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分子遺傳學(xué)基因組及基因組學(xué)-免費閱讀

2025-05-23 05:05 上一頁面

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【正文】 H2A- H2B二聚體從核小體中的瞬時脫落可創(chuàng)造一個利于染色質(zhì)重塑或DNA結(jié)合蛋白結(jié)合進(jìn)出的機(jī)會。H2B 否 注: CAF 染色質(zhì)裝配因子: chromatin assembly factor ; NAP1 核小體裝配蛋白 nucleosome assembly protein 。一旦四聚體結(jié)合后,兩個 H2A這樣在蛋白質(zhì)水平看,核小體的復(fù)制組裝似乎是經(jīng)過一個分散機(jī)制進(jìn)行的。 DNA結(jié)合蛋白與 DNA結(jié)合位點的距離小于 DNA組裝成一個核小體所需的最小長度(約 150bp),則這兩個蛋白質(zhì)之間的 DNA不與核小體結(jié)合; DNA結(jié)合蛋白具有與核小體結(jié)合的能力,與鄰近的核小體緊密作用,導(dǎo)致核小體立即優(yōu)先地在與這些蛋白質(zhì)相鄰的位置組裝 . 核小體定位的另一種方式涉及特定的 DNA序列,這些序列對核小體有高度的親和性。在 ATP水解釋放的能量驅(qū)動下,各種轉(zhuǎn)錄因子將核小體從所需的 DNA序列中置換出來,組蛋白從染色質(zhì)中解聚并釋放。 核小體在細(xì)胞中有兩個重要功能:壓縮 DNA 以適應(yīng)細(xì)胞核大小和限制 DNA的易接近性 。一般來說,異染色質(zhì)形成的主要靶區(qū)是象轉(zhuǎn)座子和衛(wèi)星 DNA這樣的重復(fù)序列。 例如:免疫球蛋白超基因家族 ,ras超基因家族等 。加工假基因是由反轉(zhuǎn)錄因子編碼的反轉(zhuǎn)錄酶和整合酶的外來活性而產(chǎn)生的,只在真核生物中被發(fā)現(xiàn)。有功能的基因分別在不同的發(fā)育時期表達(dá) . 染色體 第 11號染色體上的基因 第 16號染色體上的基因 發(fā)育時期 胚胎期 ε 胎兒期 Gγ Aγ 成人期 δ β 胚胎期 ζ Hb GowerⅠ ζ 2ε 2 Hb Portland ζ 2 Gγ 2 ζ 2 Aγ 2 HbA2 HbA α 2δ 2 α 2β 2 胎兒期 α 2 和 成人期 α 1 Hb GowerⅡ α 2ε 2 HbF α 2 Gγ 2 α 2 Aγ 2 假基因 核苷酸序列與相應(yīng)正常功能基因基本相同 , 但沒有編碼蛋白質(zhì)能力的基因或不產(chǎn)生有功能產(chǎn)物的基因稱為假基因( Pseudogene) 。 復(fù)雜的多基因家族 各個成員并不都相同,數(shù)個功能相關(guān)的基因串聯(lián)成簇由間隔序列分開,分別轉(zhuǎn)錄出各自的 mRNA。 由同一個祖先基因經(jīng)過重復(fù)與變異 、 進(jìn)化而形成結(jié)構(gòu)與功能相似的一組基因組成一個基因家族 (gene family)。 串聯(lián)重復(fù)序列家族 串聯(lián)重復(fù)序列是指不同數(shù)目的核苷酸(簡單序列)的重復(fù)拷貝串聯(lián)在一起的高度重復(fù)序列,一般重復(fù)單元為 2~ 200bp,主要為衛(wèi)星 DNA (satellite DNA),按重復(fù)單位可將衛(wèi)星 DNA分為兩類: 小衛(wèi)星 DNA(minisatellite DNA)一般由長 5~ 50個核苷酸的重復(fù)單元組成。原核生物基因組的曲線通常只有一個拐點,曲線是單一的 S形曲線;而真核生物基因組 DNA曲線通常有幾個拐點,真核生物基因組的曲線是多 S形曲線,由若干個(一般 2- 3個) S形加合成的曲線。 