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生產(chǎn)中常用菌種的分離、選育和保藏-文庫(kù)吧資料

2024-12-14 11:00本頁(yè)面
  

【正文】 適當(dāng)?shù)奶幚硎怪幱诟惺軕B(tài)-即容易接受外源 DNA的狀態(tài) ,然后利用短暫熱休克使 DNA導(dǎo)入細(xì)菌宿主中 。 根據(jù)所采用的載體的性質(zhì) , 將重組 DNA分子導(dǎo)入受體可有不同的方法 。 ? T4 DNA連接酶在分子克隆中主要用于: ? 1 、 連接具有同源互補(bǔ)粘性末端的DNA片段; ? 2 、 連接雙鏈 DNA分子間的平端; ? 3 、 在雙鏈平端的 DNA分子上添加合成的人工接頭或適配子 。 一、 DNA連接酶 ? DNA連接酶催化兩條雙鏈 DNA片段相鄰的 5’磷酸和 3’羥基間形成磷酸二酯鍵 。 DNA擴(kuò)增 PCR反應(yīng) DNA片斷的克隆 載體的條件 : a 復(fù)制起點(diǎn) b 適宜的限制酶切點(diǎn) c 選擇標(biāo)記 ? DNA分子的體外連接 DNA片段的體外連接是重組 DNA技術(shù)的關(guān)鍵 。 ? 使 DNA解鏈(高溫),引物結(jié)合于基因的兩端(低溫),在合適溫度下開(kāi)始合成(鏈延長(zhǎng))反應(yīng)。 ? 三、聚合酶鏈反應(yīng)法擴(kuò)增基因片段 ? 對(duì)于已知全部或部分核苷酸序列的基因,可以通過(guò)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),以基因組 DNA或 cDNA模板擴(kuò)增得到目的基因片段??扇コ婧松锘蛑胁槐磉_(dá)的內(nèi)含子。 目的基因的獲取 ? 一、通過(guò)建立基因文庫(kù)分離靶基因 ? 基因文庫(kù)包括兩類:基因組文庫(kù):利用限制性內(nèi)切酶。 載體應(yīng)具備以下條件: ? 1、能在適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞中復(fù)制; ? 2、具有多種限制酶的單一切點(diǎn)(即所謂多克隆位點(diǎn))以便外源 DNA插入; ? 3、具有篩選標(biāo)志以區(qū)別陽(yáng)性與陰性重組分子; ? 4、載體分子較小,以便體外基因操作,同時(shí)載體 DNA與宿主 DNA便于分離; ? 5、對(duì)于表達(dá)型載體還應(yīng)具有與宿主細(xì)胞相適應(yīng)的啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、加尾信號(hào)等基因表達(dá)元件。 它們之間是互補(bǔ)的 , 在適當(dāng)條件下可以再連接一起 。 常用的遺傳轉(zhuǎn)化系統(tǒng) ? 自然系統(tǒng) ? 人工誘導(dǎo)(完整細(xì)胞) ( 1)二價(jià)陽(yáng)離子系統(tǒng): Ca2+, Ca2++Mg2+, Mg2+,Ca2++輔助噬菌體, Tris+Ca 2+ ( 2)單價(jià)陽(yáng)離子系統(tǒng): PEG+Li+/Cs+/Rb+ ( 3)凍融系統(tǒng) ( 4) Triton處理:人工誘導(dǎo)( PEG/原生質(zhì)體) 重組 DNA中常用的工具酶 ? 包括限制性核酸內(nèi)切酶 、 DNA連接酶 、DNA聚合酶 、 逆轉(zhuǎn)錄酶等 . 限制性內(nèi)切酶 ? 切開(kāi) DNA分子所需的酶:每一種酶都有其各自的作用位點(diǎn) 。 13.于 37℃ 培養(yǎng)過(guò)夜。再插入冰中.加入 37℃ 靜置培養(yǎng) 90min。 10.加入 1~ 20μ l待轉(zhuǎn)化質(zhì)粒 DNA溶液。 7.加入 1ml / L CaCl2,再加 CaCl2,置冰浴中放置 20min。 4.當(dāng)培養(yǎng)物 OD600在 ~ ,開(kāi)始收獲細(xì)胞 (大約需 2~ ). 5.