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基因與基因組學(xué)ppt課件-文庫吧資料

2025-05-18 03:59本頁面
  

【正文】 tive DNA) 衛(wèi)星 DNA( satellite DNA) 反向重復(fù)序列 ( inverted repeats) 重復(fù)次數(shù) 106次 81 ( 1) 衛(wèi)星 DNA 存在于非編碼區(qū)的串聯(lián)重復(fù)序列, 在基因組中約占 5%。 77 染色體 DNA線粒體 DNA 78 人類基因組染色體 (一)染色體 DNA的組成 核小體 79 1. 單一序列 DNA ( unique sequence DNA ) 單一序列在人類基因組中大于 50%。 可形成共合體 轉(zhuǎn)座子 融合 73 轉(zhuǎn)座子 F E A B C D 復(fù)制 插入 轉(zhuǎn)座子新拷貝 F E A B C D 引起插入突變 基因 F被隔斷而失去功能 74 攜帶標(biāo)志基因使受體增添新基因 Tn3 轉(zhuǎn)座酶 Tn10 轉(zhuǎn)座酶 氨芐青霉素抗性 四環(huán)素抗性 75 (六)質(zhì)粒( plasmid) 質(zhì)粒 是存在于細(xì)菌染色體外的,具有自主復(fù)制能力的環(huán)狀雙鏈 DNA分子;大小為 23 kb。 ? 其主要貢獻(xiàn)就是發(fā)現(xiàn)玉米中的轉(zhuǎn)座子現(xiàn)象:基因組中一段 DNA序列在基因組中移動,可以通過切割、重新整合等一系列過程從基因組的一個位置“跳躍”到另一個位置。 “轉(zhuǎn)座子”先驅(qū)麥克林托克 ? 芭芭拉 ?麥克林托克 81歲才獲得諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎,成為遺傳學(xué)研究領(lǐng)域第一位獨(dú)立獲得諾貝爾獎的女科學(xué)家。 操縱子 operon: 58 (三)其它結(jié)構(gòu)特點 C 值: 4,639,221 bp 基因數(shù): 4288 基因大?。?950bp/gene 基因間隔: 118bp/2 gene ,編碼區(qū)在 基因組中所占比例大; ,多為 單拷貝, rRNA基因為多拷貝; ,重復(fù)片段為 轉(zhuǎn)座子; 50kb 59 ( isogene) ?分支酸別構(gòu)酶 ? ilvBN acetolactate synthase I ? ilvIH acetolactate synthase III ?乙酰乳酸合酶 ? entC isochorismate synthase ? entB isochorismatase 60 GC含量 ( GC content) 變化很大 (25%75%) Escherichia coli Micrococcus luteus 藤黃微球菌 Bacillus subtilis Serratia marcescens 枯草桿菌 粘質(zhì)沙雷菌 大腸桿菌 %GC 51 51 52 55 58 52 37 66 61 43 45 33 39 25 75 73 69 Shigella flexnerl 志賀氏桿菌(痢疾) Salmonella typhimurium 鼠傷寒沙門菌 Klebsiella pneumoniae 肺炎克雷伯士氏桿菌 Mycopiasma capricolum 支原體 61 (四)非編碼區(qū)主要是調(diào)控序列: 復(fù)制起始區(qū)( OriC) 復(fù)制終止區(qū)( TerC) 轉(zhuǎn)錄起動區(qū) 轉(zhuǎn)錄終止區(qū) 62 復(fù)制起始區(qū)( OriC) 63 大腸桿菌強(qiáng)啟動子 TTGAC TATAAT 轉(zhuǎn)錄起始 64 G A C C G C C G C U G G C G G C A U U U UOH 3’ 5’ U U C G G 5’ … GCCGCCAGUUCGGCUGGCGGCAUUUU… 3’ RNA 5’ … GCCGCCAGTTCGGCTGGCGGCATTTT… 3’ DNA 終止子: 強(qiáng)終止子:有反向重復(fù)順序,可形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),其后面為 poly(T)結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄終止無需 ρ因子。