【正文】 淀粉樣變性病與蛋白質(zhì)降解? 淀粉樣變性病是蛋白質(zhì)或其片段聚集形成纖維，導(dǎo)致千克級(jí)別的蛋白質(zhì)沉積而引發(fā)疾病，在重要器官中發(fā)生的蛋白質(zhì)沉積的危害性更大。– 抑癌基因：“減緩”細(xì)胞的生長(zhǎng)與分裂，抑癌基因的突變導(dǎo)致細(xì)胞失去控制生長(zhǎng)的能力。染色體的分離? M期有絲分裂紡錘體中染色體的分離涉及染色體黏結(jié)蛋白復(fù)合物（cohesin plex）的降解，后期促進(jìn)復(fù)合物也發(fā)揮作用?？倘钡鞍椎南拗菩越到庖l(fā)信號(hào)傳導(dǎo)在神經(jīng)發(fā)育過程中，刻缺蛋白不同部位的二次限制性蛋白酶解，激活轉(zhuǎn)錄因子，產(chǎn)生側(cè)向抑制。? 與Ⅰ類MHC分子有關(guān)的抗原提呈? 與Ⅱ類MHC分子有關(guān)的抗原提呈與Ⅰ類MHC分子有關(guān)的抗原提呈? 免疫應(yīng)答時(shí)，與Ⅰ類MHC分子有關(guān)的抗原提呈過程中，抗原由蛋白酶體泛素系統(tǒng)識(shí)別并加工。橄欖球蛋白酶體? 橄欖球蛋白酶體(Football proteasome)：由11S調(diào)節(jié)子(11S regulator)結(jié)合于催化顆粒CP兩端形成。– BrAAP活性：水解分枝側(cè)鏈氨基酸羧基端肽鍵。SCF（skpcullinFbox protein）類E3 ? SCF類E3：由連接蛋白Skp、Cullin類蛋白CulⅠ和底物識(shí)別蛋白Fbox組成。泛素蛋白連接酶E3? 種類繁多：有幾百種，E3除了對(duì)不同的E2有選擇作用外，對(duì)底物蛋白質(zhì)也有特異性；由多種亞基組成。ISG15蛋白? ISG15蛋白：Ⅰ型干擾素誘導(dǎo)產(chǎn)生、分子量15kD的蛋白質(zhì)，序列與泛素蛋白有高度的相似性，可以通過共價(jià)結(jié)合的方式修飾其它蛋白。在人、鮭魚和果蠅等親緣關(guān)系遙遠(yuǎn)的物種中得到的泛蛋白竟然完全一致。? 蛋白酶體是自身區(qū)域化分子裝置的調(diào)節(jié)形式之一。? 水蛭抑制劑（eglin）：作用于彈性蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和枯草桿菌蛋白酶。 內(nèi)源蛋白酶抑制劑? 胰臟的蛋白酶抑制劑：有Kunitz抑制劑（常用的縮寫是PTI）和Kazal抑制劑。? 基質(zhì)金屬蛋白酶及其抑制劑（包括內(nèi)源性抑制劑）的研究是蛋白酶領(lǐng)域中的一個(gè)生長(zhǎng)點(diǎn)。 胱天蛋白酶的研究? 在研究線蟲死亡的過程中，發(fā)現(xiàn)2個(gè)基因ced 3和ced4是線蟲細(xì)胞凋亡所必需。? 酶的活性部位：在六聚體的中心，螺旋槳結(jié)構(gòu)域β7是底物的入口，β6則是降解產(chǎn)物的出口。需鈣蛋白酶p94的特性? p94非常容易自溶，很快消失，盡管p94的mRNA含量比遍在型需鈣蛋白酶的mRNA至少高10倍，但是仍不容易檢測(cè)到。 需鈣蛋白酶的活性調(diào)節(jié)? 需鈣蛋白酶的激活因素：鈣離子濃度、磷脂及調(diào)節(jié)亞基，激活機(jī)制不明。? 根據(jù)分布的情況，需鈣蛋白酶可分為遍在型與組織特異型。? 組織蛋白酶E的分布比較窄，僅存在于淋巴樣組織、胃腸道、血液細(xì)胞，通常不出現(xiàn)在溶酶體中。組織蛋白酶B、H和L可以是單一肽鏈的蛋白質(zhì)，也可以是2條肽鏈形式的蛋白質(zhì)，因不同物種而異。? 第三層次：個(gè)別的肽酶。– 外肽酶：3．4．11至3．4．19都是不同類型的外肽酶。 無(wú)蛋白酶細(xì)胞器中蛋白質(zhì)的降解? 一些細(xì)胞器不存在蛋白酶，如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。? 需鈣蛋白酶抑制蛋白（calpistatin）：細(xì)胞質(zhì)中存在需鈣蛋白酶的蛋白質(zhì)類型抑制劑，可以同時(shí)結(jié)合和抑制細(xì)胞質(zhì)中的4種需鈣蛋白酶。? Pompe疾?。悍纸飧翁窃摩疗咸烟擒彰溉狈Σ?。– 胰島素缺乏和必需氨基酸不足時(shí)，自噬小體的生成速度明顯加快。? 紅細(xì)胞表面存在多種糖蛋白，這些糖蛋白的唾液酸被除去后，被肝臟實(shí)質(zhì)細(xì)胞清除，同時(shí)也將紅細(xì)胞從循環(huán)的血液中清除。? 這些蛋白質(zhì)不進(jìn)行代謝，它們的變化具有累積效應(yīng)，超過一定限度就產(chǎn)生疾病。? N端的氨基酸殘基為A、G、M和V的蛋白質(zhì)，它們?cè)谠思?xì)胞中的半衰期可超過10h，而在真核細(xì)胞中甚至可超過20h。? 哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)各種蛋白質(zhì)的平均周轉(zhuǎn)率為1 ～ 2d。 ? 