生物基因組的大小同生物在進(jìn)化上所處地位的高低及復(fù)雜性之間無嚴(yán)格的對應(yīng)關(guān)系 , 這種現(xiàn)象通常稱為 C值悖理 (Cvalue paradox)。 動物中典型的剪接位置一致順序組成為: 5’AG↓GUAAGUYNYURAYY1020Y↓AG3’ 其中 Y為 U或 C, N為任何核苷酸,箭頭所指為外顯子與內(nèi)含子的交界。 局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)( specialized transduction) 噬菌體只是轉(zhuǎn)導(dǎo)供體菌某些基因的轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。 2405個已知啟動子的操縱子中, 68%只有 1個啟動子, 20%有 2個, 12%有 3個或更多個啟動子; ( regulatory gene)即調(diào)節(jié)子( regulon)所調(diào)控; rRNA的 rrn基因是多拷貝 ,一般情況下結(jié)構(gòu)基因都是單拷貝; DNA部份所占比例比真核細(xì)胞基因組少得多; . 功能分類 基因數(shù)目 所占百分?jǐn)?shù) 調(diào)節(jié) 功能 /可能調(diào)節(jié) 45/133 細(xì)胞 結(jié)構(gòu) /推定的膜蛋白 182/13 推定的結(jié)構(gòu)蛋白 42 噬菌體 、 轉(zhuǎn)座子 、 質(zhì)粒 87 運輸和 結(jié)合蛋白 /推定的運輸?shù)鞍? 281/146 能量代謝 243 DNA復(fù)制 、 重組 、 修飾和修復(fù) 115 轉(zhuǎn)錄 、 RNA合成 、 代謝和修飾 55 翻譯 、 翻譯后蛋白質(zhì)修飾 182 細(xì)胞作用 ( 包括適應(yīng) 、 保護(hù) ) 188 輔助因子 、 輔基和載體的生物合成 103 運輸?shù)陌閭H蛋白 9 核苷酸的生物合成和代謝 58 氨基酸的生物合成和代謝 131 脂肪酸和磷脂的代謝 48 碳化合物的分解代謝 130 主要的中間代謝 188 推定的酶 251 其他的已知基因 ( 已知的基因產(chǎn)物或表型 ) 26 推定的 、 未分類的 、 未知的蛋白 1632 總計 4288 * 功能分類 基因數(shù)目 所占百分?jǐn)?shù) 調(diào)節(jié) 功能 /可能調(diào)節(jié) 45/133 細(xì)胞結(jié)構(gòu) 182 推定的膜蛋白 13 推定的結(jié)構(gòu)蛋白 42 噬菌體 、 轉(zhuǎn)座子 、 質(zhì)粒 87 運輸和結(jié)合蛋白 281 推定的運輸?shù)鞍? 146 能量代謝 243 DNA復(fù)制 、 重組 、 修飾和修復(fù) 115 轉(zhuǎn)錄 、 RNA合成 、 代謝和修飾 55 翻譯 、 翻譯后蛋白質(zhì)修飾 182 細(xì)胞作用 ( 包括適應(yīng) 、 保護(hù) ) 188 輔助因子 、 輔基和載體的生物合成 103 運輸?shù)陌閭H蛋白 9 核苷酸的生物合成和代謝 58 氨基酸的生物合成和代謝 131 脂肪酸和磷脂的代謝 48 碳化合物的分解代謝 130 主要的中間代謝 188 推定的酶 251 其他的已知基因 ( 已知的基因產(chǎn)物或表型 ) 26 推定的 、 未分類的 、 未知的蛋白 1632 總計 4288 * 代碼 基因產(chǎn)物類型 數(shù)目 百分比 2 e/pe 酶 /推定的酶 1094 /390 t/pt 運輸 蛋白 /推定的運輸?shù)鞍? 337/254 r/pr 調(diào)節(jié) 蛋白 /推定的調(diào)節(jié)蛋白 241/164
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