galactoside permease透酶 y 223。 CValue: 106bp 大腸桿菌染色體 DNA 大腸桿菌 4000K 3000K 2022K 1000K 0 OriC TerC 56 (二 ) 結(jié)構(gòu)基因大多組成操縱子 乳糖操縱子 lac operon t a y z o p structural gene promoter terminator operator 223。 流感病毒 、濾泡性口腔炎病毒、 狂犬病毒 40 呼腸孤病毒 reovirus RNA病毒 11節(jié)段 dsRNA 內(nèi)衣殼蛋白 外衣殼蛋白 41 正負(fù)雙鏈 RNA, 10- 12節(jié)段、 每段編碼一個蛋白質(zhì) 呼腸孤病毒、輪狀病毒、 噬菌體 Φ 6 42 (retrovirus) 核心蛋白 逆轉(zhuǎn)錄酶 膜蛋白 poly(A) Cap 人類免疫缺陷病毒( HIV) 43 單股正鏈 RNA, 有三個基本的結(jié)構(gòu) 基因: gag、 pol( 逆轉(zhuǎn)錄酶 )、 env, 白血病病毒、肉瘤病毒、 人類免疫缺陷病毒 5′ 端有甲基化帽, 3′ 端有 poly(A), 另有多個基因表達(dá)調(diào)控位點。 33 34 一、病毒基因組 DNA病毒 RNA病毒 (一)基本結(jié)構(gòu) 多數(shù)為雙鏈 (ds)、 環(huán)狀或線性 多數(shù)為單鏈 (ss)、 線性 35 (二) RNA病毒基因組 類型 特點 代表種類 36 RNA病毒 SARS冠狀病毒 SARS coronavirus 包膜蛋白 膜蛋白 核衣殼蛋白 刺突蛋白 病毒 RNA聚合酶 37 單股正鏈 RNA、 不分節(jié)段, 5′ 端有甲基化帽, 3′ 端有 poly(A)結(jié)構(gòu)。比如,兩棲類生物中最小的基因組不足 109Mbp,最大的則達(dá) 1011Mbp,又如昆蟲中的家蠅基因組比果蠅基因組大 6倍左右。 因此,從總體上說,生物基因組的大小同生物在進(jìn)化上所處地位的高低無關(guān),這種現(xiàn)象稱為 C值悖理 (C—Value paradox)。顯花植物和兩棲類動物的基因組最大,軟骨魚、硬骨魚甚至昆蟲和軟體動物的基因組都大于包括人類在內(nèi)的哺乳動物的基因組。如蠕蟲的 C值大于霉菌、藻類、真菌、細(xì)菌和支原體。能營獨(dú)立生活的最小的生物 ——支原體 (Mycoplasma)的 C值不 106bp,一些植物和兩棲類動物的 C值則可多達(dá)1011Mbp,相差 10萬倍。 30 ?基因組 :一個細(xì)胞或病毒的全部 遺傳信息; 第二節(jié) 基因組 一套完整的單倍體的遺傳物質(zhì)的總合; 含有一種生物的一整套遺 傳信息的遺傳物質(zhì); …… 31 C值( Cvalue): 單倍體基因組中的全部 DNA量 (bp) 32 106 107 108 109 1010 1011 顯花植物 骨魚類 哺乳類 甲殼類 爬行類 鳥類 藻類 真菌 革蘭氏陽性菌 革蘭氏陰性菌 枝原體 霉菌 蠕蟲類 軟體動物 棘皮類 昆蟲類 軟骨魚類 兩棲類 C值 ? C值悖理 C值 ? 生物體的單倍體基因組所含 DNA總量稱為 C值。 26 CAAT box TATA box Enhancer promoter 調(diào)控序列 調(diào)控序列 真核生物基因的結(jié)構(gòu) exon exon 非翻譯區(qū) : untranslated regions , UTR UTR UTR Poly(
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