【正文】 F1是氨肽酶，由293個氨基酸殘基組成（），具有脯氨酰亞氨基肽酶活性，屬于α/β類型的水解酶超家族，從N端切除脯氨酸和疏水氨基酸殘基，但是不能切除甘氨酸和酪氨酸。? 2種氨基酸具有完全不同的意義：半胱氨酸是指酶的活性中心殘基，天冬氨酸則是酶作用的靶位，即底物中被特異斷裂的氨基酸殘基。? 作用：專一地斷裂維持細胞穩(wěn)態(tài)所必需的蛋白質肽鏈中的特定肽鍵，導致細胞死亡。? 基質金屬蛋白酶（MMP）功能：調節(jié)許多發(fā)育和生理過程，與細胞遷移、增殖等過程密切有關，在腫瘤發(fā)生和轉移以及其他疾病的發(fā)生中起到重要作用。MMP的功能? MMP主要作用：降解細胞外基質中的各種組分，大致分為降解膠原和明膠（變性的膠原）以及非膠原兩大類。? 人工合成的蛋白酶抑制劑：以蛋白酶抑制劑為基礎設計和開發(fā)的藥物。? 馬鈴薯的胰凝乳蛋白酶抑制劑：在遇到外界病害昆蟲的侵襲時，可被誘導表達，作為植物抗病機制的一個組成部分。? 水蛭抑制素（bdellin）：抑制胰蛋白酶、纖溶酶和頂體蛋白酶。涉及的疾病有：急性胰腺炎、感染和炎癥、高血壓、抗凝等。? 真核生物形成由生物膜界定的區(qū)域化，如溶酶體；原核生物由蛋白水解酶亞基裝配成一個桶形復合物，需降解的蛋白質進入桶內水解，即自身區(qū)域化的蛋白水解酶。切哈諾沃、阿夫拉姆? 泛素氨基酸序列保守性高，在已知的各種物種的泛蛋白中，至多發(fā)現(xiàn)3個氨基酸殘基的改變。? 泛蛋白與其他蛋白質之間形成的是異肽鍵（isopeptide bond），泛蛋白C末端Gly的羧基不與目標蛋白質中的α氨基形成肽鍵，而是與目標蛋白質Lys（K）側鏈的ε氨基形成肽鍵。? ISG15蛋白是第一個被發(fā)現(xiàn)的UBL蛋白。? 作用：直接影響蛋白質的活性和細胞定位。哺乳動物細胞至少有25種E2基因；? 大多數(shù)E2有一個14～16kD的核心，不同E2的核心有35%的同源性，E2核心參與E2與E3的結合。泛素蛋白連接酶E3的種類? 根據(jù)E3含有的特定結構域，分為三類：– HECT（ Homologous to E6AP carboxyl terminus） E3– 環(huán)指(ring finger)結構蛋白 – U盒型HECT E3? 源于對致瘤病毒HPV的研究，HPV編碼的蛋白E6與細胞內結合蛋白(E6AP)結合，并與腫瘤抑制蛋白p53結合，導致p53的泛素化和降解。? APC在細胞有絲分裂末期激活，降解有絲分裂和紡錘體相關蛋白，使細胞進入分裂后期。VHLCBC類E3 VHLCBC類E3：由連接蛋白Elongin B和C、環(huán)指蛋白RbxCullin類蛋白CulⅡ和底物識別蛋白VHL組成。– 類胰蛋白酶(Trypticlike)活性：水解堿性氨基酸羧基端肽鍵。? 蛋白酶體提供了一種全新的蛋白酶，即蘇氨酸蛋白酶。? 體外抗原加工反應的分析發(fā)現(xiàn)，免疫蛋白酶體是內源性抗原加工的蛋白酶。第四節(jié) 蛋白質降解的生物學意義? 一、細胞內蛋白質的質量控制? 二、蛋白質降解與蛋白抗原提呈? 三、蛋白質降解與細胞信號傳導? 四、蛋白質降解與細胞周期? 五、蛋白質降解與疾病一、細胞內蛋白質的質量控制? 錯誤折疊的新生肽鏈的降解清除? 非天然結構蛋白質的清除? tmRNA及其作用熄火核糖體與tmRNA? 核糖體合成新生肽鏈的過程中，當mRNA缺失終止密碼子時，肽鏈的合成無法終止，形成熄火（stalled）核糖體，即攜帶肽鏈的tRNA滯留在核糖體的P位，肽鏈合成不能繼續(xù)，新生肽鏈的合成就此“堵塞”。