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正文內(nèi)容

基因工程與基因重組(編輯修改稿)

2025-01-25 17:40 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 體衍生載體可分兩類 : 一類是 插入型載體 ,即外源基因插入到載體上單一的限制酶位點(diǎn),如 λgt系列等。 另一類是 置換型 ,即兩個(gè)限制酶位點(diǎn)之間的 DNA片段可被外源 DNA取代,如 Charon, EMBL系列等。? M13噬菌體載體 M13噬菌體基因組是 單鏈環(huán)狀 DNA,當(dāng)它侵犯宿主菌后,在細(xì)菌胞內(nèi)酶的作用下,單鏈 DNA轉(zhuǎn)變成復(fù)制型雙鏈DNA,可提取出來做基因重組。 經(jīng)改造的 M13噬菌體有 M13 mp系列和 pUC系列。? M13噬菌體載體 —pUC19α互補(bǔ) :?jiǎn)为?dú)存在的 α及 ω片段都沒有半乳糖苷酶的活性,只有宿主細(xì)胞與克隆載體同時(shí)表達(dá)兩個(gè)片段時(shí),宿主細(xì)胞內(nèi)才有 半乳糖苷酶活性,使特異性作用物( Xgal)變?yōu)?藍(lán)色化合物 。突變型 lac 表達(dá) β半乳糖苷酶的 ω 片段 。如果插入的外源基因是在 lacZ’基因內(nèi),就會(huì)影響 lacZ’的表達(dá),利用 lac 胞,在含 Xgal的培養(yǎng)基上生長(zhǎng)時(shí)會(huì)出現(xiàn) 白色菌落 ;若無外源基因插入,則出現(xiàn) 藍(lán)色菌落 。多克隆位點(diǎn)編碼 β半乳糖苷酶的 α片段病毒載體 是一類 真核載體 ,能把基因引入到 真核細(xì)胞中,并在其中被表達(dá)。因此是研究真核細(xì)胞表達(dá)及調(diào)控的有力工具。如 :腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒、乳頭瘤病毒等。二、重組 DNA技術(shù)基本原理? 目的基因 的獲取? 克隆 載體 的選擇和構(gòu)建? 外源基因與載體的 連接? 重組 DNA導(dǎo)入受體菌? 重組體的 篩選? 克隆基因的 表達(dá)(一)目的基因的獲取? 化學(xué)合成法? 基因組 DNA? cDNA? 聚合酶鏈反應(yīng)1. 化學(xué)合成法 已知某種基因的核苷酸序列,或根據(jù)某種基因產(chǎn)物的氨基酸序列推導(dǎo)出編碼該多肽鏈的核苷酸序列,再利用 DNA合成儀 通過化學(xué)合成原理合成目的基因。 利用該法合成的基因有:人生長(zhǎng)激素釋放抑制因子、 胰島素原、 腦啡肽、干擾素基因等2. 基因組 DNA 利用 限制性核酸內(nèi)切酶 將染色體 DNA切割成一定基因水平的許多片段,將這些片段與適當(dāng)?shù)目寺≥d體拼接成重組 DNA分子,繼而 轉(zhuǎn)入受體菌 擴(kuò)增,使每個(gè)細(xì)菌內(nèi)都攜帶 一種 重組 DNA分子的多個(gè)拷貝。 不同細(xì)菌所包含的重組 DNA分子可能為不同的染色體 DNA片段,這樣全部轉(zhuǎn)化細(xì)菌所攜帶的各種染色體片段就代表了染色體的整個(gè)基因組。存在于轉(zhuǎn)化細(xì)菌內(nèi)、由克隆載體所攜帶的所有 基因組 DNA片段的集合 稱為 基因組 DNA文庫 ( genomic DNA library)?;蚪M DNA文庫涵蓋了基因組全部的遺傳信息。 建立基因組文庫后,需結(jié)合適當(dāng) 篩選方法 從眾多轉(zhuǎn)化子菌落中選出含有某一基因的菌落,再進(jìn)行 擴(kuò)增 ,將重組 DNA分離、回收,以獲得目的基因。3. cDNA 把細(xì)胞 總 mRNA通過逆轉(zhuǎn)錄合成 總 cDNA,再與適當(dāng)載體連接后轉(zhuǎn)入受體菌,從而得到含有某種生物體全部cDNA集合(稱為 cDNA 文庫 , cDNA library)。然后用適當(dāng)?shù)姆椒◤?cDNA文庫中 篩選 出目的 cDNA。 