【正文】 中降解。 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中新生肽鏈的命運? 正確折疊進入高爾基體。? 有些肽鏈折疊雖有輕微錯誤，或者單條肽鏈是正確折疊，進行不完全組裝形成非天然復合物，也能進入高爾基體，但最終被轉(zhuǎn)運到溶酶體和液泡中降解。– 外肽酶：3．4．11至3．4．19都是不同類型的外肽酶。– 內(nèi)肽酶：3．4．21至3．4．24分別是絲氨酸內(nèi)肽酶、半胱氨酸內(nèi)肽酶、天冬氨酸內(nèi)肽酶和金屬內(nèi)肽酶，以及3．4．99未知類型的內(nèi)肽酶。? 第二層次：以結(jié)構(gòu)為基礎分類，而結(jié)構(gòu)同源性與活性中心有關，分為三大類；每類分為若干個宗族（clan），每個宗族又有許多家族。– 第二大類：以D為活性中心的肽酶，催化機制與水的親核作用有關。? 第三層次：個別的肽酶。? 根據(jù)經(jīng)典的分類方法，組織蛋白酶可分為兩類：– 巰基蛋白酶家族：包括組織蛋白酶B、H、L和S等；– 酸性蛋白酶類：包括組織蛋白酶D和E等。巰基型組織蛋白酶家族? 溶酶體的巰基型組織蛋白酶屬于木瓜蛋白酶家族，氨基酸殘基序列高度同源。? 分布：組織蛋白酶B、H和L廣泛地存在于各種組織中，組織蛋白酶S僅存在于與Ⅱ類MHC有關的抗原提呈細胞。組織蛋白酶B、H和L可以是單一肽鏈的蛋白質(zhì)，也可以是2條肽鏈形式的蛋白質(zhì)，因不同物種而異。組織蛋白酶前體的激活? 糖基化前體經(jīng)限制性蛋白酶酶解或自身催化作用，轉(zhuǎn)化成為有活性的蛋白酶；2個結(jié)構(gòu)域中間溝漕中的C（木瓜蛋白酶中的第25位）和H（木瓜蛋白酶中的第159位）形成催化活性中心。組織蛋白酶B和L前體的信號肽是成熟酶的強烈抑制劑，其中L的信號肽由41個氨基酸殘基組成，在酶原肽鏈的正確折疊中起到重要作用，即自身分子伴侶。酸性組織蛋白酶? 組織蛋白酶D和E屬于胃蛋白酶家族。? 組織蛋白酶E的分布比較窄，僅存在于淋巴樣組織、胃腸道、血液細胞，通常不出現(xiàn)在溶酶體中。? 組織蛋白酶D前體在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的分子量約53kD，進入高爾基體為44kD，在溶酶體中經(jīng)激活成為由2條肽鏈（31kD和15kD）組成的糖蛋白；其糖鏈上的甘露糖6磷酸為分揀信號，其原肽在前體的正確折疊和分揀過程中都發(fā)揮作用。 蛋白酶體? 蛋白酶體是細胞質(zhì)的一種蛋白質(zhì)復合體，但是在細胞核中也有，還可以與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合的形式存在。? 不同生物的蛋白酶體不完全相同。? 根據(jù)分布的情況，需鈣蛋白酶可分為遍在型與組織特異型。 μ被微摩爾級鈣離子激活， m的激活則需要毫摩爾級鈣離子濃度。遍在型需鈣蛋白酶的結(jié)構(gòu)特點? 遍在型需鈣蛋白酶由調(diào)節(jié)亞基和催化亞基組成。? 催化亞基（分子量80kD）：含有另一個鈣結(jié)合區(qū)和催化蛋白水解的活性部位，由Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ結(jié)構(gòu)域組成，其中Ⅱ是巰基蛋白酶典型的催化結(jié)構(gòu)域，Ⅰ和Ⅲ的功能尚不清楚。 需鈣蛋白酶的活性調(diào)節(jié)? 需鈣蛋白酶的激活因素：鈣離子濃度、磷脂及調(diào)節(jié)亞基，激活機制不明。? 調(diào)節(jié)亞基的作用：提高催化亞基對鈣離子的靈敏度，幫助變性的催化亞基復性，僅對自身催化亞基有專一作用，是需鈣蛋白酶專一的分子伴侶。? 在胃組織中存在專一的需鈣蛋白酶nCL2和nCL2′。 骨骼肌的需鈣蛋白酶p94? p94只有一條肽鏈，即催化亞基，比遍在型需鈣蛋白酶的催化亞基肽鏈多了3個插入序列。需鈣蛋白酶p94的特性? p94非常容易自溶，很快消失，盡管p94的mRNA含量比遍在型需鈣蛋白酶的mRNA至少高10倍，但是仍不容易檢測到。 胃組織的需鈣蛋白酶? nCL2的結(jié)構(gòu)與遍在型需鈣蛋白酶類似；而nCL2′則是截短的nCL2，只有結(jié)構(gòu)域Ⅰ和Ⅱ，以及結(jié)構(gòu)域Ⅲ的N端部分的一個EF手形，兩者可能是mRNA可變剪接的結(jié)果。三邊帽蛋白酶? 三邊帽蛋白酶的作用與蛋白酶體相輔相成，其的底物是蛋白酶體降解產(chǎn)生的寡肽。