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pcr擴增原理與操作-資料下載頁

2025-07-07 11:57本頁面
  

【正文】 是有時忘加Taq酶或溴乙錠。(3)引物:引物質(zhì)量、引物的濃度、兩條引物的濃度是否對稱,是PCR失敗或擴增條帶不理想、容易彌散的常見原因。有些批號的引物合成質(zhì)量有問題,兩條引物一條濃度高,一條濃度低,造成低效率的不對稱擴增,對策為:① 選定一個好的引物合成單位。② 引物的濃度不僅要看OD值,更要注重引物原液做瓊脂糖凝膠電泳,一定要有引物條帶出現(xiàn),而且兩引物帶的亮度應(yīng)大體一致,如一條引物有條帶,一條引物無條帶,此時做PCR有可能失敗,應(yīng)和引物合成單位協(xié)商解決。如一條引物亮度高,一條亮度低,在稀釋引物時要平衡其濃度。③ 引物應(yīng)高濃度小量分裝保存,防止多次凍融或長期放冰箱冷藏部分,導(dǎo)致引物變質(zhì)降解失效。④引物設(shè)計不合理,如引物長度不夠,引物之間形成二聚體等。(4)Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對PCR擴增效率影響很大,濃度過高可降低PCR擴增的特異性,濃度過低則影響PCR擴增產(chǎn)量甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶。(5)反應(yīng)體積的改變:通常進行PCR擴增采用的體積為20ml、30ml、50ml或100ml,用多大體積進行PCR擴增,是根據(jù)科研和臨床檢測不同目的而設(shè)定,在做小體積如20ml后,再做大體積時,一定要模索條件,否則容易失敗。(6)物理原因:變性對PCR擴增來說相當(dāng)重要,如變性溫度低,變性時間短,極有可能出現(xiàn)假陰性。退火溫度過低,可致非特異性擴增而降低特異性擴增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴增效率。有時還有必要用標(biāo)準(zhǔn)的溫度計,檢測一下擴增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。(7)靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補序列,其PCR擴增是不會成功的。2.假陽性出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。可能的原因是:(1)引物設(shè)計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計引物。(2)靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個基因組或大片段的交叉污染,導(dǎo)致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:① 操作時應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外。② 除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或 器材均應(yīng)高壓消毒。所用離心管及樣進槍頭等均應(yīng)一次性使用。③ 必要時,在加標(biāo)本前,反應(yīng)管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,與引物互補后,可擴增出PCR產(chǎn)物,而導(dǎo)致假陽性的產(chǎn)生,可用巢式PCR方法來減輕或消除。3.出現(xiàn)非特異性擴增帶PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān)。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:① 必要時重新設(shè)計引物。② 減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。③ 降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。④ 適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。4.出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:① 減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶;② 減少dNTP的濃度;③ 適當(dāng)降低Mg2+濃度;④ 增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。第三節(jié) 本次競賽PCR擴增反應(yīng)的試劑盒說明采用天根(TIANGEN,天根生化科技有限公司)2HosStart Taq Master Mix,該產(chǎn)品包含HotStart Taq DNA 聚合酶、dNTPs、MgCl反應(yīng)緩沖液、PCR反應(yīng)增強劑和優(yōu)化劑以及穩(wěn)定劑,濃度為2。1. 若不給自己設(shè)限,則人生中就沒有限制你發(fā)揮的藩籬。2. 若不是心寬似海,哪有人生風(fēng)平浪靜。在紛雜的塵世里,為自己留下一片純靜的心靈空間,不管是潮起潮落,也不管是陰晴圓缺,你都可以免去浮躁,義無反顧,勇往直前,輕松自如地走好人生路上的每一步3. 花一些時間,總會看清一些事。用一些事情,總會看清一些人。有時候覺得自己像個神經(jīng)病。既糾結(jié)了自己,又打擾了別人。努力過后,才知道許多事情,堅持堅持,就過來了。4. 歲月是無情的,假如你丟給它的是一片空白,它還給你的也是一片空白。歲月是有情的,假如你奉獻給她的是一些色彩,它奉獻給你的也是一些色彩。你必須努力,當(dāng)有一天驀然回首時,你的回憶里才會多一些色彩斑斕,少一些蒼白無力。只有你自己才能把歲月描畫成一幅難以忘懷的人生畫卷。學(xué)習(xí)
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