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分子遺傳學基因組及基因組學-文庫吧資料

2025-05-05 05:05本頁面
  

【正文】 基因和假基因。 發(fā)育控制的復雜多基因家族 功能相關的基因分別串聯(lián)成簇,在生物個體發(fā)育過程中按一定的順序表達或關閉 ,這些基因家族成員隨著發(fā)育階段的變化而先后出現(xiàn) . 例如人類血紅蛋白就屬于這類基因家族所編碼,該基因家族中的不同成員在胚胎不同時期、兒童和成人組織中表達。每個重復單元中的組蛋白基因,被轉錄間隔區(qū)序列隔開,它們可以以相同的方向轉錄如海膽組蛋白基因,也可以按不同反向轉錄如果蠅組蛋白基因,但共同特點之一是這些組蛋白基因內都無內含子。組蛋白基因屬于這一類型。 5bp。重復次數(shù)在 50~ 10000左右。真核生物核糖體( rRNA)基因簇是典型的簡單的多基因家族 ,有 18S、 、28S和 5S 等 4種 rRNA基因,前 3種主體 rRNA,與后一種5S rRNA基因分開位于不同的染色體或相同染色體的不同位置。 基因家族中的各個成員可以聚集成簇也可以分散在不同染色體上 。 LINEs長約 6- 7kb,在哺乳動物基因組中有 2萬~5萬個拷貝,它們組成 L1家族,主要含有反轉錄轉座子。根據(jù)其重復序列的長短,可分為短散在重復序列( short interspersed repeated sequence) 又稱為短散在核元件( short interspersed nuclear elements, SINEs) 和長散在重復序列 (long interspersed repeated sequence)又稱為長散在核元件( long interspersed nuclear elements, LINEs) 。 也稱為短串聯(lián)重復( short tandem repeat,STR)是由 2~ 6個核苷酸組成的重復單元串聯(lián)重復( 10~ 60次)而成的簡單重復序列,如和等,三核苷酸和四核苷酸重復相對較少。根據(jù)其在染色體上所處的位置和重復單元的長度,有兩種形式的小衛(wèi)星 DNA,一種是端粒 DNA,另一種位于亞端粒區(qū),稱為可變數(shù)目串聯(lián)重復( varible number tandem repeat, VNTR) ,是由短重復單元( 6~ 40bp) 串聯(lián)重復( 6~ 100次以上)而成的 DNA序列。真核生物基因組中來源相同、結構相似、功能相關的一組基因稱為一個基因家族 (gene family)。 高度重復序列 (highly repetitive sequence ) 重復次數(shù)極高, 一個基因組中有幾百份甚至幾百萬份拷貝的高度重復序列 。 輕度重復序列 (slightly repetitive sequence) 一般在一個基因組內有 2~ 10份拷貝,但有時 2~ 3份拷貝的 DNA序列也被視作非重復序列。 單一序列 (unique sequence)又稱“單拷貝序列( singlecopy sequence) ”,“非重復序列( nonrepetitive sequence) ”。 復性動力學提供真核基因組序列信息 原核生物基因組 DNA多為單一序列,真核生物基因組 DNA有重復序列。 DNA分子的復雜性是指最長的沒有重復序列的核苷酸對的數(shù)目 。 10 Mb 45,555 蜜蜂 (Apis mellifera) 262177。 物種的基因數(shù)目與生物進化程度或生物復雜性的不對應性, 這 被 稱 之 為 N( number of genes) 值悖理 (N value paradox)或 G( number of genes) 值悖理 。 基因組的大小大致上與進化的復雜性有關 。 通常在真核生物中指一個物種的單倍體染色體組所含有的一整套基因 。 類 型 分 布 內含子性質和剪接機制 轉酯內含子 內含子中的剪接識別位點 GU— AG內含子 真核細胞核前體mRNA 結構變化,自由羥基的起始供體由內部分支點腺嘌呤提供,剪接體進行剪接,形成套索結構 AU- AC內含子 真核細胞核前體mRNA Ⅰ 型內含子 真核細胞核前體mRNA,細胞器 RNA,少數(shù)細菌 RNA 二級結構保守,鳥核苷酸輔助因子是自由羥基供體,自我剪接,無套索結構形成 Ⅱ 型內含子 細胞器 RNA, 某些原核 RNA 二級結構保守 ,內部腺嘌呤是自由羥基供體,形成套索結構中間體,自身催化剪接 Ⅲ 型內含子 細胞器 RNA 與 Ⅱ 型內含子類似,但較?。?100- 200bp),包含數(shù)量有限的結構域 孿生內含子 細胞器 RNA 多嵌合自我剪接內含子,常為 Ⅱ型或 Ⅱ 型和 Ⅲ 型混合,經常以特定的順序剪接 非轉酯內含子 剪接識別涉及外顯子結構 細胞核 tRNA內含子 真核生物細胞核前體 tRNA 剪接機制類似于 tRNA的成熟 ——涉及剪切后的連接;沒有中間體形成 —— 內含子以線性片段切除;需要機制核酸酶進行加工。 5?端剪接位點稱供體位點( donor site, 5?site,left splicing site), 3?端剪接位點稱受體位點( acceptor site, 3?site,right splicing site)。 在不同的真核生物中,內含子的一致順序有不少變化。 Gilbert將在前體 RNA拼接產生 mRNA過程中丟失的片段稱為內含子(intron),而將拼接后表達的片段稱為外顯子 (exon)。在解離過程中偶然發(fā)生錯誤 就會形成攜帶 gal或 bio基因的缺陷 噬菌體,在感染受體菌后就能高效轉移這兩種基因。 λ噬菌體只能轉導 染色體 DNA 上的半乳糖基因 (gal) 和生物素基因 (bio) 。該轉導性噬菌體吸附到受體細菌上,并注入其內含物,通過同源重組形成轉導子。在噬菌體 DNA裝入外殼蛋白組成新的噬菌體時,大約在 105~107次裝配中有一次裝配錯誤。 普遍性轉導 ( generalized transduction) 普遍性轉導是通過噬菌體將給體菌的任何一種遺傳標記轉入受體菌的過程。接合能傳遞大段的 DNA,在細菌的遺傳重組中是效率最高的 。第二章 基因和基因組 2. 病毒基因組 病毒基因組的結構多樣性 (
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