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分子生物學(xué)(上)-文庫(kù)吧資料

2025-04-13 03:16本頁(yè)面
  

【正文】 0S的剪接體,進(jìn)行 RNA前體分子的剪接。RNA的剪切: 許多相對(duì)分子質(zhì)量較小(106~185bp)的核內(nèi) RNA(如 U1,U2,U4,U5和 U6)以及與這些 RNA相結(jié)合的核蛋白(snRNP)參與 RNA的剪接。保守序列 GUAG,AUAC次要區(qū)別:Ⅰ、Ⅱ型剪接本身具有催化功能,屬于核酸催化,Ⅰ類(lèi)需游離鳥(niǎo)苷或鳥(niǎo)苷酸啟動(dòng),Ⅱ類(lèi)無(wú)需,mRNA 剪接屬于蛋白催化。mRNA:許多分子量較小的核內(nèi) RNA(U1,U2,U4,U5,U6)以及與這些 RNA結(jié)合的核蛋白(snRNA)參與 RNA剪接。Ⅰ型:鳥(niǎo)苷或鳥(niǎo)苷酸的 3’-OH 作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子 5’端磷酸二酯鍵,從上游切開(kāi) DNA鏈;8 / 12再由上游外顯子(第一個(gè))的自由 3’-OH 作為親核基團(tuán)攻擊內(nèi)含子 3’核苷酸的磷酸二酯鍵,使內(nèi)含子被完全切開(kāi)(不發(fā)生水解,無(wú)需供能) ;上下游兩個(gè)外顯子通過(guò)新的磷酸二酯鍵相連。RNA 合成起始后,ρ 因子即附著在新生的 RNA鏈上,靠 ATP水解能量,沿 5’?3’朝 RNA聚合酶移動(dòng),到達(dá)RNA的 3’-OH 端后取代了暫停在終點(diǎn)位上的 RNA聚合酶,使之從模板 DNA釋放 nRNA,完成轉(zhuǎn)錄。終止效率與二重對(duì)稱(chēng)序列和寡聚 U的長(zhǎng)短有關(guān)。 新生 DNA中的發(fā)卡結(jié)構(gòu)會(huì)導(dǎo)致 RNA聚合酶的暫停,破壞 RNADNA雜合鏈 5’端的正常結(jié)構(gòu);寡聚 U使雜合鏈的 3’部分出現(xiàn)不穩(wěn)定 rU?da區(qū)域。終止因子:協(xié)助 RNA聚合酶識(shí)別終止信號(hào)的蛋白因子。由于 CpG甲基化增加了胞嘧啶殘基突變的可能性,5-mC 也作為內(nèi)源性誘變劑或致癌因子調(diào)節(jié)基因表達(dá)。真核生物中 5-mC 主要出現(xiàn)在 5’-CpG-3’序列中,5-mC 脫氨后生成的胸腺嘧啶,不易被識(shí)別和矯正。因?yàn)榧谆瘜?duì)轉(zhuǎn)錄的抑制強(qiáng)度與 MeCP1結(jié)合 DNA的能力成正相關(guān),甲基化CpG的密度和啟動(dòng)子強(qiáng)度之間的平衡決定了該啟動(dòng)子是否具有轉(zhuǎn)錄活性。當(dāng)這一類(lèi)啟動(dòng)子被增強(qiáng)時(shí)(帶有增強(qiáng)子) ,既使不去甲基化也可以恢復(fù)其轉(zhuǎn)錄活性。5-甲基胞嘧啶在 DNA上并不是隨機(jī)分布的,基因的 5’端和 3’端往往富含甲基化位點(diǎn),而啟動(dòng)區(qū) DNA分子上的甲基化密度與基因轉(zhuǎn)錄受抑制的程度密切相關(guān)。研究表明,當(dāng)組蛋白 H1與含 CCGG序列的甲基化或非甲基化 DNA分別形成復(fù)合體時(shí),DNA 的構(gòu)型存在著很大的差別,甲基化達(dá)到一定程度時(shí)會(huì)發(fā)生從常規(guī)的 BDNA向 ZDNA的過(guò)渡。在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出現(xiàn)在 CpG序列、CpXpG、CCA/TGG 和 GATC中。