將培養(yǎng)物置冰浴中冷卻 10min。 2.取 50ml肉湯中,無(wú)菌添加 / LMgCl2,于 37℃ 振蕩培養(yǎng)。 四、遺傳轉(zhuǎn)化 轉(zhuǎn)化是指受體細(xì)胞直接攝取供體細(xì)胞游離的DNA片段,將其同源部分進(jìn)行堿基配對(duì),組合到自己的基因中,從而獲得供體細(xì)胞的某些遺傳性狀。在實(shí)驗(yàn)室條件下,質(zhì)粒也可經(jīng)人工手段將其轉(zhuǎn)化入宿主細(xì)胞內(nèi)。 質(zhì)粒載體 二、各類質(zhì)粒所賦予宿主細(xì)胞的不同表現(xiàn)型 抗生素抗性:抗生素的產(chǎn)生;大腸桿菌素的產(chǎn)生;腸毒素的產(chǎn)生;復(fù)雜有機(jī)化合物的降解;限制性核酸內(nèi)切酶和修飾酶的產(chǎn)生;殺傷性能。不同類型的質(zhì)粒其拷貝數(shù)各異 , 同一質(zhì)粒在不同條件下 , 拷貝數(shù)也可能差異很大 , 有嚴(yán)緊型和松弛型兩種 。 基因重組 一、質(zhì)粒的特點(diǎn) 質(zhì)粒的存在并非微生物生命活動(dòng)必需 。 第六節(jié) 基因育種 ? 基因重組育種:是運(yùn)用體外 DNA各種操作或修改手法獲得目的基因 , 再借助于病毒 、 細(xì)菌質(zhì)?;蚱渌d體 , 將目的基因轉(zhuǎn)移至新的宿主細(xì)胞并使其在新的宿主細(xì)胞系統(tǒng)內(nèi)進(jìn)行復(fù)制和表達(dá) , 或者通過(guò)細(xì)胞間的相互作用 , 使一個(gè)細(xì)胞的優(yōu)秀性狀經(jīng)其間遺傳物質(zhì)的交換而轉(zhuǎn)移給另 — 個(gè)細(xì)胞的方法 。 ? 以不同組合的營(yíng)養(yǎng)混合物與融化涼至 50℃ 的 MM培養(yǎng)基混合鋪成平皿 , 然后在這些平皿上劃線接種各個(gè)缺陷型菌株于各相應(yīng)位置 , 培養(yǎng)后根據(jù)在這些組合長(zhǎng)出可推知其營(yíng)養(yǎng)因子 。 培養(yǎng)后會(huì)在某組合區(qū)長(zhǎng)出 , 就可測(cè)得所需營(yíng)養(yǎng) 。 生長(zhǎng)譜測(cè)定的方法 ? 將缺陷型菌株培養(yǎng)后 , 收集菌體 , 制備成細(xì)胞懸液 , 與 MM培養(yǎng)基 (融化并涼至 50℃ )混合并傾注平皿 。 ? 此法缺點(diǎn)是 , 結(jié)果有時(shí)不明確 , 而且將缺陷型菌落從夾層中挑出并不很容易 。 (三 )夾層法 ? 先在培養(yǎng)皿上倒一層基本瓊脂培養(yǎng)基 , 凝固后涂上一層含菌的 MM, 凝固后再倒一薄層 MM瓊脂培養(yǎng)基 , 培養(yǎng) 24h, 將出現(xiàn)的菌落標(biāo)記 ,然后倒上一層 CM瓊脂培養(yǎng)基 , 再培養(yǎng) 。 ? 用接種針或牙簽將 CM上長(zhǎng)出的菌落在 MM和CM兩副平板上接種 , 依次在相應(yīng)位置點(diǎn)種 ,然后一起培養(yǎng) , 觀察其生長(zhǎng)情況 。 ? 此法要求平皿上菌落不能太多 , 菌落之間應(yīng)有一定間隔 。 ? 5. 二平皿相同方位進(jìn)行比較 , 即可發(fā)現(xiàn)在MM平皿上長(zhǎng)出的菌落少于 GM平板上的 。 ? 3. 將基本培養(yǎng)基平皿和完全培養(yǎng)基平皿在標(biāo)記的同一方位上先后輕輕一壓 , 此菌印模即復(fù)印于上 。 ? 具體方法:影印法、點(diǎn)種法、夾層法 ? 1. 將一較平皿直徑小 1cm的金屬圓筒蒙上一層滅菌的絲絨 , 用金屬夾夾住 , 滅菌 。 ? 菌絲過(guò)濾法:對(duì)于霉菌 , 因孢子生長(zhǎng)后會(huì)長(zhǎng)出菌絲體 , 就可用濾紙過(guò)濾法將菌絲濾去 , 而缺陷型孢子卻因未發(fā)芽而不能濾過(guò) 。 由于細(xì)菌或酵母對(duì)一些抗生素敏感 , 于是就相應(yīng)加入一定量的抗生素 ,結(jié)果活化狀態(tài)的野生型就被殺死 , 保存了缺陷型 。 