蛋白質和肽類的抗原性僅與其分子中的某些肽段有關，并經(jīng)常位于蛋白質分子表面，與淋巴系統(tǒng)抗原提呈細胞的表面免疫球蛋白樣受體結合，還需經(jīng)過蛋白酶的降解作用，將蛋白質抗原降解為大小合適的肽段，進而誘發(fā)抗體的產(chǎn)生。? 核因子κB的激活與核因子κB抑制劑的降解? 蛋白質Wnt引發(fā)的信號傳導? 刻缺蛋白的限制性降解引發(fā)信號傳導NFκB信號途徑? 核因子κB（NFκB）：是細胞內信號傳導通路中的重要成員之一，NFκB途徑與前炎癥反應密切相關。? 蛋白質Wnt能與細胞表面的卷曲家族成員和低密度脂蛋白受體相關蛋白質（LRP）等二種受體結合，引發(fā)一系列信號轉導，使Wnt應答基因表達。? 細胞周期受周期蛋白（cyclin）控制，不同的時相出現(xiàn)不同的周期蛋白。周期蛋白B調節(jié)細胞M期? 周期蛋白B在前期合成，在M期與Cdk1結合，誘導細胞有絲分裂；? 同時激活后期促進復合物APC/C，使周期蛋白被蛋白酶體泛素系統(tǒng)識別和降解；? 進入只有游離Cdk1的后期和間期。DNA合成的準備與啟動? G1/S期的主要特征是DNA合成。? 與癌癥相關的三類基因：– 致癌基因：“加強”細胞的生長與分裂，“推動”細胞周期前進，促進或加劇基因突變的結果。? P53蛋白分為3個不連續(xù)的結構域：? 殘基1～99組成N端：包含兩個相鄰的轉錄激活區(qū)（1～42和43～63）和一個富含Pro/Ala區(qū)（72～91）；? 殘基100～300組成核心區(qū)域：結合特異性的DNA序列，? C端殘基301～393：包含四聚體化域（325～356）和調節(jié)區(qū)域（363～393）。? 參與腫瘤細胞侵襲和轉移的蛋白酶有3類：絲氨酸蛋白酶、半胱氨酸蛋白酶和金屬蛋白酶。13。? 老年癡呆癥（Alzheimer180。五、蛋白質降解與疾病? 腫瘤進展與蛋白質降解? 淀粉樣變性病與蛋白質降解腫瘤進展與蛋白質降解? 細胞外基質的降解是腫瘤細胞的侵襲與轉移的條件之一，腫瘤細胞能使多種蛋白酶的表達上調。– 修復基因：通過保護特定序列來維持DNA的完整性，如果突變發(fā)生在編碼修復酶的基因中，DNA就無法修復。? SCdk引發(fā)進入S期，Cdc6被磷酸化和降解，preRC解體，DNA合成啟動，同時也能避免在同一個起始點再次發(fā)生DNA復制。? 水解染色體黏結蛋白復合物的分離酶（sparase）與斧形蛋白（securin）結合，活化的后期促進復合物使斧形蛋白泛素化并降解，分離酶激活，染色體黏結蛋白復合物降解，染色體分離。– S期出現(xiàn)周期蛋白A，激活依賴S周期蛋白的激酶SCdk，即Cdk2。四、蛋白質降解與細胞周期? 蛋白質參與細胞的各種運作，一些蛋白質的降解與細胞周期、細胞凋亡密切相關。? 核因子κB抑制劑（IκB）的磷酸化和降解誘導NFκB 的活化。與Ⅱ類MHC分子有關的抗原提呈? 病原體蛋白質被抗原提呈細胞內吞，在晚期內體中降解成肽段，并與抗原提呈細胞中的Ⅱ類MHC分子結合，完成抗原提呈。? tmRNA能使熄火的核糖體重新工作。? 參與異常蛋白的再生或分解反應，其中11S調節(jié)子能顯著提高20S蛋白酶體的肽酶活性。? 蛋白水解功能分別由ββ2和β5上的3個催化亞基Y、Z和X承擔，即Y/βZ/β2 和X/β5上Thr的OH對底物進行親核攻擊。? DNA修復作用：核苷酸切除與修復活性。– 類胰凝乳蛋白酶(Chymotrypticlike)活性：水解疏水性氨基酸羧基端肽鍵。? 發(fā)現(xiàn)100多種Fbox，都具有WD40重復序列或富亮氨酸重復序列。環(huán)指（ring finger）結構蛋白? 環(huán)指結構：由8個保守半胱氨酸和組氨酸[CysX2CysX(939)CysX(13)HisX(23)CysX2CysX(448)CysX2Cys)]組成