三邊帽蛋白酶的亞基結(jié)構(gòu)? 由1070個氨基酸殘基組成，整個亞基可以分為5個結(jié)構(gòu)域；? 藍色與黃色為β螺旋槳樣結(jié)構(gòu)β6和β7；紫色的C1結(jié)構(gòu)域是螺旋捆；紅色的C2結(jié)構(gòu)域是αβ的夾心結(jié)構(gòu)；深綠色的是PDZ結(jié)構(gòu)域。? 酶的活性部位：在六聚體的中心，螺旋槳結(jié)構(gòu)域β7是底物的入口，β6則是降解產(chǎn)物的出口。 三邊帽蛋白酶與外肽酶的協(xié)作? 三邊帽蛋白酶體系與外肽酶（ FF2和F3）協(xié)作，將三邊帽蛋白酶的降解產(chǎn)物——二至四肽徹底降解為游離氨基酸，被細胞再利用。? F2和F3則是金屬肽酶，約89kD，主要是針對帶電荷的氨基酸殘基。? 胱天蛋白酶：半胱氨酸依賴性天冬氨酸專一蛋白酶（cysteinedependent aspartatespecfic protease，caspase）的簡稱。 胱天蛋白酶的研究? 在研究線蟲死亡的過程中，發(fā)現(xiàn)2個基因ced 3和ced4是線蟲細胞凋亡所必需。? 特性：具有蛋白酶活性，將其轉(zhuǎn)染進入多種細胞株中都能引起細胞凋亡?；|(zhì)金屬蛋白酶? MMP家族有許多成員：起初研究的是可溶性的形式，近年來發(fā)現(xiàn)了一些膜結(jié)合形式。一些膜類型的MMP又專門縮寫為MTMMP。? 基質(zhì)金屬蛋白酶及其抑制劑（包括內(nèi)源性抑制劑）的研究是蛋白酶領域中的一個生長點。– 前肽– 含有鋅結(jié)合部位的催化結(jié)構(gòu)域– 含有一個半胱氨酸的轉(zhuǎn)換區(qū)的原肽結(jié)構(gòu)域? MMP家族其他成員含有更多的結(jié)構(gòu)域，絕大多數(shù)都有血紅素結(jié)合蛋白/透明黏連蛋白結(jié)構(gòu)域，某些成員還含有弗林蛋白酶作用的位點、纖連蛋白的Ⅱ型重復片段和鉸鏈區(qū)，以及穿膜肽段。? 細胞外基質(zhì)降解后，會產(chǎn)生一系列生物效應：影響細胞遷移、導致細胞增殖和形態(tài)發(fā)生、調(diào)節(jié)生長因子等分子的活性、改變基質(zhì)中蛋白酶活性的平衡。? 外源蛋白酶抑制劑：由一個物種產(chǎn)生的，但是作用的對象是另一物種中的蛋白酶。 內(nèi)源蛋白酶抑制劑? 胰臟的蛋白酶抑制劑：有Kunitz抑制劑（常用的縮寫是PTI）和Kazal抑制劑。外源蛋白酶抑制劑? 許多植物中存在著蛋白酶抑制劑，尤其是在作為植物儲存用的種子和塊莖中。? 植物蛋白酶抑制劑具有多價性：2個不同的抑制位點分別抑制不同的蛋白酶。 水蛭的特殊生物活性物質(zhì)? 水蛭素：對凝血酶專一的蛋白酶抑制劑，由66個氨基酸殘基組成，C端有一個被硫酸化的酪氨酸。? 水蛭抑制劑（eglin）：作用于彈性蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和枯草桿菌蛋白酶。人工合成的蛋白酶抑制劑? 以蛋白酶抑制劑為基礎的藥物設計和開發(fā)應運而生，成為藥物研究中的一個重要方面。目前被關注的靶酶有凝血酶、纖溶酶原激活劑、彈性蛋白酶、補體系統(tǒng)、激肽釋放酶、血管緊張肽轉(zhuǎn)換酶等。第三節(jié) 蛋白酶體泛素系統(tǒng)及其功能細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的降解? 蛋白質(zhì)降解的基本策略—區(qū)域化(Compartmentalization)? 泛素蛋白水解酶復合體通路（Ubiquitinproteasomes pathway）蛋白質(zhì)降解的基本策略? 區(qū)域化(Compartmentalization)：控制蛋白質(zhì)降解的基本策略，即蛋白質(zhì)的水解限制在細胞的某些區(qū)域，帶有降解信號的蛋白質(zhì)才能進入這些區(qū)域。? 蛋白酶體是自身區(qū)域化分子裝置的調(diào)節(jié)形式之一。? 由以色列學者阿龍赫什科和美國學者歐文二、蛋白質(zhì)泛素化系統(tǒng)泛素或泛蛋白? 泛素或泛蛋白（Ubiquitin，Ub）：由76個氨基酸殘基組成的低分子量蛋白，廣泛存在于各種真核細胞和組織中。在人、鮭魚和果蠅等親緣關系遙遠的物種中得到的泛蛋白竟然完全一致。泛素的連接方式? C末端Gly的羧基與目標蛋白質(zhì)連接，也能與另一個泛蛋白48位Lys（K）側(cè)鏈的ε氨基連接，形成多聚的泛