要研究代謝途徑 , 育種技術(shù)都必須有營(yíng)養(yǎng)缺陷型的菌株為材料 。 營(yíng)養(yǎng)缺陷型的用途 ? 營(yíng)養(yǎng)缺陷型在生產(chǎn)上和科學(xué)研究上用途很大 。 ? 與營(yíng)養(yǎng)缺陷型對(duì)應(yīng)的是野生型 。根據(jù)處理前后的活孢子數(shù)可計(jì)算出死亡率。 3.誘變處理 吸取 MNNG溶液 lml,加入到 1m1孢子懸液中, 30℃ 振蕩 30min,立即稀釋 1000倍停止作用,然后以 102, 104兩個(gè)稀釋度分離培養(yǎng),30℃ 3天后計(jì)數(shù)。 ? (二 )操作步驟 1. 單孢子懸液制備 取斜面 , 加入 6ml / L , 用接種環(huán)刮下孢子 , 振蕩試管 , 立即通過(guò)帶濾紙漏斗過(guò)濾 , 由此制得單孢子懸液 , 若孢子液渾濁狀 , 其孢子濃度可達(dá) l06個(gè)/ ml, 此為待處理孢子懸液 。 其精確的作用機(jī)制尚不很清楚 , 據(jù)認(rèn)為是伴隨著重氮甲烷的生成及在酸性條件下生成亞硝酸 , 直接作用于細(xì)胞內(nèi)的 DNA復(fù)制系統(tǒng) , 從而誘發(fā)了變異 。 亞硝基胍誘變曲霉菌 ? N— 甲基 — N39。 6.取中間培養(yǎng)液稀釋分離、培養(yǎng)。 4.取未照射的制備菌液和照射菌液各 行稀釋分離,計(jì)數(shù)活菌細(xì)胞數(shù)。 在正式照射前 , 應(yīng)先開(kāi)紫外線 10min, 讓紫外燈預(yù)熱 , 然后開(kāi)啟皿蓋正式在攪拌下照射 10~ 50s。 將菌液倒入有定性濾紙的漏斗內(nèi)過(guò)濾 , 單細(xì)胞濾液裝入試管內(nèi) , 一般處于渾濁態(tài)的細(xì)胞液含細(xì)胞數(shù)可達(dá) 108個(gè)/ ml左右 , 作為待處理菌懸液 。 (二 )操作步驟 1. 將細(xì)菌培養(yǎng)液以 3000r/ min離心 5min, 傾去上清液 , 將菌體打散加入無(wú)菌生理鹽水再離心洗滌 。由于紫外線穿透力不強(qiáng),要求照射液不要太深,約 ~ ,同時(shí)要用電磁攪拌器或手工進(jìn)行攪拌,使照射均勻。一般我們常以細(xì)胞的死亡率表示 , 希望照射的劑量死亡率控制在 70~ 80%為宜 。 在以后的復(fù)篩階段 , 還應(yīng)不斷結(jié)合自然分離 , 純化菌株 。因此在具體方法上就有差異 . 例如初篩可以在平皿上直接以菌落的代謝產(chǎn)物與某些染料或基質(zhì)的作用形成的變色圈或透明圈的大小來(lái)挑取參加復(fù)篩者 , 而將 90%的菌落淘汰 。 初篩以迅速篩出大量的達(dá)到初步要求的分離菌落為目的 , 以量為主 。 這樣 , 隱性的變異就會(huì)顯現(xiàn)出來(lái) , 若不經(jīng)液體培養(yǎng)基的中間培養(yǎng) ,直接在平皿上分離就會(huì)出現(xiàn)變異和不變異細(xì)胞同時(shí)存在于一個(gè)菌落內(nèi)的可能 , 形成混雜菌落 ,以致造成篩選結(jié)果的不穩(wěn)定和將來(lái)的菌株退化 。 這個(gè)過(guò)程對(duì)今后的篩選和獲得穩(wěn)定菌株都是極為重要的 。 (三 )誘變處理 根據(jù)前面有關(guān)誘變劑及誘變處理的介紹 , 結(jié)合誘變對(duì)象的實(shí)際 , 設(shè)計(jì)誘變處理方案 。有的誘變劑是作用于營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞,就要選對(duì)數(shù)期的細(xì)胞:有的作用于休止期,就可選用孢子。 5.要盡量選擇單倍體細(xì)胞、單核或核少的多細(xì)胞體來(lái)作出發(fā)誘變細(xì)胞,這是由于變異性狀大部分是隱性的,特別是高產(chǎn)基因。 3. 每次誘變處理都有一定提高的菌株 , 往往多次誘變能積累較多的提高 。 