應(yīng)用r進行qsar的嘗試-資料下載頁
2024-10-17 16:47本頁面
【導(dǎo)讀】第一屆中國R語言。應(yīng)用R進行QSAR的嘗試。---以PAHs在根際消解效果的QSAR分析為例。浙江大學(xué)環(huán)境與資源學(xué)院。利用理論計算和統(tǒng)計分析工具來研究系列。借助結(jié)構(gòu)參數(shù)構(gòu)建數(shù)學(xué)模型來描述化合物。結(jié)構(gòu)與活性之間的關(guān)系。由于測定化合物的各種毒性需要花費大量。的人力、物力和財力，人們不可能對眾多?；瘜W(xué)品進行逐一測定。毒性和環(huán)境行為進行預(yù)測，并篩選出具有。潛在危害的化學(xué)品，這在環(huán)境科學(xué)研究中。無疑是一件極具意義的工作。R中的各種包提供幾乎所有QSAR研究需。如果將這些方法集合為一個QSAR專用的。就如無數(shù)的寶藏埋藏在世界各地。采用meta-analysis中常用的效應(yīng)值(effect. 分子結(jié)構(gòu)參數(shù)通過Dragon5計。算得到965個結(jié)構(gòu)參數(shù)，包括拓?fù)鋮?shù)和。相關(guān)系數(shù)矩陣，去掉相關(guān)系數(shù)大于等于。采用R極大提高篩選效率。R中結(jié)構(gòu)參數(shù)的主觀篩選
【正文】 第一屆中國 R語言會議 馬斌： R在 QSAR中的應(yīng)用 17 RMSE和 R2 R2 RMSE 第一屆中國 R語言會議 馬斌： R在 QSAR中的應(yīng)用 18 優(yōu)化預(yù)測模型 第一屆中國 R語言會議 馬斌： R在 QSAR中的應(yīng)用 19 用于預(yù)測和預(yù)報 predict unstudied pound perylene(‘’, header=TRUE, sep=’,’) predict(QSAR, type = response, newdata = perylene) 輸入還沒有研究資料的 perylene的結(jié)構(gòu)參數(shù)，得到效應(yīng)值為 第一屆中國 R語言會議 馬斌： R在 QSAR中的應(yīng)用 20 結(jié)論與展望 ? R在 QSAR分析中的最大特點是快捷和簡便。 ? QSAR的模型構(gòu)建、驗證和應(yīng)用過程中都有多種方法可以選擇，而這些方法目前都分布在不同的包中 ? 收集和整理各種常用的 QSAR用到的方法，編寫 QSAR常用過程的函數(shù)，并開發(fā)出不斷更新的包就尤為重要 ? 本文為 R的 QSAR包作出了一個開端 第一屆中國 R語言會議 馬斌： R在 QSAR中的應(yīng)用 21 致謝 ? 感謝第一屆 R會議的所有貢獻者 ? 本文的完成要感謝中國人民大學(xué)謝益輝的鼓勵和杭州電子科技大學(xué)鄭冰的大力幫助 ? 本文得到國家 863計劃（ 2020AA061101）、國家自然基金（ 40671092, 20707020）和浙江省重點科技項目（ 2020C130243）的資助
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