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rna提取準備工作及注意事項-展示頁

2025-05-22 22:36本頁面
  

【正文】 液氮冷凍。投入決定產(chǎn)出;每次都以獲得最高純度的 RNA 為目的,勞民傷財。抽提 RNA 的目的RNA 用于不同的后續(xù)實驗,其質(zhì)量要求不盡相同??傊?,如果出現(xiàn)降解現(xiàn)象或者組織內(nèi)雜質(zhì)殘留現(xiàn)象,則必須對具體實驗材料的抽提方法/試劑進行優(yōu)化。因此,如果抽提出現(xiàn)降解,原來用電動勻漿器的,改用液氮碾磨;原來用玻璃勻漿器的,改用電動勻漿器或者直接用液氮碾磨,問題幾乎 100% 能獲得解決。勻漿器方法沒有考慮細胞與裂解液接觸前如何抑制 Rnase 活性這個問題,而是祈禱破碎組織的速度比細胞內(nèi)的 Rnase 降解 RNA 的速度快。但是,液氮碾磨方法非常麻煩,如果碰到樣品數(shù)比較多的時候更加會有此感覺。因此,假定有一種辦法,在抑制 RNA 活性的同時能使組織變成單個細胞,降解問題也就可以徹底解決了。細胞被裂解后,裂解液中的有效成分立即抑制住細胞內(nèi)的 Rnase,所以 RNA 得以保持完整?,F(xiàn)有的 RNA 抽提試劑,都含有快速抑制 Rnase 的成分。注意:a、處理DEPC時需要戴乳膠手套、口罩! b、或者不用DEPC消毒,130℃,90min高壓滅菌(許多實驗室高溫滅菌兩次)二、RNA提取注意事項組織 RNA 抽提失敗的兩大現(xiàn)象是: RNA 降解和組織內(nèi)雜質(zhì)的殘留。經(jīng)檢測不含 RNase、DNase和proteinase。一、槍頭和EP管等的消毒滅菌%(千分之一)的DEPC(劇毒物),須在通風櫥中小心使用,避光,密閉4℃保存。DEPC水是用DEPC(diethypyrocarbonate,焦碳酸二乙酯)處理過并經(jīng)高溫高壓消毒的MiliQ純水。%的DEPC內(nèi),%的DEP,避光、靜置、過夜(1224 h)裝槍頭和EP管的盒子不需要用DEPC浸泡,將槍頭或者EP管內(nèi)的DEPC水大致去除干后,裝起,包好121攝氏度,30min180攝氏度,干燥數(shù)個鐘頭(至少3小時以上)。關于降解問題,首先看一下為什么從培養(yǎng)細胞中抽提 RNA 不容易降解。在培養(yǎng)細胞中加入裂解液,簡單的混勻,即可使所有的細胞與裂解液充分混勻,細胞被徹底裂解。也就是說,培養(yǎng)細胞由于很容易迅速與裂解液充分接觸,所以其 RNA 不容易被降解;反過來講,組織中的 RNA 之所以容易被降解,是因為組織中的細胞不容易迅速與裂解液充分接觸所致。液氮碾磨就是最有效的這樣一種辦法。這樣就產(chǎn)生了退而求其次的方法:勻漿器。電動勻漿器效果較好,玻璃勻漿器效果較差,但總的來說,勻漿器方法是不能杜絕降解現(xiàn)象的。影響后續(xù)實驗的雜質(zhì)殘留問題,其原因比降解更多樣,解決方法相應也不同。優(yōu)化大可不必使用您的寶貴樣品:可以從市場上購買一些魚/雞之類的小動物,取相應部分的材料用于 RNA 抽提,其它部分用于抽提蛋白質(zhì) – 用嘴碾磨,腸胃抽提。cDNA 文庫構建要求 RNA 完整而無酶反應抑制物殘留;Northern 對 RNA 完整性要求較高,對酶反應抑制物殘留要求較低;RTPCR 對 RNA 完整性要求不太高,但對酶反應抑制物殘留要求嚴格。樣品的收集/保存 – 影響降解的因素樣品
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