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正文內(nèi)容

120301醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)-1(編輯修改稿)

2025-03-26 15:01 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 性。 ? DNA是線狀高分子,粘度很大, 堿性 條件下 穩(wěn)定 ; RNA分子較小,粘度也小,對 酸穩(wěn)定 。 ? 核酸分子在 機(jī)械力 的作用下易發(fā)生斷裂。 ? 堿基有共軛雙鍵,具 紫外吸收 特性,最大吸收峰在 260nm??蓪怂徇M(jìn)行檢測和定量,也可分析純度。 ? 核酸變性 —— 加熱、極端的 pH、有機(jī)溶劑如甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等。 第一節(jié) 核酸分離純化的設(shè)計及原則 ? 核酸分離純化的原則 ? 核酸的釋放 ,核酸的濃縮、沉淀與洗滌 ? 核酸的鑒定方法(濃度,純度,完整性) ? 核酸的保存 材料與方法的選擇 ? 臨床診斷與研究常見的標(biāo)本 —— 血液、尿液、唾液、組織及培養(yǎng)的細(xì)胞。 ? 不同研究目的對核酸的 完整性 、 純度 、 產(chǎn)量 及 濃度 有不同要求,另外尚需考慮制備核酸所需的 時間 與 成本 。 ? 不影響核酸制品質(zhì)量與產(chǎn)量的前提下,應(yīng)選安全的試劑與制備方案。 核酸分離純化的原則 : 一 保持核酸一級結(jié)構(gòu)的 完整性 ,因完整的一級結(jié)構(gòu)是 核酸結(jié)構(gòu)和功能研究的最基本的要求; 二 是盡量排除其他分子的污染,保證核酸樣品 純度 。 核酸提?。? 溶于水 而 不溶于有機(jī)溶劑 的性質(zhì) 保持核酸的完整性(一) ? 盡量 簡化操作步驟 ,減少對核酸的破壞; ? 合適 pH值( pH4- 10) 過酸或過堿 -破壞磷酸二酯鍵 ? 減少 機(jī)械剪切力 ,包括劇烈的溶液振蕩、攪拌,使溶液快速通過狹長孔道,細(xì)胞突置于低滲溶液中, DNA樣品反復(fù)凍融等都可引起 DNA的降解; ? 低溫操作; 保持核酸的完整性(二) ? 抑制核酸酶活性與反應(yīng)速率,減少對核酸的生物降解: 內(nèi)源或外源的各種 核酸酶 能破壞磷酸二酯鍵; ? DNA酶 的激活需要 Mg2+、 Ca2+等二價金屬離子,可使用二價金屬離子螯合劑乙二胺四乙酸( ethylene diamine tetraacetic acid, EDTA)、 檸檬酸鹽 并在低溫條件下操作,基本可抑制 DNA酶的活性; ? RNA酶 ,分布廣泛,耐高溫、耐酸堿,不易滅活。 技術(shù)路線的設(shè)計 核酸的釋放 DNA和 RNA一般均位于細(xì)胞內(nèi)(病毒除外),分離純化的第一步是裂解細(xì)胞、釋放核酸 。 ?破碎細(xì)胞的方法 : 包括機(jī)械和非機(jī)械法(干燥法,溶胞法)兩大類。 非核酸的大分子污染物 --主要是蛋白質(zhì)、多糖及脂類物質(zhì); 非需要的核酸分子 --分離某一特定的核酸分子時,其它的核酸分子皆為雜質(zhì); 影響后繼研究的溶液和試劑 --加入的有機(jī)溶劑和某些金屬離子; 應(yīng)清除的雜質(zhì) 核酸的濃縮、沉淀與洗滌 ? 沉淀 是濃縮核酸的最常用且高效的方法,其優(yōu)點在于沉淀后易于調(diào)整核酸溶液濃度。另外還能清除部分雜質(zhì)和某些鹽離子。 ? 原理 :核酸在水溶液中以多聚陰陽離子的化合物形式存在,它與 K+、 Na+、 Mg2+、 Li+及 NH4+等陽離子形成的鹽,通過屏蔽帶負(fù)電的磷酸基團(tuán)使 DNA、 RNA分子聚集在一起而不溶于許多有機(jī)溶劑。 核酸的沉淀與洗滌 ? 常用的鹽類 有醋酸鈉、醋酸鉀、醋酸銨、氯化鈉、氯化鉀及氯化鎂; ? 常用的 有機(jī)溶劑 為乙醇、異丙醇和聚乙二醇。 ? 核酸沉淀常常含有少量共沉淀的鹽,需用 70%~ 75%的乙醇 洗滌 去除。 核酸的鑒定與保存 紫外分光光度法 /熒光光度法 紫外分光光度法: 基于核酸分子中的堿基具有共軛雙鍵結(jié)構(gòu)因而可吸收紫外線,其最大吸收波長為 260nm。這一物理特性為溶液中核酸濃度的測定奠定了基礎(chǔ)。 雙鏈 DNA A260=50181。g/ml;單鏈 DNA或 RNA A260=40181。g/ml; 單鏈寡核苷酸 A260=33181。g/ml; 1. 濃度測定 熒光光度法 : 核酸的熒光染料如溴化乙錠( ethidium bromide- EB), Sybr green I等嵌入堿基平面后,本身無熒光的核酸在 UV激發(fā)下發(fā)出熒光,且熒光強(qiáng)度的積分與溶液中核酸的含量呈正比。 瓊脂糖凝膠電泳 ---分離、鑒定和提純核酸片段 ? 凝膠中核酸的遷移率: ① 核酸分子的大小 :線性雙鏈 DNA分子通過凝膠的速率與其分子量的常用對數(shù)成反比。 ② 瓊脂糖濃度 :利用不同濃度的凝膠,可分辨范圍廣泛,大小不同的核酸片段( % 60Kb。2%100bp) ③ DNA構(gòu)型 :相同分子量的閉環(huán)( Ⅰ 型),開環(huán)( Ⅱ 型)和線狀( Ⅲ 型) DNA,以不同速率通過凝膠。遷移率 Ⅰ 型 Ⅲ 型Ⅱ 型。 質(zhì)粒 DNA三種構(gòu)型 不同濃度瓊脂糖的凝膠分離范圍 瓊脂糖濃度(%, W/V ) DNA分子的有效分離范圍( kb) 瓊脂糖電泳鑒定 DNA濃度和 純度 ⒉ 純度鑒定 ? 紫外分光光度法: 主要通過 A260與 A280的比值來判定有無污染。在緩沖液中,純 DNA的 A260/A280為 ,純 RNA的比值為 。比值升高與降低均提示不純。 ? 熒光光度法: 用 EB等熒光染料示蹤的核酸電泳結(jié)果可判定純度。 DNA分子較 RNA大得多,電泳遷移率低。 ? 純凈 DNA OD260 / OD280 應(yīng) =;純凈 RNA OD260 / OD280應(yīng) =; ? OD230主要吸收為多肽,苯酚等,純凈的核酸樣品OD260 / OD230 應(yīng) =; ? OD320檢測溶液的懸濁度和其它干擾因子,樣品純凈, OD320應(yīng)接近零, =。 核酸蛋白檢測儀測定: ⒊完整性鑒定 ? 瓊脂糖凝膠電泳( agarose gel electrophoresis):
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