蛋白質(zhì)化學(xué)8-蛋白質(zhì)的分子構(gòu)象-在線瀏覽
2025-02-24 07:56本頁面
【正文】 肽 鍵 peptide bond 蛋白質(zhì)中的二硫鍵 ? MW=5734； ? 由 A（ 21個 AA， 11種 ） ， B（ 30AA， 16種 ） 組成 ， 并通過 Cys連結(jié)兩對 SS； ? A鏈第 6和 11的 Cys通過 SS連接成鏈內(nèi)小環(huán)。所以，肽鍵具有部分雙鍵的性質(zhì)，不能自由旋轉(zhuǎn)。 肽單位的剛性平面結(jié)構(gòu) α C H R1 C O C H N H R2 C O α C H N H R3 C O α C H N H Rn C O α OH H2N Cα C NCα O H 1 在一個平面上 肽單位的剛性平面結(jié)構(gòu) CN Cα O H Cα H Cα CN O Cα 順式 反式 由于反式構(gòu)型的能量比順式的能量低，所以在蛋白質(zhì)中 (除含 Pro的肽外 )，多肽鏈大部分的肽單位都是反式的結(jié) 構(gòu)。 肽單位形成的二面角 影響二面角的因素 ? 在二肽單位中 ,Cα － N和 Cα － C的旋轉(zhuǎn)會受到 α 碳原子上 R側(cè)鏈的空間阻礙。 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu) ? 二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈借助于氫鍵沿一維方向排列成具有周期性的結(jié)構(gòu)的構(gòu)象，是多肽鏈局部的空間結(jié)構(gòu)（構(gòu)象），主要有 α－螺旋、 β－折疊、 β－轉(zhuǎn)角等幾種形式，它們是構(gòu)成蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的基本要素。 ? Aa側(cè)鏈向外，螺旋穩(wěn)定性靠氫鍵維系； ? Ф=57o。 O H ‖ │ C［ NHCαHRCO］ 3 N Aa1的酰胺基團(tuán)的 CO基與 Aa5酰胺基團(tuán)的 NH基形成 鏈內(nèi) 氫鍵。此螺旋比較穩(wěn)定。 β－折疊 ? 兩條或多條幾乎完全伸展的肽鏈通過鏈間的氫鍵交聯(lián)而形成的。 ? 反平行式比平行的 ?折疊更穩(wěn)定，因?yàn)樗纬傻臍滏I三個原子幾乎在一條直線上，此時氫鍵力量最強(qiáng)，所以反平行式的結(jié)構(gòu)更穩(wěn)定。 ?折疊 ?轉(zhuǎn)角 ? 由四個 Aa組成 。 無規(guī)則卷曲 沒有一定規(guī)律的松散結(jié)構(gòu) ， 通常 酶的活性中心 常處在 這一構(gòu)象區(qū)域里 。多數(shù)情況下只有非極性殘基側(cè)鏈參與這些相互作用 ,而親水側(cè)鏈多在分子的外表面。
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