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分子遺傳學基因組及基因組學-全文預覽

2025-05-20 05:05 上一頁面

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【正文】 散在不同染色體上 。根據(jù)其重復序列的長短,可分為短散在重復序列( short interspersed repeated sequence) 又稱為短散在核元件( short interspersed nuclear elements, SINEs) 和長散在重復序列 (long interspersed repeated sequence)又稱為長散在核元件( long interspersed nuclear elements, LINEs) 。根據(jù)其在染色體上所處的位置和重復單元的長度,有兩種形式的小衛(wèi)星 DNA,一種是端粒 DNA,另一種位于亞端粒區(qū),稱為可變數(shù)目串聯(lián)重復( varible number tandem repeat, VNTR) ,是由短重復單元( 6~ 40bp) 串聯(lián)重復( 6~ 100次以上)而成的 DNA序列。 高度重復序列 (highly repetitive sequence ) 重復次數(shù)極高, 一個基因組中有幾百份甚至幾百萬份拷貝的高度重復序列 。 單一序列 (unique sequence)又稱“單拷貝序列( singlecopy sequence) ”,“非重復序列( nonrepetitive sequence) ”。 DNA分子的復雜性是指最長的沒有重復序列的核苷酸對的數(shù)目 。 物種的基因數(shù)目與生物進化程度或生物復雜性的不對應(yīng)性, 這 被 稱 之 為 N( number of genes) 值悖理 (N value paradox)或 G( number of genes) 值悖理 。 通常在真核生物中指一個物種的單倍體染色體組所含有的一整套基因 。 5?端剪接位點稱供體位點( donor site, 5?site,left splicing site), 3?端剪接位點稱受體位點( acceptor site, 3?site,right splicing site)。 Gilbert將在前體 RNA拼接產(chǎn)生 mRNA過程中丟失的片段稱為內(nèi)含子(intron),而將拼接后表達的片段稱為外顯子 (exon)。 λ噬菌體只能轉(zhuǎn)導 染色體 DNA 上的半乳糖基因 (gal) 和生物素基因 (bio) 。在噬菌體 DNA裝入外殼蛋白組成新的噬菌體時,大約在 105~107次裝配中有一次裝配錯誤。接合能傳遞大段的 DNA,在細菌的遺傳重組中是效率最高的 。 2405個已知啟動子的操縱子中, 68%只有 1個啟動子, 20%有 2個, 12%有 3個或更多個啟動子; ( regulatory gene)即調(diào)節(jié)子( regulon)所調(diào)控; rRNA的 rrn基因是多拷貝 ,一般情況下結(jié)構(gòu)基因都是單拷貝; DNA部份所占比例比真核細胞基因組少得多; . 功能分類 基因數(shù)目 所占百分數(shù) 調(diào)節(jié) 功能 /可能調(diào)節(jié) 45/133 細胞 結(jié)構(gòu) /推定的膜蛋白 182/13 推定的結(jié)構(gòu)蛋白 42 噬菌體 、 轉(zhuǎn)座子 、 質(zhì)粒 87 運輸和 結(jié)合蛋白 /推定的運輸?shù)鞍? 281/146 能量代謝 243 DNA復制 、 重組 、 修飾和修復 115 轉(zhuǎn)錄 、 RNA合成 、 代謝和修飾 55 翻譯 、 翻譯后蛋白質(zhì)修飾 182 細胞作用 ( 包括適應(yīng) 、 保護 ) 188 輔助因子 、 輔基和載體的生物合成 103 運輸?shù)陌閭H蛋白 9 核苷酸的生物合成和代謝 58 氨基酸的生物合成和代謝 131 脂肪酸和磷脂的代謝 48 碳化合物的分解代謝 130 主要的中間代謝 188 推定的酶 251 其他的已知基因 ( 已知的基因產(chǎn)物或表型 ) 26 推定的 、 未分類的 、 未知的蛋白 1632 總計 4288 * 功能分類 基因數(shù)目 所占百分數(shù) 調(diào)節(jié) 功能 /可能調(diào)節(jié) 45/133 細胞結(jié)構(gòu) 182 推定的膜蛋白 13 推定的結(jié)構(gòu)蛋白 42 噬菌體 、 轉(zhuǎn)座子 、 質(zhì)粒 87 運輸和結(jié)合蛋白 281 推定的運輸?shù)鞍? 146 能量代謝 243 DNA復制 、 重組 、 修飾和修復 115 轉(zhuǎn)錄 、 RNA合成 、 代謝和修飾 55 翻譯 、 翻譯后蛋白質(zhì)修飾 182 細胞作用 ( 包括適應(yīng) 、 保護 ) 188 輔助因子 、 輔基和載體的生物合成 103 運輸?shù)陌閭H蛋白 9 核苷酸的生物合成和代謝 58 氨基酸的生物合成和代謝 131 脂肪酸和磷脂的代謝 48 碳化合物的分解代謝 130 主要的中間代謝 188 推定的酶 251 其他的已知基因 ( 已知的基因產(chǎn)物或表型 ) 26 推定的 、 未分類的 、 未知的蛋白 1632 總計 4288 * 代碼 基因產(chǎn)物類型 數(shù)目 百分比 2 e/pe 酶 /推定的酶 1094 /390 t/pt 運輸 蛋白 /推定的運輸?shù)鞍? 337/254 r/pr 調(diào)節(jié) 蛋白 /推定的調(diào)節(jié)蛋白 241/164 m/pm 膜 蛋白 /推定的膜蛋白 43/210 f/pf 蛋白 因子 /推定的蛋白因子 150/60 sps 結(jié)構(gòu)蛋白 成分 /推定的結(jié)構(gòu)蛋白成分 89/37 c/pc 傳遞 蛋白推定的傳遞蛋白 / 77/42 n RNA 156 lp 脂蛋白 46 cp 細胞作用 56 l 引導肽 11 su 共同的假基因 74 i 起始位點 (oriC) 1 h 共同的噬菌體 /插入序列 (包括 15個假基因 ) 304 d 部分信息 146 o 未知功能 471 總計 44531 接合 是通過細菌細胞直接的接觸,遺傳信息從給體單向轉(zhuǎn)移到受體從而實現(xiàn)遺傳重組的過程。 噬菌體細菌時,細菌染色體斷裂成許多小片段。 局限性轉(zhuǎn)導( specialized transduction) 噬菌體只是轉(zhuǎn)導供體菌某些基因的轉(zhuǎn)導過程。 斷裂基因( split gene) 即不連續(xù)基因( interrupted gene) 一個基因被不編碼蛋白質(zhì)的 DNA片段分割成不連續(xù)的幾部
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