cDNA文庫 的特點(diǎn)是它只包括已經(jīng) 被轉(zhuǎn)錄 成 mRNA的那些 基因序列 ,且 不包括內(nèi)含子及調(diào)控序列 ,所以cDNA文庫的復(fù)雜性要比基因組文庫低的多。 但由于不同的細(xì)胞類型、發(fā)育階段以及細(xì)胞所處的特定狀態(tài)是由特定基因的表達(dá)所決定的,因此各自的mRNA種類就不同,由此產(chǎn)生的 cDNA又是獨(dú)特的。與基因組 DNA文庫類似,由 總 mRNA制作的 cDNA文庫包含了細(xì)胞表達(dá)的各種 mRNA信息,自然也含有我們感興趣的編碼 cDNA。4. 聚合酶鏈反應(yīng)( polymerase chain reaction,PCR) 參見 437頁Chain ReactionPolymerase chain reactionPCR的產(chǎn)物數(shù)目的產(chǎn)物數(shù)目以指數(shù)級(jí)方式增長(zhǎng)以指數(shù)級(jí)方式增長(zhǎng)中子的釋放數(shù)目中子的釋放數(shù)目以指數(shù)級(jí)方式增長(zhǎng)以指數(shù)級(jí)方式增長(zhǎng)中子中子原子核原子核 短時(shí)間內(nèi)巨大的短時(shí)間內(nèi)巨大的能量釋放,能量釋放,原子爆炸原子爆炸DNA片段片段Cycle 1Cycle 2Cycle 3Cycle N理論上可達(dá)理論上可達(dá) 2n個(gè)拷貝個(gè)拷貝原料原料 (( pg)) 產(chǎn)物產(chǎn)物 (ug)PCR 的基本原理? 體外 高效、快速、特異 地?cái)U(kuò)增目的基因或 DNA片段的 技術(shù) 。? 其原理類似于 DNA的體內(nèi)復(fù)制,只是在試管中給 DNA的體外合成提供一種合適條件 —— 模板 DNA,寡核苷酸引物,DNA聚合酶,合適的緩沖液系統(tǒng)和 DNA變性、復(fù)性及延伸的溫度與時(shí)間等,使 目的 DNA得以迅速擴(kuò)增 DNA的體內(nèi)復(fù)制:原料: 模板 DNA( 基因組 DNA),隨機(jī)小分子 RNA引物, dNTPs酶: DNA聚合酶,解旋酶,引發(fā)酶反應(yīng)條件: 胞液環(huán)境, 37 ℃ 反應(yīng)過程: 模板 DNA解旋、引發(fā)體的形成、延長(zhǎng) (三階段)產(chǎn)物: 模板 DNA ( 基因組 DNA)拷貝數(shù)增加 一倍 原料: 模板 DNA( 基因組 DNA , cDNA)一對(duì) 特異性 寡核苷酸引物, dNTPs酶: Taq DNA聚合酶反應(yīng)條件: 合適的緩沖液,三種 變化的溫度 ( 94, 5070, 72 ℃ ),一定的 循環(huán)數(shù) ( 2535)l反應(yīng)過程: DNA模板變性(解鏈)、 模板與引物退火 、引物延伸 (三階段,多循環(huán) )l產(chǎn)物: 目的 DNA(特異性)拷貝數(shù)增加 2n倍PCR:DNA模板變性? 與體內(nèi) DNA解鏈過程不同, PCR中作為模板的 雙鏈 DNA是通過95℃ 左右的 高溫 使其發(fā)生變性,形成 單鏈 DNA 模板與引物退火? PCR通常需要兩條 寡核苷酸鏈 作為 DNA合成時(shí)的 引物 (primer) ,這兩個(gè)引物分別與待擴(kuò)增模板 DNA的 目標(biāo)片段 兩端的序列互補(bǔ)。在降低溫度的過程中,通過控制 退火條件,引物就能準(zhǔn)確地與擴(kuò)增區(qū)域的兩端配對(duì)。primers? ⑴ 引物 短 ,不易纏繞;? ⑵ 設(shè)計(jì)的引物是與模板 DNA兩端序列互補(bǔ);? ⑶ 引物的量 遠(yuǎn)大于 模板分子的量,引物與模板 DNA形成雙鏈的幾率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于 DNA分子自身的復(fù)性。 引物延伸? 在 PCR反應(yīng)體系中的 DNA聚合酶 ,能夠催化反應(yīng)體系中游離的單核苷酸( dNTPs)由引物 539。→339。 方向,按堿基配對(duì)的原則延伸,形成兩條與模板 DNA互補(bǔ)的復(fù)制鏈。Taq 酶 dNTPSl 新合成
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