分子遺傳學(xué)基因組及基因組學(xué)-文庫(kù)吧
2025-04-14 05:05 本頁(yè)面
【正文】 兩側(cè)邊界均有一對(duì)保守順序，即 5?端為 GU， 3?端為 AG，這類稱為 GUAG的內(nèi)含子均以相同方式剪切。 在不同的真核生物中，內(nèi)含子的一致順序有不少變化。 動(dòng)物中典型的剪接位置一致順序組成為： 5’AG↓GUAAGUYNYURAYY1020Y↓AG3’ 其中 Y為 U或 C， N為任何核苷酸，箭頭所指為外顯子與內(nèi)含子的交界。 5?端剪接位點(diǎn)稱供體位點(diǎn)（ donor site， 5?site,left splicing site）， 3?端剪接位點(diǎn)稱受體位點(diǎn)（ acceptor site， 3?site,right splicing site）。內(nèi)含子中還有另一段識(shí)別剪接邊界必不可少的序列稱為分枝點(diǎn) (branch site)，位于 3?端剪接位的上游，具有特征性序列組成： YNCURAY， 緊接在分枝點(diǎn)的下游有一段多嘧啶序列，也是參與剪接事件蛋白接合的位置。 類 型 分 布 內(nèi)含子性質(zhì)和剪接機(jī)制 轉(zhuǎn)酯內(nèi)含子 內(nèi)含子中的剪接識(shí)別位點(diǎn) GU— AG內(nèi)含子 真核細(xì)胞核前體mRNA 結(jié)構(gòu)變化，自由羥基的起始供體由內(nèi)部分支點(diǎn)腺嘌呤提供，剪接體進(jìn)行剪接，形成套索結(jié)構(gòu) AU－ AC內(nèi)含子 真核細(xì)胞核前體mRNA Ⅰ 型內(nèi)含子 真核細(xì)胞核前體mRNA，細(xì)胞器 RNA，少數(shù)細(xì)菌 RNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)保守，鳥(niǎo)核苷酸輔助因子是自由羥基供體，自我剪接，無(wú)套索結(jié)構(gòu)形成 Ⅱ 型內(nèi)含子 細(xì)胞器 RNA， 某些原核 RNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)保守 ,內(nèi)部腺嘌呤是自由羥基供體，形成套索結(jié)構(gòu)中間體，自身催化剪接 Ⅲ 型內(nèi)含子 細(xì)胞器 RNA 與 Ⅱ 型內(nèi)含子類似，但較?。?100－ 200bp），包含數(shù)量有限的結(jié)構(gòu)域 孿生內(nèi)含子 細(xì)胞器 RNA 多嵌合自我剪接內(nèi)含子，常為 Ⅱ型或 Ⅱ 型和 Ⅲ 型混合，經(jīng)常以特定的順序剪接 非轉(zhuǎn)酯內(nèi)含子 剪接識(shí)別涉及外顯子結(jié)構(gòu) 細(xì)胞核 tRNA內(nèi)含子 真核生物細(xì)胞核前體 tRNA 剪接機(jī)制類似于 tRNA的成熟 ——涉及剪切后的連接；沒(méi)有中間體形成 —— 內(nèi)含子以線性片段切除；需要機(jī)制核酸酶進(jìn)行加工。 真核生物基因組 C－值悖理和 N－值悖理 基因組是指一個(gè)細(xì)胞或病毒所包含的全部基因 。 通常在真核生物中指一個(gè)物種的單倍體染色體組所含有的一整套基因 。 生物體的單倍體基因組所含 DNA的總量稱為 C值（ 單位為： DNA pg或 bp或 Kb或 Mb/某個(gè)單倍體基因組 ） 。 基因組的大小大致上與進(jìn)化的復(fù)雜性有關(guān) 。 生物基因組的大小同生物在進(jìn)化上所處地位的高低及復(fù)雜性之間無(wú)嚴(yán)格的對(duì)應(yīng)關(guān)系 ， 這種現(xiàn)象通常稱為 C值悖理 (Cvalue paradox)。 物種的基因數(shù)目與生物進(jìn)化程度或生物復(fù)雜性的不對(duì)應(yīng)性， 這 被 稱 之 為 N（ number of genes） 值悖理 (N value paradox)或 G（ number of genes） 值悖理 。 物 種 基因組（ Mb） 基因數(shù) 生殖道支原體 （ Mycoplasma genitalium） 470 Rickettsia prowazekii 834 Haemophilus influenzae 1,743 Methanococcus jannaschi 1,738 4,100 大腸桿菌 4,288 釀酒酵母 （ Saccharomyces cerevisiae） 6,034 裂殖酵母 （ Schizosaccharomyces pombe） 4,929 擬南芥 （ Arabidopsis thaliana） 119 25,498 水稻 （ Oryza sativa） 466 ～ 40,000 黑腹果蠅 （ Drosophila melanogaster） 165 13,601 秀 麗線蟲(chóng) （ Caenorhabditis elegans） 97 18,424 人（ Homo sapiens） 3,300 20,00025,000 楊樹(shù) (Populus trichocarpa) 485177。 10 Mb 45,555 蜜蜂 (Apis mellifera) 262177。 1 Mb. ～ 10,000 真核生物 DNA的復(fù)性動(dòng)力學(xué) 單鏈 DNA所占百分?jǐn)?shù) C/Co 是 DNA濃度 Co同反應(yīng)時(shí)間 t乘積的函數(shù)，通常用 Cot來(lái)表示 當(dāng)復(fù)性反應(yīng)完成一半時(shí) (C/Co＝1/2 , t=1/2 ),這時(shí)的 Cot值定義為Cot1/2 CoT1/2值的特性 當(dāng)條件一定時(shí) ， CoT1/2值 的大小與 DNA的分子量及復(fù)雜性有關(guān) 。 DNA分子的復(fù)雜性是指最長(zhǎng)的沒(méi)有重復(fù)序列的核苷酸對(duì)的數(shù)目 。 CoT1/2值 越大，表示復(fù)性速度越慢， DNA的分子量越大， 在不存在重復(fù)序列的情況下 ,值與基因組的大小成正比， 在有重復(fù)順序的復(fù)性中 ,在同一個(gè)復(fù)性曲線上的各動(dòng)力學(xué)組分的并不因基因組的大小而增減 ,而是與 DNA序列的重復(fù)頻率成反比。 復(fù)性動(dòng)力學(xué)提供真核基因組序列信息 原核生物基因組 DNA多為單一序列，真核生物基因組 DNA有重復(fù)序列。原核生物基因組的曲線通常只有一個(gè)拐點(diǎn)，曲線是單一的 S形曲線；而真核生物基因組 DNA曲線通常有幾個(gè)拐點(diǎn)，真核生物基因組的曲線是多 S形曲線，由若干個(gè)（一般 2－ 3個(gè)） S形加合成的曲線。 單一序列 (unique sequence)又稱“單拷貝序列（ singlecopy sequence） ”,“非重復(fù)序列（ nonrepetitive sequence） ”。 在基因組中只含有一個(gè)拷貝的序列叫單一序列 。 輕度重復(fù)序列 (slightly repetitive sequence) 一般在一個(gè)基因組內(nèi)有 2～ 10份拷貝，但有時(shí) 2～ 3份拷貝的 DNA序列也被視作非重復(fù)序列。 中度重復(fù)序列 （ moderately repetitive sequence） 一般指10份到幾百份拷貝的 DNA序列。 高度重復(fù)序列
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