二、誘變育種步驟 ?出發(fā)菌株的選擇 ?處理菌懸液的制備 ?誘變處理 ?中間培養(yǎng) ?分離和篩選 (一 )出發(fā)菌株的選擇 1. 自然界新分離的野生型菌株 , 對(duì)誘變處理較敏感 , 容易達(dá)到好的效果 。 電離輻射是造成染色體巨大損傷的最好誘變劑 , 它能造成不可回復(fù)的缺突變 。 3. 吖啶類誘變劑可以造成生化代謝途徑的完全中斷 。 2. 亞硝酸和烷化劑應(yīng)用的范圍較廣 , 造成的遺傳損傷較多 。 大部分誘變劑是致癌劑 , 所以在使用中必須非常謹(jǐn)慎 , 要避免化學(xué)誘變劑與皮膚接觸 ,且切勿吸入其蒸氣 , 有人對(duì)某些誘變劑極其敏感 , 甚至未直接接觸就會(huì)過(guò)敏 , 這就更要當(dāng)心 。 而用電離輻射 177。 使用化學(xué)誘變劑的優(yōu)缺點(diǎn): 大多數(shù)情況下 , 就突變數(shù)量而言 , 要比電離輻射更有效 。 化學(xué)誘變劑: 化學(xué)因子如堿基類似物 、 5— 氟尿嘧啶 、 烷化劑等 。 許多高產(chǎn)菌株的選育都用過(guò)紫外線 ,對(duì)于一般實(shí)驗(yàn)室 、 中小型工廠都適用 , 也很安全 。 ? 誘變育種:以誘發(fā)突變?yōu)榛A(chǔ)的育種 , 是迄今為止國(guó)內(nèi)外提高菌種產(chǎn)量 、 性能的主要手段 。 ? c. 賦予菌種對(duì)多種底物 , 特別是價(jià)廉而豐富的底物的利用能力 , 由此可降低操作費(fèi)用 。 改進(jìn)菌種的生長(zhǎng)效率 ? 提高菌株對(duì)底物的利用率方法: ? a. 通過(guò)確定并改變代謝中的耗能部分 。 提高特定基因的表達(dá)水平 ? (1)引入強(qiáng)轉(zhuǎn)錄及翻譯信號(hào) , 可通過(guò)在一高效表達(dá)載體上克隆靶基因;在靶基因的上游引入強(qiáng)啟動(dòng)子;修改現(xiàn)有表達(dá)信號(hào) , 提高基因效力等 。 (6)消除代謝產(chǎn)品的反饋抑制 。 (4)抑制或消除產(chǎn)品分解酶 。 (2)增加前體物的濃度 。 ? 如果對(duì)特定菌種的基本性狀及其工藝知曉甚少 ,則多半采用隨機(jī)誘變 、 篩選及選育等技術(shù): ? 如果對(duì)其遺傳及生物化學(xué)方面的性狀已有較深的認(rèn)識(shí) , 則可選擇基因重組等手段進(jìn)行定向育種 。 ? (3)改良菌種的評(píng)價(jià) (包括實(shí)驗(yàn)規(guī)模和工業(yè)生產(chǎn)規(guī)模 )。 工業(yè)菌種育種的方法 ? 誘變 ? 基因轉(zhuǎn)移 ? 基因重組 育種過(guò)程 ? 包括下列 3個(gè)步驟: ? (1)在不影響菌種活力的前提下 , 有益基因型的引入 。 第三節(jié) 工業(yè)菌種的育種方針 ? 工業(yè)菌種的育種: 是運(yùn)用遺傳學(xué)原理和技術(shù)對(duì)某個(gè)用于特定生物技術(shù)目的的菌株進(jìn)行的多方位的改造 。 七、生產(chǎn)選種 ? 是在長(zhǎng)年累月的生產(chǎn)實(shí)踐中 , 在培養(yǎng)工藝條件沒(méi)有任何可見(jiàn)變更情況下 , 突然發(fā)現(xiàn)某些批次生產(chǎn)水平提高較大 , 這就有可能是個(gè)別自然變異朝更好的方向變的細(xì)胞 , 在這種條件下很適應(yīng)于培養(yǎng)條件 , 并逐漸顯示出它的生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì) , 這種優(yōu)勢(shì)的發(fā)展 , 促使它優(yōu)良的生產(chǎn)性能表露 。 餌誘技術(shù)常用于水中真菌的富集 。 ? 植物材料中真菌的分離:植入法 , 壓貼法 , 洗滌法 , 浸泡法 。在分離培養(yǎng)基中加入一定的抗
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