蛋白質(zhì)組學(xué)及其研究進(jìn)展(編輯修改稿)
2025-08-28 13:58 本頁(yè)面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 細(xì)胞里高表達(dá)的另一種蛋白質(zhì) .這個(gè)發(fā)現(xiàn)可能會(huì)提供疾病診治的新的手段 .在一項(xiàng)利用蛋白質(zhì)組研究技術(shù)進(jìn)行的酒精對(duì)人體毒性的研究中發(fā)現(xiàn) ,乙醇會(huì)改變血清蛋白糖基化作用 ,導(dǎo)致許多糖蛋白的糖基缺乏 ,如轉(zhuǎn)鐵蛋白。 腫瘤至今仍是人類的一個(gè)頑敵 .癌細(xì)胞不僅有許多特異蛋白質(zhì)產(chǎn)物 ,而且這些產(chǎn)物還會(huì)影響其他蛋白質(zhì)的翻譯后加工及許多蛋白質(zhì)的表達(dá)水平 .腫瘤的蛋白質(zhì)組研究能提供一些以往其他技術(shù)所不能提供的早期診斷依據(jù) ,例如利用不同細(xì)胞組織的特征蛋白質(zhì)譜 ,可以判別一些難以判定來源的腫瘤細(xì)胞的來源 .丹麥的一個(gè)小組利用蛋白質(zhì)組研究技術(shù)結(jié)合組織冰凍切片技術(shù)分析了 150例膀胱癌病人的組織 ,發(fā)現(xiàn)在所有的鱗狀細(xì)胞瘤的尿液中均能發(fā)現(xiàn)一種化學(xué)引誘劑 ——— 銀屑素 (ｐｓｏｒｉａｓｉｎ ),推測(cè)其極可能作為這種腫瘤的早期標(biāo)志物 . 基因組計(jì)劃無疑為醫(yī)療、醫(yī)藥領(lǐng)域帶來一場(chǎng)革命 ,但也應(yīng)該看到 ,單純的遺傳分析很難診斷多因素的疾病 .復(fù)雜的基因間相互作用 ,細(xì)胞內(nèi)活動(dòng)和環(huán)境的影響都會(huì)影響基因的表達(dá)及蛋白質(zhì)的翻譯后加工 .因此 ,可靠的診斷和治療應(yīng)基于機(jī)體漸進(jìn)發(fā)展過程的調(diào)控及失調(diào) ,并且必須考慮到環(huán)境因素的影響 .蛋白質(zhì)組的研究正是探索這一領(lǐng)域的有力武器 .人們不難預(yù)期 ,基因組計(jì)劃的不斷推進(jìn)會(huì)給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫(kù) 。生物信息學(xué)的發(fā)展會(huì)給蛋白質(zhì)組計(jì)劃提供更方便有效的計(jì)算機(jī)分析軟件 。國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)會(huì)使各國(guó)各領(lǐng)域科學(xué)家有關(guān)蛋白質(zhì)組研究的成果出現(xiàn)新的集成 。新的技術(shù)會(huì)不斷涌現(xiàn) ,蛋白質(zhì)組研究方法會(huì)象ＰＣＲ技術(shù)一樣易于操作 ,并滲透到人類活動(dòng)的方方面面 ,對(duì)工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)療衛(wèi)生各行各業(yè)帶來新的革命 功能蛋白質(zhì)組學(xué) 功能蛋白質(zhì)組學(xué)的提出及概念 功能蛋白質(zhì)組學(xué)是指從動(dòng)態(tài)和整體的角度研究蛋白質(zhì)的功能及其結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)，是位于對(duì)個(gè)別蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)研究和以全部蛋白質(zhì)為研究對(duì)象的蛋白質(zhì)組研究之間的層次。 功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究?jī)?nèi)容 蛋白質(zhì)群體研究 數(shù)據(jù)庫(kù) 說明 WWW地址 蛋白質(zhì)序列庫(kù) : SWISSPROT 內(nèi)容豐富 ,提示詳盡 PIR較 TrEMBL (EMBL的翻譯 ) /OWL (非冗余庫(kù) ) 核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù) : EMBL 歐州分子生物學(xué) db/ebi/ GenBank美國(guó)生物工程信息中心 ldbESTCDNA序列標(biāo)記 模體與域 : PROSITE 序列模體 BLOCKS 保守序列 ProDom蛋白質(zhì)域 SBASE蛋白質(zhì)域 二維電泳 (2DPAGE): WORLD2DPAGE國(guó)際 2DPAGE庫(kù)的完整索引 lLinksto2DPAGEPhoretix公司的連絡(luò)表 2DWG二維電泳圖譜元庫(kù) Flicker成對(duì)電泳圖譜比較 三維結(jié)構(gòu)庫(kù) : PDB蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)坐標(biāo)庫(kù) SWISSMODEL從序列模建結(jié)構(gòu) SWISS3DIMAGE三維結(jié)構(gòu)圖示 DSSP二級(jí)結(jié)構(gòu)命名 FSSP蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)家族 翻譯后修飾 : OGLYCBASE糖基化 PHOSPHOBASE磷酸化 deltamass翻譯后修飾匯編 基因組庫(kù) : dblist基因組庫(kù)目列 GDB基因組庫(kù) OMIM遺傳病表型 GeneCards生物醫(yī)學(xué)知識(shí) 代謝庫(kù) : Boehringer圖代謝路徑圖 ENZYME酶及其反應(yīng)的命名 Ecolyc大腸桿菌中間代謝 HinCys嗜血流感中間代謝 WIT酶和代謝途徑 相互作用 : GIFDB果蠅發(fā)育中的基因相互作用 KEGG基因相互作用 Deletion酵母功能基因組 deletionproject/ 表 3 用于蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫(kù)搜索軟件 屬性參數(shù) /軟件名稱 WWW地址蛋白質(zhì)質(zhì)量 +蛋白質(zhì)序列標(biāo)記 蛋白質(zhì)的肽質(zhì)印記 : MS 表 3 用于蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫(kù)搜索軟件 屬性參數(shù) /軟件名稱 WWW地址
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