蛋白質(zhì)組學及其研究進展(編輯修改稿)
2025-08-28 13:58 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 細胞里高表達的另一種蛋白質(zhì) .這個發(fā)現(xiàn)可能會提供疾病診治的新的手段 .在一項利用蛋白質(zhì)組研究技術進行的酒精對人體毒性的研究中發(fā)現(xiàn) ,乙醇會改變血清蛋白糖基化作用 ,導致許多糖蛋白的糖基缺乏 ,如轉鐵蛋白。 腫瘤至今仍是人類的一個頑敵 .癌細胞不僅有許多特異蛋白質(zhì)產(chǎn)物 ,而且這些產(chǎn)物還會影響其他蛋白質(zhì)的翻譯后加工及許多蛋白質(zhì)的表達水平 .腫瘤的蛋白質(zhì)組研究能提供一些以往其他技術所不能提供的早期診斷依據(jù) ,例如利用不同細胞組織的特征蛋白質(zhì)譜 ,可以判別一些難以判定來源的腫瘤細胞的來源 .丹麥的一個小組利用蛋白質(zhì)組研究技術結合組織冰凍切片技術分析了 150例膀胱癌病人的組織 ,發(fā)現(xiàn)在所有的鱗狀細胞瘤的尿液中均能發(fā)現(xiàn)一種化學引誘劑 ——— 銀屑素 (ｐｓｏｒｉａｓｉｎ ),推測其極可能作為這種腫瘤的早期標志物 . 基因組計劃無疑為醫(yī)療、醫(yī)藥領域帶來一場革命 ,但也應該看到 ,單純的遺傳分析很難診斷多因素的疾病 .復雜的基因間相互作用 ,細胞內(nèi)活動和環(huán)境的影響都會影響基因的表達及蛋白質(zhì)的翻譯后加工 .因此 ,可靠的診斷和治療應基于機體漸進發(fā)展過程的調(diào)控及失調(diào) ,并且必須考慮到環(huán)境因素的影響 .蛋白質(zhì)組的研究正是探索這一領域的有力武器 .人們不難預期 ,基因組計劃的不斷推進會給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫 。生物信息學的發(fā)展會給蛋白質(zhì)組計劃提供更方便有效的計算機分析軟件 。國際互聯(lián)網(wǎng)會使各國各領域科學家有關蛋白質(zhì)組研究的成果出現(xiàn)新的集成 。新的技術會不斷涌現(xiàn) ,蛋白質(zhì)組研究方法會象ＰＣＲ技術一樣易于操作 ,并滲透到人類活動的方方面面 ,對工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)療衛(wèi)生各行各業(yè)帶來新的革命 功能蛋白質(zhì)組學 功能蛋白質(zhì)組學的提出及概念 功能蛋白質(zhì)組學是指從動態(tài)和整體的角度研究蛋白質(zhì)的功能及其結構基礎，是位于對個別蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)研究和以全部蛋白質(zhì)為研究對象的蛋白質(zhì)組研究之間的層次。 功能蛋白質(zhì)組學的研究內(nèi)容 蛋白質(zhì)群體研究 數(shù)據(jù)庫 說明 WWW地址 蛋白質(zhì)序列庫 : SWISSPROT 內(nèi)容豐富 ,提示詳盡 PIR較 TrEMBL (EMBL的翻譯 ) /OWL (非冗余庫 ) 核苷酸數(shù)據(jù)庫 : EMBL 歐州分子生物學 db/ebi/ GenBank美國生物工程信息中心 ldbESTCDNA序列標記 模體與域 : PROSITE 序列模體 BLOCKS 保守序列 ProDom蛋白質(zhì)域 SBASE蛋白質(zhì)域 二維電泳 (2DPAGE): WORLD2DPAGE國際 2DPAGE庫的完整索引 lLinksto2DPAGEPhoretix公司的連絡表 2DWG二維電泳圖譜元庫 Flicker成對電泳圖譜比較 三維結構庫 : PDB蛋白質(zhì)三維結構坐標庫 SWISSMODEL從序列模建結構 SWISS3DIMAGE三維結構圖示 DSSP二級結構命名 FSSP蛋白質(zhì)結構家族 翻譯后修飾 : OGLYCBASE糖基化 PHOSPHOBASE磷酸化 deltamass翻譯后修飾匯編 基因組庫 : dblist基因組庫目列 GDB基因組庫 OMIM遺傳病表型 GeneCards生物醫(yī)學知識 代謝庫 : Boehringer圖代謝路徑圖 ENZYME酶及其反應的命名 Ecolyc大腸桿菌中間代謝 HinCys嗜血流感中間代謝 WIT酶和代謝途徑 相互作用 : GIFDB果蠅發(fā)育中的基因相互作用 KEGG基因相互作用 Deletion酵母功能基因組 deletionproject/ 表 3 用于蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫搜索軟件 屬性參數(shù) /軟件名稱 WWW地址蛋白質(zhì)質(zhì)量 +蛋白質(zhì)序列標記 蛋白質(zhì)的肽質(zhì)印記 : MS 表 3 用于蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫搜索軟件 屬性參數(shù) /軟件名稱 WWW地址
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