基因組研究鳥獸學(xué)會華大基因樊偉-資料下載頁
2025-05-12 18:18本頁面
【正文】 利用測序技術(shù)對作圖群體進(jìn)行分型 父本： 測 10X 母本： 測 10X 雜交，產(chǎn)生分離群體 (作圖群體 )，如 BC1, DH, RIL等。 子代：取 200個， 各測 ，總共 20X Two steps: 1. 比較父本和母本，得到 全部 SNP位點。 2. 根據(jù) map上的 reads確 定 SNP型 , 對每一個子 代進(jìn)行染體片段分型。 Genomewide Association study 35 突變體或者單片段替換系測序 ? 用物理或者化學(xué)誘變劑得到的突變體材料 突變位點彌散分布在整個基因組中，但是突變位點數(shù)很少。這時，可采用全基因組高深度測序 (30X),來得到全部的突變位點，然后通過過濾篩除，得到起作用的突變位點。 ? 用多代回交方法得到的單片段替換系材料 突變型與原型只有一個很小的染色體片段是不同的，而其他基因組部分都相同。在原型基因組序列已知的條件下，可通過低深度測序 ()，來找到不同的那個染色體片段。 Advantages by genomic technology 37 ? Whole genome sequence (fine or finished map) ? Complete set of polymorphism markers (among large population) ? Fast and accurate location of phynotypeassociated genes. ? Fast and accurate selection of wanted individuals in breeding Outline ? 基因組研究與測序技術(shù)發(fā)展回顧 ? 華大基因 (BGI)介紹 ? De novo測序與物種研究 ? Resequencing與群體研究 ? 性狀基因定位與分子育種 ? 轉(zhuǎn)錄組、甲基化測序與基因調(diào)控研究 ? Meta測序于共生微生物研究 38 ? Static (Genome) level: De novo sequencing, assembly Resequencing, mapping ? Action (regulation) level: Transcriptome, mRNA, small RNA Mythynome and other mechanisms 39 人類甲基化組研究： 2022年 Science雜志評出的 10大科學(xué)新聞之一 Outline ? 基因組研究與測序技術(shù)發(fā)展回顧 ? 華大基因 (BGI)介紹 ? De novo測序與物種研究 ? Resequencing與群體研究 ? 性狀基因定位與分子育種 ? 轉(zhuǎn)錄組、甲基化測序與基因調(diào)控研究 ? Meta測序于共生微生物研究 44 Thanks 47
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