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正文內(nèi)容

胡蘿卜中類胡蘿卜素積累與主要合成基因轉(zhuǎn)錄水平相關(guān)性分析(編輯修改稿)

2025-02-04 10:55 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 2516 園 藝 學(xué) 報 41卷 數(shù)據(jù)分析 采用 DPS軟件對各試材根、葉中類胡蘿卜素含量及各基因轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行鄧肯氏多重比較。類胡 蘿卜素含量與基因表達(dá)量之間相關(guān)性采用 SAS Pearson方法分析( Li et al., 2022)。 2 結(jié)果與分析 基因的 RTPCR RTPCR顯示所有材料均擴(kuò)增出了番茄紅素下游分支途徑中 LCYE 、 LCYB1 、 CHXE 和 CHXB1 的 cDNA片段(圖 1)。測序結(jié)果表明橘色栽培品種 Af的 4個基因與 NCBI公布的序列一致,但白 色野生資源 Ws中存在多個 SNP變異位點。 LCYE 的 cDNA序列長為 1 682 bp, Ws中存在 1個變異 位點; LCYB1 的 cDNA序列長為 1 795 bp, Ws中存在 14個變 異位點; CHXE 的 cDNA序列長為 1 712 bp, Ws中存在 8個變異位點; CHXB1 的 cDNA序列長為 1 102 bp, Ws中存在 21個變異位點(表 2)。 圖 1 RTPCR擴(kuò)增產(chǎn)物 Fig. 1 RTPCR amplifications 表 2 Ws、 Af及 NCBI中 LCYE 、 LCYB1 、 CHXE 和 CHXB1 cDNA編碼區(qū)序列的變異堿基 Table 2 Variable nucleotides of cDNA coding sequences of LCYE , LCYB1 , CHXE and CHXB1 among Ws, Af and deposited sequences in NCBI 變異堿基 Variable nucleotide 變異堿基 Variable nucleotide 基因 Gene 變異堿基位點 Site of variable nucleotide Ws Af NCBI 基因 Gene 變異堿基位點 Site of variable nucleotide Ws Af NCBI LCYE 291 A T T CHXB1 96 T A A LCYB1 624 T C C 113 G A A 628 C T T 117 A G G 645 C T T 121 A C C 1 026 G A A 123 C T T 1 053 A G G 188 T G G 1 086 T C C 251 C G G 1 123 A C C 267 A G G 1 146 C T T 300 C T T 1 153 A G G 318 G A A 1 201 A G G 354 A C C 1 212 T C C 366 A G G 1 248 C A A 400 T C C 1 353 A G G 537 A G G 1 449 A T T 585 A T T CHXE 10 T C C 591 A T T 297 C T T 672 G A A 327 C T T 699 A C C 363 T C C 727 C G G 621 A G G 741 T C C 738 A C C 744 T C C 1 246 C G G 1 305 C T T 12期 王 慧等:胡蘿卜中類胡蘿卜素積累與主要合成基因轉(zhuǎn)錄水平相關(guān)性分析 2517 根和葉中類胡蘿卜素含量差異分析 雖然 Ws根中沒有檢測出類胡蘿卜素,但其葉中的總類胡蘿卜素含量顯著高于 Af(圖 2),而且 兩者葉中的 α – 胡蘿卜素和 β – 胡蘿卜素含量存在顯著差異,其中 Ws中 α – 胡蘿卜素含量僅為 1, β – 胡蘿卜素含量為 1,而 Af為 1, β – 胡蘿卜素含量為 1。 Ws葉中的葉黃素和玉米黃質(zhì)含量顯著高于 Af。白色 E09041根中只檢測出了微量葉黃素,但其葉中 類胡蘿卜素含量和組分與 Af相似。黃色 E52081根中檢測出了微量 β – 胡蘿卜素、葉黃素和玉米黃 質(zhì),但其葉中類胡蘿卜素含量和組分更接近于 Ws。橘黃色 E04041根中葉黃素含量最高,為 1,顯著高于 Ws和 Af,其 α – 胡蘿卜素、 β – 胡蘿卜素和玉米黃質(zhì)含量分別是 、 1; 葉中的總類胡蘿卜素含量與 Af相當(dāng),但其組分則與 Ws相似。淺橘色 E35073根中 α – 胡 蘿卜素、 β – 胡蘿卜素含量與 E04041相當(dāng),而其葉黃素含量只有 1;葉中的總類胡蘿卜素 含量最高,達(dá)到 1,其組分與 Af相似。橘色 E2022根中總類胡蘿卜素含量低于 Af,但 葉中含量則高于 Af,根和葉中的組分均與 Af相似。 圖 2 試材根和葉中類胡蘿卜素含量比較 鄧肯氏顯著性檢驗,小寫字母代表 。下同。 Fig. 2 Comparison of carotenoid content in root and leaf Duncan’s multiple test , different letter indicated the significant differences of level. The same below. 根和葉中類胡蘿卜素合成基因的表達(dá)量分析 LCYE 、 LCYB1 、 CHXE 和 CHXB1 在不同材料的根和葉中均有表達(dá),但相對表達(dá)量差異顯著(圖 3)。 Ws根中這 4個基因的表達(dá)量最低,但葉中 LCYE 、 LCYB1 和 CHXB1 表達(dá)量最高,而 CHXE 則 最低。 Af根中 4個基因均顯著高表達(dá),其中 LCYE 為 Ws的 136倍,而 LCYB1 只有 ,葉中 LCYE 、 LCYB1 和 CHXB1 表達(dá)量相對 Ws較低,而 CHXE 則是 Ws的 。 E09041根中 4個基因表達(dá)量 與 Ws相似,但在葉中則與 Af相似。 E52081根中 4個基因均顯著表達(dá),但在葉中 LCYE 、 LCYB1 2518 園 藝 學(xué) 報 41卷 和 CHXB1 表達(dá)量最低,而 CHXE 介于 Ws和 Af之間。 E04041和 E2022的 4個基因表達(dá)量相似, 在根中 E04041均低于 E2022,在葉中則反之。 E35073根中 CHXE 的表達(dá)量最高,為 Ws的 , 而 CHXB1 表達(dá)量相對較低,只有 Ws的 ,但在葉中 4個基因的表達(dá)量與 Af較為相似。 圖 3 試材根和葉中相關(guān)基因的相對表達(dá)量分析 Fig. 3 Relative expression analysis of carotenoid biosynthesis genes in root and leaf 根和葉中類胡蘿卜素含量與基因表達(dá)量相關(guān)性分析 從表 3可看出,在根中, LCYE 表達(dá)量與 α – 胡蘿卜素、 β – 胡蘿卜素和總類胡蘿卜素含量呈正 相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別是 、 ;但在葉中, LCYE 表達(dá)量與葉黃素、總類胡蘿卜素含量 之間呈負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為 – 、 – 。 表 3 葉和根中類胡卜素含量與基因相對表達(dá)量相關(guān)性分析 Table 3 Pearson correlation analysis between carotenoid content and gene expression in leaf and root 相關(guān)系數(shù) r 器官 Organ 組分 Component LCYE LCYB1 CHXE CHXB1 α – 胡蘿卜素 α carotene ** 根 Root β – 胡蘿卜素 β carotene ** 葉黃 素 Lutein 玉米黃質(zhì) Zeaxanthin – 總類胡蘿卜素 T
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