ssr分子標記精講(編輯修改稿)
2024-11-17 06:50 本頁面
【文章內容簡介】 常敏感等等。,第十頁，共二十四頁。,2. SSR分子標記的步驟,第一步：基因組DNA 提取 第二步：PCR 第三步：擴增產物電泳檢測 第四步：結果分析,微衛(wèi)星分子標記對18份基因型的擴增結果,第十一頁，共二十四頁。,引物 設計,二,三,一,從有關數(shù)據(jù)庫（GenBank, EMBL DDBJ等）或文章中查詢,使用近緣種的引物,構建基因組文庫,篩選SSR位點,3. SSR分子標記引物設計,第十二頁，共二十四頁。,構建基因組文庫,篩選SSR位點,第十三頁，共二十四頁。,539。錨定PCR 分離SSR標記,K可以跟任何核苷酸配對，V不能與A配對，R不能與G配對，其他核苷酸均可與它們配對。這樣，VRVRV五個堿基一起構成了一個封閉堿基群。在PCR過程中，由于VRVRV不能與GA配對，該引物與模板DNA結合的時候，就不會在(GA)n重復區(qū)滑動，只會結合在如圖1所示的位置上，以保證SSR位點的長度多態(tài)性不會丟失。,第十四頁，共二十四頁。,三、實驗用品,儀器設備與耗材：PCR擴增儀、電泳儀和電泳槽、微型移液器、恒溫水浴鍋、凝膠成像系統(tǒng)等，離心管、PCR管、移液器槍頭等 2. 試劑 提取緩沖液：100mmol/L TrisCl，20mmol/L EDTA，500mmol/L NaCl，1.5% SDS。 氯仿：異戊醇：乙醇（80：4：16）。 TE緩沖液：10mmol/L Tris18
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