28 DNA甲基化狀態(tài)可能調(diào)節(jié) DNA復(fù)制的機(jī)理如何?P250DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA 構(gòu)象、DNA 穩(wěn)定性及 DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。相對(duì)分子量較大的前體 RNA出現(xiàn)在核內(nèi),只有成熟的,相對(duì)分子量明顯變小并經(jīng)過(guò)化學(xué)修飾的 mRNA才進(jìn)入胞質(zhì)。原核 mRNA5’端無(wú)帽子結(jié)構(gòu),3’端無(wú)poly(A)或只有較短的 poly(A)幾乎都是單順?lè)醋?,通過(guò) RNA聚合酶Ⅱ進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。mRNA可分為:①編碼區(qū)②位于 AUG之前 5’端上游非編碼區(qū)③終止密碼之后不翻譯的3’端下游非編碼區(qū)。mRNA帽子常被甲基化;帽子結(jié)構(gòu)可能使mRNA免受核酸酶破壞。原核 真核mRNA 半衰期短,細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄和翻譯是緊密相連的,一旦轉(zhuǎn)錄開(kāi)始,核糖體就結(jié)合到mRNA5’端啟動(dòng)蛋白結(jié)合,當(dāng)一個(gè) mRNA5’開(kāi)始降解時(shí),3’可能仍在合成或被翻譯。GC區(qū)同上27 原核生物與真核生物 mRNA的特征主要表現(xiàn)在什么地方?單順?lè)醋樱褐痪幋a一個(gè)蛋白質(zhì)的 mRNA稱(chēng)為單順?lè)醋印?6 真核生物的啟動(dòng)子區(qū)的主要結(jié)構(gòu)特征是什么?各部分的作用如何?(原核生物:-10bpTATA 區(qū) -35bpTTGACA 區(qū))真核生物:-25~30bpTATA 區(qū),-70~-78bpCAAT 區(qū),GC 區(qū)上游啟動(dòng)子原件 UPE或上游激活序列 UASTATA區(qū):使轉(zhuǎn)錄精確地開(kāi)始,提供結(jié)合位點(diǎn)。特點(diǎn):72bp,起始位點(diǎn)約 200bp處。25 何謂增強(qiáng)子其作用機(jī)制和特點(diǎn)是什么?增強(qiáng)子:能強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的序列為增強(qiáng)子或強(qiáng)化子。在解鏈區(qū)后面,DFNA 模板鏈與原先配對(duì)的非模板鏈重新結(jié)合成雙螺旋。轉(zhuǎn)錄起始后直到形成 9個(gè)核苷酸短鏈?zhǔn)雇ㄟ^(guò)啟動(dòng)子階段,轉(zhuǎn)錄開(kāi)始進(jìn)入正常的延伸階段。轉(zhuǎn)錄起始前,啟動(dòng)子附近的 DNA雙鏈會(huì)分開(kāi)形成轉(zhuǎn)錄泡,促使底物 NTP,與模板 DNA配對(duì)。24 試述轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程。P69酶 細(xì)胞內(nèi)定位 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 相對(duì)活性 敏感程度6 / 12DNApolyaseⅠ 核仁 rRNA 50~70% -DNApolyaseⅡ 核質(zhì) hnRNA 20~40% +DNApolyaseⅢ 核質(zhì) tRNA ≈10% 存在物種特異三種聚合酶中有兩個(gè)行對(duì)分子量超過(guò) 1105的大亞基;同種生物 3類(lèi)聚合酶有“共享”小亞基的傾向。轉(zhuǎn)錄起點(diǎn):指與新生 DNA鏈上第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)的 DNA鏈上的堿基。啟動(dòng)子:5’確保轉(zhuǎn)錄精確而有效地起始的序列。