清除因突變、熱或氧化脅迫造成的錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)，防止形成細(xì)胞內(nèi)凝集。? 蛋白質(zhì)在行使功能時(shí)，很多調(diào)節(jié)控制都與肽鍵的斷裂有關(guān)，如前肽的切除、無(wú)活性的前體蛋白質(zhì)的激活等。? 蛋白質(zhì)的半衰期并不恒定，與細(xì)胞的生理狀態(tài)密切相關(guān)。? 在22個(gè)快速降解的蛋白質(zhì)中有20個(gè)是含有PEST序列。肝臟實(shí)質(zhì)細(xì)胞表面存在識(shí)別并專一結(jié)合半乳糖的去唾液酸糖蛋白受體。 溶酶體是蛋白質(zhì)降解的重要場(chǎng)所? 細(xì)胞外的蛋白質(zhì)（如血漿蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)類激素以及細(xì)胞質(zhì)膜上的受體蛋白質(zhì)），幾乎都是通過胞吞方式進(jìn)入溶酶體，在溶酶體中徹底降解。? 已確定病因的溶酶體儲(chǔ)積病有：? Hurler綜合癥：降解黏多糖的αL艾杜糖苷酸酶缺乏病。? 重要特征：具有分子伴侶的功能和ATP酶的活性，通過ATP的降解，提供使蛋白質(zhì)去折疊所需的能量。細(xì)胞器中蛋白質(zhì)的降解? 細(xì)胞器中的蛋白酶? 無(wú)蛋白酶細(xì)胞器中蛋白質(zhì)的降解 細(xì)胞器中的蛋白酶? 線粒體基質(zhì)存在著幾種依賴ATP的蛋白酶，如PIN1是酵母成活和線粒體生物發(fā)生所必需的蛋白質(zhì)；線粒體內(nèi)膜上另有兩種蛋白酶。? 折疊發(fā)生嚴(yán)重錯(cuò)誤的肽鏈，無(wú)法進(jìn)入高爾基體，被遣送回細(xì)胞質(zhì)并降解。– 第一大類：以S、T和C為活性中心的肽酶，結(jié)構(gòu)相似，催化機(jī)制與蛋白質(zhì)的親核攻擊有關(guān)。? 種類：內(nèi)肽酶（組織蛋白酶L、S），外肽酶（組織蛋白酶H是氨肽酶，組織蛋白酶B是二肽羧肽酶）；新發(fā)現(xiàn)酶（組織蛋白酶K、C、W和Z）。? 原肽具有自身折疊過程。? 蛋白酶體是一個(gè)26S的顆粒，其中與蛋白質(zhì)降解有關(guān)的是600kD的20S復(fù)合物，是細(xì)胞的主要成分之一，約占細(xì)胞總蛋白質(zhì)的1％。? 調(diào)節(jié)亞基（分子量30kD）：具有一個(gè)鈣結(jié)合區(qū)，調(diào)節(jié)與膜蛋白的結(jié)合；含有Ⅴ和Ⅳ′結(jié)構(gòu)域，其中結(jié)構(gòu)域Ⅴ富含Gly（G），與膜磷脂作用，是激活催化亞基所必需。? 在果蠅、線蟲、血吸蟲和一些曲霉中也發(fā)現(xiàn)需鈣蛋白酶，與組織特異的需鈣蛋白酶相似，為單鏈的蛋白酶，即只有催化肽鏈，而無(wú)調(diào)節(jié)亞基。? 三邊帽蛋白酶的結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜而且特異，是一種寡聚蛋白，外形與蛋白酶體完全不同。胱天蛋白酶家族? 胱天蛋白酶家族是目前備受關(guān)注的蛋白酶，它們與程序性細(xì)胞死亡（programmed cell death，PCD）密切相關(guān)。它們各自有自己的名稱和系統(tǒng)的編號(hào)。蛋白酶抑制劑? 內(nèi)源蛋白酶抑制劑：機(jī)體內(nèi)存在的，調(diào)節(jié)自身體內(nèi)蛋白酶的活性。例如，大豆中分離得到的BowmanBirk抑制劑，僅有71個(gè)氨基酸殘基，具有抑制胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的2個(gè)抑制中心。? 需要考慮因素：一是靶酶容易接近；二是抑制劑對(duì)靶酶的抑制不可逆或可逆性很小，即抑制常數(shù)應(yīng)是1010mo1/L或更小。羅斯發(fā)現(xiàn)，并獲得2004年度諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。? 泛素激活酶和泛素結(jié)合酶? 泛素激活酶E1：? 細(xì)胞內(nèi)只有單一的E1基因，利用不同的轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)產(chǎn)生E1a和E1b，發(fā)揮不同的作用。環(huán)指（ring finger）結(jié)構(gòu)蛋白? 環(huán)指結(jié)構(gòu)：由8個(gè)保守半胱氨酸和組氨酸[CysX2CysX(939)CysX(13)HisX(23)CysX2CysX(448)CysX2Cys)]組成。– 類胰凝乳蛋白酶(Chymotrypticlike)活性：水解疏水性氨基酸羧基端肽鍵。? 蛋白水解功能分別由ββ2和β5上的3個(gè)催化亞基Y、Z和X承擔(dān)，即Y/βZ/β2 和X/β5上Thr的OH對(duì)底物進(jìn)行親核攻擊。? tmRNA能使熄火的核糖體重新工作。? 核因子κB抑制劑（IκB）的磷酸化和降解誘導(dǎo)NFκB 的活化。– S