結(jié)構(gòu)基序預(yù)測蛋白質(zhì)功能(編輯修改稿)
2025-06-18 22:10 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 nce identities were calculated for pairs of subunits sharing the same posite motifs. 我們通過把檢驗得到的兩個不同的 posite motifs的相似性和最小序列一致性做一個函數(shù)。 3. Association of posite motif similarity with function similarity when we used only the UniProt functions under the Biological process category which are less directly related to molecular functions 4. Examples of posite motifs sharing the same elementary motif and fold but with different functions 5. Metaposite motifs for annotating functions 用一個 posite motif描述一個蛋白質(zhì)亞基的特殊狀態(tài)，這 樣每一個生物學(xué)過程都可以看作是一系列的相互作用模型。 因此， posite motif僅僅只能作為整個生物學(xué)過程中的點。 為了對生物學(xué)過程有一個更加綜合性的感官，我們把所有 的與特殊功能有關(guān)系的 posite motifs分類定義成 metaposite motifs。 type1 ： based solely on BLAST Evalue cutoff of type2 ： based on sequence identity cutoff of 100% 6. Network structure of metaposite motifs in biological processes 我們把所有的 posite motifs分類組合成 metaposite motifs，更有利于對蛋白質(zhì)功能進行分析而不是最開始簡單 的預(yù)測。 通過 UniProt keyword ‘‘Transcription’’識別一個 meta posite motif，然后找到節(jié)點部分。 節(jié)點： based on relations such as mon elementary motifs or mon sequences. For example, there are PDB entries of human cellular tumor antigen p53 with or without bound DNA(., PDB 1UOL [58] and 2AC0 [59]) which share the same elementary motif for zinc binding but have different Composite motifs depending o
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