將其轉(zhuǎn)化成相應(yīng) AA后加入肽鏈的轉(zhuǎn)移 RNA。mRNA:編碼特定蛋白質(zhì)序列的信使 RNA。關(guān)于轉(zhuǎn)錄的幾個(gè)概念編碼鏈:有意義鏈,與 mRNA序列相同的 DNA鏈。σ:是酶的別構(gòu)效應(yīng)物,提高 RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)子 DNA親和力,專(zhuān)一性識(shí)別模板上的啟動(dòng)子;不同 σ 因子識(shí)別不同啟動(dòng)子。β、β’:共同組成 RNA聚合酶反應(yīng)中心,與真核的兩個(gè)大亞基有同源性。全酶:核心酶加上一個(gè) σ 亞基,只有 σ 存在時(shí),轉(zhuǎn)錄起始才進(jìn)行,σ 亞基為起始亞基。(3)是轉(zhuǎn)錄過(guò)程種最重要的酶,但無(wú)校對(duì)功能。22 RNA聚合酶全酶與核心酶的組成成分及其作用是什么?主要區(qū)別?以 DNA為指導(dǎo)的 RNA聚合酶:(1)以 4種核糖核苷三磷酸 NTP作為底物,DNA 為模板,Mn 2+/Mg2+輔助因子。21 真核生物轉(zhuǎn)錄的主要成分有哪些?P66DNA模板,游離的核糖核酸,含 σ 因子的 RNA聚合酶,轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子。原核:-10TATA 區(qū),-35TTGACA 區(qū),啟動(dòng)區(qū)范圍較小。(4)引起生物進(jìn)化:可使原來(lái)相距甚遠(yuǎn)的基因組合倒一起,構(gòu)建成一個(gè)操縱子單元,也可能產(chǎn)生新功能蛋白。(2)殘生新基因。TnA家族:有 3個(gè)基因,其中一個(gè)編碼 β-內(nèi)酰胺酶,另兩個(gè)是轉(zhuǎn)座作用必須的。 (表明 IS序列插入到某個(gè)功能基因兩端時(shí)可能產(chǎn)生復(fù)合轉(zhuǎn)座子) 。2復(fù)合轉(zhuǎn)座因子:一類(lèi)帶有某些抗藥性基因(或其他宿主基因)的轉(zhuǎn)座子。5 / 12 (3)轉(zhuǎn)座時(shí)往往宿主靶位點(diǎn)一小段 DNA形成 IS兩端的正向重復(fù)序列。結(jié)構(gòu):(1)很小的 DNA片斷,1kb。轉(zhuǎn)座:一個(gè)轉(zhuǎn)座子由基因組的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位置的過(guò)程。易錯(cuò)修復(fù)和 SOS應(yīng)急反應(yīng):生物體為保細(xì)胞存活,受損部位既使出現(xiàn)不配對(duì)堿基也照樣復(fù)制,出現(xiàn)高突變率。直接修復(fù):把被損傷的堿基回復(fù)到原來(lái)的狀態(tài),并不需要切除堿基或核苷酸,光復(fù)活作用:DNA 光解酶。一旦復(fù)制起始。(2)核苷酸切除:核苷酸發(fā)生損傷后,由 DNA切割酶在已損傷的核苷酸 3’、5’分別切開(kāi)磷酸糖苷鍵,移去小片斷后由 DNA polyaseI合成新片斷,并由 DNA連接酶完成修復(fù)中的最后一道工序。這個(gè)過(guò)程可重復(fù)進(jìn)行直到生成原長(zhǎng) 20多倍的多聯(lián)體,并由噬菌體 DNA編碼的核酸酶特異切割形成單位長(zhǎng)度的 DNA分子。17 線(xiàn)性 DNA 5’端的復(fù)制如何?其生物學(xué)意義如何? 線(xiàn)性 DNA復(fù)制中的 RNA引物被切除后,留下 5’端部分單鏈 DNA,不能為 DNA聚合酶所作用,使子鏈短于母鏈。Ⅰ有Ⅱ、Ⅲ無(wú) 5’?3’外切活性。16 DNA Polymerase I, II, III性質(zhì)的比較 P47Ⅰ Ⅱ Ⅲ4 / 123’?5’外切 + + +5’?3’外切 + - -新生鏈合成 - - +生物學(xué)活性 1
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