分子遺傳學基因組及基因組學-文庫吧
2025-04-14 05:05 本頁面
【正文】 兩側邊界均有一對保守順序，即 5?端為 GU， 3?端為 AG，這類稱為 GUAG的內含子均以相同方式剪切。 在不同的真核生物中，內含子的一致順序有不少變化。 動物中典型的剪接位置一致順序組成為： 5’AG↓GUAAGUYNYURAYY1020Y↓AG3’ 其中 Y為 U或 C， N為任何核苷酸，箭頭所指為外顯子與內含子的交界。 5?端剪接位點稱供體位點（ donor site， 5?site,left splicing site）， 3?端剪接位點稱受體位點（ acceptor site， 3?site,right splicing site）。內含子中還有另一段識別剪接邊界必不可少的序列稱為分枝點 (branch site)，位于 3?端剪接位的上游，具有特征性序列組成： YNCURAY， 緊接在分枝點的下游有一段多嘧啶序列，也是參與剪接事件蛋白接合的位置。 類 型 分 布 內含子性質和剪接機制 轉酯內含子 內含子中的剪接識別位點 GU— AG內含子 真核細胞核前體mRNA 結構變化，自由羥基的起始供體由內部分支點腺嘌呤提供，剪接體進行剪接，形成套索結構 AU－ AC內含子 真核細胞核前體mRNA Ⅰ 型內含子 真核細胞核前體mRNA，細胞器 RNA，少數細菌 RNA 二級結構保守，鳥核苷酸輔助因子是自由羥基供體，自我剪接，無套索結構形成 Ⅱ 型內含子 細胞器 RNA， 某些原核 RNA 二級結構保守 ,內部腺嘌呤是自由羥基供體，形成套索結構中間體，自身催化剪接 Ⅲ 型內含子 細胞器 RNA 與 Ⅱ 型內含子類似，但較小（ 100－ 200bp），包含數量有限的結構域 孿生內含子 細胞器 RNA 多嵌合自我剪接內含子，常為 Ⅱ型或 Ⅱ 型和 Ⅲ 型混合，經常以特定的順序剪接 非轉酯內含子 剪接識別涉及外顯子結構 細胞核 tRNA內含子 真核生物細胞核前體 tRNA 剪接機制類似于 tRNA的成熟 ——涉及剪切后的連接；沒有中間體形成 —— 內含子以線性片段切除；需要機制核酸酶進行加工。 真核生物基因組 C－值悖理和 N－值悖理 基因組是指一個細胞或病毒所包含的全部基因 。 通常在真核生物中指一個物種的單倍體染色體組所含有的一整套基因 。 生物體的單倍體基因組所含 DNA的總量稱為 C值（ 單位為： DNA pg或 bp或 Kb或 Mb/某個單倍體基因組 ） 。 基因組的大小大致上與進化的復雜性有關 。 生物基因組的大小同生物在進化上所處地位的高低及復雜性之間無嚴格的對應關系 ， 這種現象通常稱為 C值悖理 (Cvalue paradox)。 物種的基因數目與生物進化程度或生物復雜性的不對應性， 這 被 稱 之 為 N（ number of genes） 值悖理 (N value paradox)或 G（ number of genes） 值悖理 。 物 種 基因組（ Mb） 基因數 生殖道支原體 （ Mycoplasma genitalium） 470 Rickettsia prowazekii 834 Haemophilus influenzae 1,743 Methanococcus jannaschi 1,738 4,100 大腸桿菌 4,288 釀酒酵母 （ Saccharomyces cerevisiae） 6,034 裂殖酵母 （ Schizosaccharomyces pombe） 4,929 擬南芥 （ Arabidopsis thaliana） 119 25,498 水稻 （ Oryza sativa） 466 ～ 40,000 黑腹果蠅 （ Drosophila melanogaster） 165 13,601 秀 麗線蟲 （ Caenorhabditis elegans） 97 18,424 人（ Homo sapiens） 3,300 20,00025,000 楊樹 (Populus trichocarpa) 485177。 10 Mb 45,555 蜜蜂 (Apis mellifera) 262177。 1 Mb. ～ 10,000 真核生物 DNA的復性動力學 單鏈 DNA所占百分數 C/Co 是 DNA濃度 Co同反應時間 t乘積的函數，通常用 Cot來表示 當復性反應完成一半時 (C/Co＝1/2 , t=1/2 ),這時的 Cot值定義為Cot1/2 CoT1/2值的特性 當條件一定時 ， CoT1/2值 的大小與 DNA的分子量及復雜性有關 。 DNA分子的復雜性是指最長的沒有重復序列的核苷酸對的數目 。 CoT1/2值 越大，表示復性速度越慢， DNA的分子量越大， 在不存在重復序列的情況下 ,值與基因組的大小成正比， 在有重復順序的復性中 ,在同一個復性曲線上的各動力學組分的并不因基因組的大小而增減 ,而是與 DNA序列的重復頻率成反比。 復性動力學提供真核基因組序列信息 原核生物基因組 DNA多為單一序列，真核生物基因組 DNA有重復序列。原核生物基因組的曲線通常只有一個拐點，曲線是單一的 S形曲線；而真核生物基因組 DNA曲線通常有幾個拐點，真核生物基因組的曲線是多 S形曲線，由若干個（一般 2－ 3個） S形加合成的曲線。 單一序列 (unique sequence)又稱“單拷貝序列（ singlecopy sequence） ”,“非重復序列（ nonrepetitive sequence） ”。 在基因組中只含有一個拷貝的序列叫單一序列 。 輕度重復序列 (slightly repetitive sequence) 一般在一個基因組內有 2～ 10份拷貝，但有時 2～ 3份拷貝的 DNA序列也被視作非重復序列。 中度重復序列 （ moderately repetitive sequence） 一般指10份到幾百份拷貝的 DNA序列。 高度重復序列
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