可以是DNA,也可以是RNA,可以是雙鏈,也可以是單鏈。2)在4只試管中加入適當?shù)囊?、模板?種dNTP(包括放射性標記dATP,例如?32 PdATP和DNA聚合酶(如以RNA為模板,則用反轉(zhuǎn)錄酶),再在上述4只管中分別加入一種一定濃度的ddNTP(雙脫氧核苷酸)。3)與單鏈模板(如以雙鏈作模板,要作變性處理)結(jié)合的引物,在DNA聚合酶作用下從5’端向3’端進行延伸反應(yīng),32P隨著引物延長摻入到新合成鏈中。當ddNTP摻入時,由于它在3’位置沒有羥基,故不與下一個dNTP結(jié)合,從而使鏈延伸終止。ddNTP在不同位置摻入,因而產(chǎn)生一系列不同長度的新的DNA鏈。4)用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳同時分離4只反應(yīng)管中的反應(yīng)產(chǎn)物,由于每一反應(yīng)管中只加一種ddNTP(如ddATP),則該管中各種長度的DNA都終止于該種堿基(如A)處。所以凝膠電泳中該泳道不同帶的DNA 3’ 末端都為同一種雙脫氧堿基。5)放射自顯影。根據(jù)四泳道的編號和 每個泳道中DNA帶的位置直接從自顯影圖譜上讀出與模板鏈互補的新鏈序列。2. 真核 mRNA 選擇性剪接的方式有那些?舉例說明其基本生物學意義是什么?答:(1)選擇性剪接的方式有: ①外顯子遺漏。 ②3ˊ端剪切位點的變化。 ③ 5ˊ端剪切位點的變 化;④ 內(nèi)含子保留。(2)轉(zhuǎn)錄后選擇性剪接在高等生物細胞的高度異質(zhì)性中起重要作用。由于選擇性剪接的 多樣化,一個基因在轉(zhuǎn)錄后通過 mRNA 前體(hnRNA)的剪接加工而產(chǎn)生兩個或更多的蛋 白質(zhì),不同的蛋白可能發(fā)揮著不同的生物學效應(yīng)。(3)如 bax 基因的編碼產(chǎn)物是與細胞凋亡有關(guān)的分子。該基因的原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)過選擇 性剪接形成幾種(α、β、γ 等)不同類型的蛋白質(zhì),其結(jié)構(gòu)上的差異主要源于 mRNA 前體 的選擇性剪接。3. 論述小 RNA 分子在基因表達調(diào)控中意義。答:反義RNA是指能與特定mRNA互補結(jié)合的RNA片段,反義RNA由反義基因轉(zhuǎn)錄而來。天然的具有功能的反義RNA分子一般為200個堿基以下的小分子RNA。反義RNA在原核生物翻譯水平上有三種作用方式:(1)反義RNA根據(jù)堿基互補配對原則與mRNA 5ˊ端非翻譯區(qū)包括SD序列相結(jié)合。SD序列是mRNA與核糖體小亞基結(jié)合的部位,反義RNA與SD序列結(jié)合后,阻止了mRNA與核糖體小亞基結(jié)合,直接抑制了翻譯。(2)反義RNA與mRNA 5ˊ端編碼區(qū)起始密碼子AUG結(jié)合,從而抑制mRNA翻譯起始。(3)反義RNA與mRNA的非編碼區(qū)互補結(jié)合,使mRNA構(gòu)象改變,影響其與核糖體結(jié)合,間接抑制了mRNA的翻譯。4. 簡述真核生物轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控機制。答:主要通過反式作用因子與順式作用元件和 RNA 聚合酶(RNA polymerase, RNA pol)的 相互作用完成。(1)順式作用元件(cisacting element)指某些能影響基因表達但不編碼新的蛋白質(zhì)和 RNA的 DNA 序列,按照功能分為啟動子、增強子、負調(diào)控元件(沉默子等)。(2)反式作用因子(transacting factor)指能直接或間接地識別或結(jié)合在各順式作用元件 8~12bp 核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的一組蛋白質(zhì),也稱序列特異性DNA結(jié)合蛋白(sequence specific DNA binding protein,SDBP),這是一類細胞核內(nèi)蛋白質(zhì)因子。在結(jié)構(gòu)上含有與DNA 結(jié)合的結(jié)構(gòu)域。(3)反式作用因子的調(diào)控機制①反式作用因子的活性調(diào)節(jié):真核基因轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)節(jié),首先表現(xiàn)為反式作用因子的功 能調(diào)節(jié),即特定的反式作用因子被激活后,可以啟動特定基因的轉(zhuǎn)錄。反式作用因子的激活方式如下:表達式調(diào)節(jié)。共價修飾。配體結(jié)合。蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用②反式作用因子作用方式:成環(huán);扭曲;滑動;Oozing③反式作用因子的組合式調(diào)控:基因表達的調(diào)控不是由單一的反式作用因子完成而是幾 種因子組合,發(fā)揮特定的作用。5. 熒光定量 PCR 可以實現(xiàn)模板數(shù)的定量,其原理是什么?答:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;剛開始時, 探針結(jié)合在DNA任意一條單鏈上。PCR擴增時,Tap酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步?;谝韵碌睦碚?1. ,所以,如果結(jié)果X循環(huán),那產(chǎn)物就是2的(x1),那產(chǎn)物就是2的(x+1)次方,就可以計算出起始模板的量
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